More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5191 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5191  protein of unknown function DUF182  100 
 
 		 400 aa  823    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.337929 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  56.68 
 
 		 372 aa  420  1e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  52.27 
 
 		 379 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  42.29 
 
 		 389 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0103  Alanine dehydrogenase  34.48 
 
 		 385 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.529042 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  34.46 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2772  Alanine dehydrogenase  37.63 
 
 		 395 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0709  alanine dehydrogenase  36.54 
 
 		 332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116894 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2480  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  35.03 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4481  hypothetical protein  35.64 
 
 		 395 aa  194  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  34.11 
 
 		 382 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  30.1 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  31.52 
 
 		 372 aa  165  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  34.9 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1528  xanthine dehydrogenase  33.61 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.971858  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1010  hypothetical protein  29.16 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152847 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  31.75 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2711  hypothetical protein  31.2 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1834  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  32.23 
 
 		 330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.353011 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  32.12 
 
 		 374 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2513  hypothetical protein  30 
 
 		 348 aa  153  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  30.68 
 
 		 366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0280  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.79 
 
 		 347 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  33.43 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  30.46 
 
 		 357 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1806  hypothetical protein  28.37 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  30.52 
 
 		 323 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  31.52 
 
 		 381 aa  147  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  31.07 
 
 		 376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1261  Xanthine dehydrogenase  27.81 
 
 		 341 aa  145  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  29.97 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  29.86 
 
 		 368 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  30.12 
 
 		 342 aa  143  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  29.26 
 
 		 373 aa  142  9e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  33.14 
 
 		 388 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  29.44 
 
 		 385 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  29.87 
 
 		 369 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  26.92 
 
 		 390 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  27.89 
 
 		 372 aa  138  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2952  hypothetical protein  30.3 
 
 		 341 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  29.74 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  29.43 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  28.61 
 
 		 385 aa  136  7.000000000000001e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1316  hypothetical protein  31.32 
 
 		 346 aa  136  8e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.150193  hitchhiker  0.000189083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  26.74 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  27.27 
 
 		 386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  27.25 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  27.25 
 
 		 386 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  31.16 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0227  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  26.7 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1555  protein of unknown function DUF182  30.08 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.324004  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1494  hypothetical protein  31.25 
 
 		 337 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1627  protein of unknown function DUF182  30.86 
 
 		 338 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.745684  normal  0.0182333 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  27.76 
 
 		 370 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  27.33 
 
 		 318 aa  129  8.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2732  hypothetical protein  30.56 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  30.24 
 
 		 368 aa  129  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2749  hypothetical protein  30.86 
 
 		 338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2825  hypothetical protein  30.86 
 
 		 338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0580705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2226  hypothetical protein  29.03 
 
 		 349 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  27.32 
 
 		 397 aa  126  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  29.12 
 
 		 373 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  29.71 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0635  protein of unknown function DUF182  30.25 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0965219 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  29.19 
 
 		 363 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  27.75 
 
 		 398 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2427  hypothetical protein  30.95 
 
 		 338 aa  123  6e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0331  hypothetical protein  29.28 
 
 		 323 aa  123  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.348672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  27.41 
 
 		 389 aa  122  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  28.57 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3051  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.7 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2268  hypothetical protein  29.21 
 
 		 365 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.33229 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  29.89 
 
 		 331 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3546  xanthine dehydrogenase accessory factor  25.64 
 
 		 353 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.692521  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  28.65 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1412  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.141522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3436  hypothetical protein  30.86 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.413735 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  27.59 
 
 		 402 aa  116  8.999999999999998e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  29.4 
 
 		 389 aa  115  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  30.53 
 
 		 380 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  35.83 
 
 		 266 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  31.34 
 
 		 483 aa  114  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  34.26 
 
 		 244 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01057  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  27.03 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  32.81 
 
 		 248 aa  110  6e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  25.88 
 
 		 421 aa  109  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4168  hypothetical protein  27.52 
 
 		 326 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0530695  normal  0.0915222 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0029  hypothetical protein  29.32 
 
 		 278 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180579  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  27.12 
 
 		 433 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2647  hypothetical protein  35.58 
 
 		 281 aa  106  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.645074  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1005  hypothetical protein  26.76 
 
 		 351 aa  106  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  26.91 
 
 		 340 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  37.29 
 
 		 240 aa  103  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0315  xanthine dehydrogenase accessory factor  28.95 
 
 		 269 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  35.57 
 
 		 376 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  29.18 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  27.55 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1815  hypothetical protein  28.97 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1696  protein of unknown function DUF182  29.81 
 
 		 277 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  27.48 
 
 		 340 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>