More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5136 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2427  acriflavin resistance protein  38.64 
 
 		 1031 aa  717    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000387519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  61.48 
 
 		 1037 aa  1292    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1797  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 		 1031 aa  724    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0223723  hitchhiker  0.000000350495 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.4 
 
 		 1024 aa  773    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1705  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 		 1031 aa  724    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0236776  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1738  acriflavin resistance protein  40.29 
 
 		 1038 aa  703    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2000  acriflavin resistance protein  38.91 
 
 		 1024 aa  696    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.195138  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3926  AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.82 
 
 		 1029 aa  695    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.831264  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01735  RND family efflux transporter  40.53 
 
 		 1035 aa  731    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  38.05 
 
 		 1041 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1882  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.73 
 
 		 1031 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3484  AcrB/AcrD/AcrF family protein  37.77 
 
 		 1046 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0945  acriflavin resistance protein  35.15 
 
 		 1040 aa  638    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000402917 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  39.92 
 
 		 1038 aa  686    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1155  acriflavin resistance protein  37.95 
 
 		 1036 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00884759  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0365  acriflavin resistance protein  63.63 
 
 		 1037 aa  1327    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3171  acriflavin resistance protein  37.96 
 
 		 1047 aa  647    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0148776  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  37.36 
 
 		 1064 aa  699    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1366  acriflavin resistance protein  37.32 
 
 		 1035 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0602713  hitchhiker  0.00132005 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3207  acriflavin resistance protein  59.38 
 
 		 1037 aa  1204    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0543905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  54.44 
 
 		 1029 aa  1101    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2321  acriflavin resistance protein  38.9 
 
 		 1052 aa  658    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0273304 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2000  acriflavin resistance protein  36.96 
 
 		 1028 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2094  acriflavin resistance protein  36.22 
 
 		 1037 aa  650    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1968  acriflavin resistance protein  40.1 
 
 		 1025 aa  703    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.904496 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3736  acriflavin resistance protein  57.59 
 
 		 1036 aa  1134    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.504437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2940  acriflavin resistance protein  57.25 
 
 		 1032 aa  1163    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00284054  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  36.73 
 
 		 1036 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1200  acriflavin resistance protein  37.87 
 
 		 1047 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.994972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  37.44 
 
 		 1037 aa  661    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5577  acriflavin resistance protein  45.67 
 
 		 1037 aa  892    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.500475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5136  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1029 aa  2072    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1816  acriflavin resistance protein  39.59 
 
 		 1023 aa  714    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.742902  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2587  acriflavin resistance protein  38.96 
 
 		 1031 aa  727    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000412735  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  36.99 
 
 		 1051 aa  697    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1267  acriflavin resistance protein  37.51 
 
 		 1035 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368024  hitchhiker  0.0000615461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1738  acriflavin resistance protein  37.8 
 
 		 1031 aa  681    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0173564  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3170  acriflavin resistance protein  37.87 
 
 		 1047 aa  646    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130532  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1983  acriflavin resistance protein  38.48 
 
 		 1034 aa  707    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000463224  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2549  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 		 1031 aa  722    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0932297  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004021  RND multidrug efflux transporter  37.61 
 
 		 1037 aa  657    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0276647  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3361  acriflavin resistance protein  39.29 
 
 		 1048 aa  678    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629992 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3314  acriflavin resistance protein  38.06 
 
 		 1047 aa  648    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.378933 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  41.14 
 
 		 1036 aa  725    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  37.25 
 
 		 1040 aa  652    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  53.98 
 
 		 1026 aa  1088    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  56.55 
 
 		 1030 aa  1155    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2787  acriflavin resistance protein  37.48 
 
 		 1046 aa  640    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000304862  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  40.31 
 
 		 1068 aa  731    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1083  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1051 aa  641    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126768  normal  0.966269 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2337  acriflavin resistance protein  39.74 
 
 		 1031 aa  736    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120926  hitchhiker  0.000298899 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1149  acriflavin resistance protein  37.87 
 
 		 1051 aa  643    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.460529  normal  0.362909 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2409  acriflavin resistance protein  39.74 
 
 		 1031 aa  736    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.677885  normal  0.0307662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1187  acriflavin resistance protein  39.36 
 
 		 1036 aa  700    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359485  normal  0.0265423 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1029  acriflavin resistance protein  37.45 
 
 		 1034 aa  676    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.2741  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0267  acriflavin resistance protein  38.33 
 
 		 1040 aa  677    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.856769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3888  acriflavin resistance protein  39.73 
 
 		 1048 aa  741    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.471381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0175  acriflavin resistance protein  38.57 
 
 		 1046 aa  662    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  37.6 
 
 		 1022 aa  713    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2664  acriflavin resistance protein  38.86 
 
 		 1031 aa  723    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1083  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1051 aa  641    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1659  acriflavin resistance protein  39.64 
 
 		 1031 aa  737    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178159  normal  0.998047 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2180  acriflavin resistance protein  38.77 
 
 		 1030 aa  728    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000146343  normal  0.137669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1905  AcrB/AcrD/AcrF family protein  38.22 
 
 		 1034 aa  710    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.209576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3080  acriflavin resistance protein  38.85 
 
 		 1045 aa  648    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.907454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01921  acriflavin resistance protein  39.63 
 
 		 1041 aa  686    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.413816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1852  acriflavin resistance protein  39.26 
 
 		 1042 aa  724    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0174296  hitchhiker  0.000605557 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0786  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1015 aa  634  1e-180  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0757  hypothetical protein  35.94 
 
 		 1015 aa  635  1e-180  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1439  acriflavin resistance protein  36.66 
 
 		 1035 aa  633  1e-180  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.100841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1178  acriflavin resistance protein  37.41 
 
 		 1042 aa  633  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0473  acriflavin resistance protein  36.3 
 
 		 1033 aa  631  1e-179  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.239628  normal  0.228728 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2815  acriflavin resistance protein  35.1 
 
 		 1051 aa  632  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.874616  normal  0.995091 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2618  acriflavin resistance protein  37.1 
 
 		 1024 aa  624  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0519656  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1810  acriflavin resistance protein  35.18 
 
 		 1034 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2556  acriflavin resistance protein  34.81 
 
 		 1051 aa  622  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4296  acriflavin resistance protein  35.28 
 
 		 1034 aa  618  1e-175  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0155758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0063  acriflavin resistance protein  34.06 
 
 		 1033 aa  618  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2847  RND family multidrug efflux protein  36.02 
 
 		 1032 aa  618  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0707  acriflavin resistance protein  34.32 
 
 		 1025 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3838  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  35.69 
 
 		 1057 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2033  acriflavin resistance protein  34.33 
 
 		 1044 aa  608  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.37 
 
 		 1032 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3289  acriflavin resistance protein  33.33 
 
 		 1032 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00142508  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2371  acriflavin resistance protein  34.08 
 
 		 1035 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.916635  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1088  AcrB/AcrD/AcrF multidrug efflux protein  36.44 
 
 		 1029 aa  599  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  33.17 
 
 		 1037 aa  600  1e-170  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1234  RND efflux transporter  34.45 
 
 		 1019 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1193  acriflavin resistance plasma membrane protein  34.25 
 
 		 1019 aa  598  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2699  acriflavin resistance protein  35.24 
 
 		 1029 aa  598  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.984927  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2270  acriflavin resistance protein  34.23 
 
 		 1049 aa  595  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0446759  normal  0.133949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1581  acriflavin resistance protein  34.82 
 
 		 1026 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270184 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1515  acriflavin resistance protein  34.25 
 
 		 1038 aa  593  1e-168  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2796  acriflavin resistance protein  34.01 
 
 		 1040 aa  594  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1208  multidrug efflux protein  34.35 
 
 		 1017 aa  590  1e-167  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.584016  normal  0.669413 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1145  RND efflux transporter  33.72 
 
 		 1012 aa  591  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4493  multidrug efflux protein  34.42 
 
 		 1009 aa  591  1e-167  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0361963 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2283  acriflavin resistance protein  35.06 
 
 		 1031 aa  589  1e-166  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.212799 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2173  acriflavin resistance protein  35.85 
 
 		 1029 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.310659  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  33.11 
 
 		 1055 aa  589  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>