More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5107 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 673 aa  1388    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  52.66 
 
 		 704 aa  718    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  39.85 
 
 		 670 aa  484  1e-135  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  39.11 
 
 		 669 aa  434  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  39.41 
 
 		 694 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  39.65 
 
 		 537 aa  356  8.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  39.19 
 
 		 517 aa  348  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 525 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  36.49 
 
 		 510 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  31.68 
 
 		 630 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  32.24 
 
 		 620 aa  232  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  32.92 
 
 		 631 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  29.59 
 
 		 631 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.05 
 
 		 658 aa  202  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33.12 
 
 		 509 aa  201  3e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  27.39 
 
 		 640 aa  200  7.999999999999999e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  28.11 
 
 		 638 aa  189  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  29.34 
 
 		 641 aa  188  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  30.13 
 
 		 673 aa  187  8e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  26.56 
 
 		 656 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  24.56 
 
 		 712 aa  157  8e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  29.37 
 
 		 671 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  27 
 
 		 648 aa  153  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  37.89 
 
 		 427 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  37.96 
 
 		 432 aa  140  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  31.45 
 
 		 519 aa  140  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0416  outer membrane protein  39.13 
 
 		 1313 aa  135  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.541208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  35.96 
 
 		 412 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  28.45 
 
 		 645 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  24.6 
 
 		 653 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  25.72 
 
 		 626 aa  127  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  26.94 
 
 		 665 aa  125  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  29.1 
 
 		 679 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  26.61 
 
 		 648 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  25.05 
 
 		 903 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  24.75 
 
 		 656 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  46.15 
 
 		 424 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2674  OmpA/MotB domain protein  34.6 
 
 		 464 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  23.83 
 
 		 630 aa  115  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  25.4 
 
 		 668 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  46.72 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  26.44 
 
 		 660 aa  114  5e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  25.05 
 
 		 642 aa  114  8.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0644  OmpA/MotB domain protein  46.03 
 
 		 306 aa  113  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.927259  normal  0.0953573 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  24.11 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  26.9 
 
 		 677 aa  108  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  25.37 
 
 		 710 aa  107  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  23.93 
 
 		 643 aa  107  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  23.47 
 
 		 666 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2677  outer membrane protein  49.55 
 
 		 380 aa  106  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 		 1026 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  23.89 
 
 		 798 aa  97.1  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.73 
 
 		 319 aa  97.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_003910  CPS_4001  hypothetical protein  27.48 
 
 		 299 aa  95.1  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  30.81 
 
 		 241 aa  94.4  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  24.05 
 
 		 672 aa  94.4  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  32.43 
 
 		 316 aa  94  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  39.06 
 
 		 320 aa  94  9e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  42.99 
 
 		 321 aa  93.2  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0070  OmpA/MotB domain protein  45.98 
 
 		 458 aa  92  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  26.67 
 
 		 594 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  44.34 
 
 		 449 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  41.74 
 
 		 542 aa  90.5  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3164  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 486 aa  90.1  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4395  hypothetical protein  28.42 
 
 		 300 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.198402  normal  0.0643344 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  24.58 
 
 		 504 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 456 aa  88.6  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 374 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1035  OmpA/MotB domain protein  39.47 
 
 		 360 aa  88.6  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  40.87 
 
 		 543 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  36.57 
 
 		 537 aa  88.2  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  42.06 
 
 		 440 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.05 
 
 		 440 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  40.57 
 
 		 445 aa  87.8  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 		 169 aa  87  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  39.42 
 
 		 478 aa  86.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.36 
 
 		 623 aa  86.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 		 361 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  45.36 
 
 		 399 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  44.23 
 
 		 230 aa  86.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 544 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.95 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 		 175 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  37.9 
 
 		 326 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  39.81 
 
 		 331 aa  84.7  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0307  OmpA/MotB  34.78 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  36.27 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03402  predicted outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4928  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3650  OmpA/MotB domain-containing protein  38.18 
 
 		 222 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.57 
 
 		 707 aa  84.3  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  39.42 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>