More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5091 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 259 aa  531  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  61.72 
 
 		 257 aa  327  8e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  53.64 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  55.43 
 
 		 264 aa  280  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  53.67 
 
 		 261 aa  266  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  49.62 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  51.71 
 
 		 261 aa  258  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  46.18 
 
 		 258 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  49.43 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  41.67 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  42.44 
 
 		 268 aa  198  9e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  42.18 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  42.59 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  44.98 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  41.95 
 
 		 268 aa  188  7e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  41.42 
 
 		 264 aa  183  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  38.97 
 
 		 287 aa  178  9e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  40.15 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  38.71 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  36.33 
 
 		 277 aa  160  1e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 275 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  37.28 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 283 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  34.47 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  36.59 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  34.86 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  35.93 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  34.64 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  32.95 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1723  Diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 284 aa  142  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.714915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  32.28 
 
 		 277 aa  142  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  38.66 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  33.45 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  32.41 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  37.23 
 
 		 282 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  33.81 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  37.33 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  33.57 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  32.86 
 
 		 278 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  36.43 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 278 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 277 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 285 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  31.93 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 281 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  32 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  36.19 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34582  predicted protein  33.89 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  33.56 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  33.22 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2006  diaminopimelate epimerase  33.1 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  31.69 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 292 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  32.43 
 
 		 287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0392  diaminopimelate epimerase  32.38 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3633  diaminopimelate epimerase  32.38 
 
 		 275 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0391  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.749695 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  31.8 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  31.74 
 
 		 289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  39.52 
 
 		 273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  32.51 
 
 		 276 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  30.48 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4308  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  32.75 
 
 		 284 aa  132  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  29.86 
 
 		 284 aa  131  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  32.54 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  32.97 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3582  diaminopimelate epimerase  32.03 
 
 		 275 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.653633  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  31.03 
 
 		 279 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  39.06 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  31.4 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  32.64 
 
 		 281 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0323  diaminopimelate epimerase  31.69 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  31.76 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  34.04 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  32.2 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  34.88 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  31.4 
 
 		 387 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  31.45 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  32.62 
 
 		 277 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  31.69 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0077  diaminopimelate epimerase  30.04 
 
 		 276 aa  128  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  32.4 
 
 		 284 aa  129  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  32.53 
 
 		 308 aa  128  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  30.8 
 
 		 279 aa  128  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4089  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0401553 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3995  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3896  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0191841 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3973  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 275 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  30.69 
 
 		 288 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  32.4 
 
 		 284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  33.22 
 
 		 407 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  33.33 
 
 		 289 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>