More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5074 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5074  Patatin  100 
 
 
332 aa  681    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3007  Patatin  53.4 
 
 
331 aa  356  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1410  hypothetical protein  27.12 
 
 
270 aa  94.7  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0386  patatin  26.38 
 
 
387 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3896  patatin  26.54 
 
 
379 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1354  patatin  27.55 
 
 
386 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.408821  normal  0.0141237 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8092  Patatin  27.8 
 
 
382 aa  89  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  26.23 
 
 
399 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1856  patatin  27.17 
 
 
400 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.62 
 
 
763 aa  87.4  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  28.02 
 
 
379 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8389  Patatin  30.22 
 
 
399 aa  87  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0196  patatin  28.35 
 
 
429 aa  86.7  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2410  Patatin  27.52 
 
 
423 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.648582  normal  0.741283 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  25.86 
 
 
379 aa  85.9  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4147  Patatin  25.77 
 
 
387 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.649145  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1409  hypothetical protein  27.15 
 
 
282 aa  85.1  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  25.86 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0221  hypothetical protein  30.65 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5565  patatin  26.2 
 
 
427 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0074  Patatin  26.23 
 
 
283 aa  84.3  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0014  hypothetical protein  25.7 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0014  hypothetical protein  25.7 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0065  Patatin  30.85 
 
 
306 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0073  Patatin  31 
 
 
306 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.568339 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5528  patatin  27.06 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.510398  hitchhiker  0.00846558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4153  Patatin  29.77 
 
 
277 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0279461  normal  0.153113 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1392  patatin  28.21 
 
 
379 aa  82.8  0.000000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0427105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  25.51 
 
 
378 aa  81.6  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2310  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  24.7 
 
 
757 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0721  patatin  28.52 
 
 
384 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1182  Patatin  27.53 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.41454  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3204  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  24.13 
 
 
757 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3076  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  23.43 
 
 
757 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1333  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.43 
 
 
757 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2023  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.43 
 
 
757 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2313  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.43 
 
 
757 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1046  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.43 
 
 
757 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5145  Patatin  26.8 
 
 
294 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.270207  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1418  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  23.43 
 
 
757 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.767382  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4579  patatin  28.94 
 
 
291 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1865  patatin  26.88 
 
 
387 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1286  patatin  26.2 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22400  Patatin  27.67 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4898  putative patatin-like phospholipase  25.96 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0432192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5327  patatin  23.7 
 
 
418 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0286703 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4913  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.05 
 
 
765 aa  76.6  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2824  Patatin  28.72 
 
 
357 aa  76.3  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.701199  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1328  patatin  25.37 
 
 
382 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0937  patatin  26.64 
 
 
385 aa  75.9  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4457  patatin  24.26 
 
 
312 aa  75.9  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3983  patatin  25.37 
 
 
382 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251538  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0151  patatin  25.97 
 
 
442 aa  75.9  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1736  patatin  25.37 
 
 
382 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3155  hypothetical protein  23.1 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1886  patatin  27.6 
 
 
346 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0279531  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5937  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.93 
 
 
777 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  23.81 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1394  Patatin  27.27 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  hitchhiker  0.00234319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0299  hypothetical protein  24.13 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2865  patatin  25.66 
 
 
374 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.906951  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5833  patatin  29.02 
 
 
349 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.200172  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2490  Patatin  27.27 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3078  Patatin  29 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2519  patatin  23.62 
 
 
374 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256378  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  24.32 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  24.32 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  24.32 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  24.32 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  24.32 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  24.32 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  23.99 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  24.32 
 
 
284 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2564  patatin  23.77 
 
 
357 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.30938  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1344  patatin  23.1 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0143871 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1409  patatin  23.1 
 
 
374 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0513  Patatin  25.76 
 
 
289 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000855028  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5616  patatin  28.63 
 
 
349 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.196838  normal  0.302344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4797  patatin  27.2 
 
 
389 aa  72.8  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4645  patatin  30.17 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1500  Patatin  25.08 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000109081  normal  0.428917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2876  patatin  25.08 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000103139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5960  Patatin  28.51 
 
 
421 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2859  patatin  25.08 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000023249  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3005  patatin  25.08 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000873649  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2766  patatin  27.53 
 
 
352 aa  72.4  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104488 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1682  Patatin  28.57 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.776672  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6724  patatin  27.87 
 
 
349 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  25.42 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  23.97 
 
 
284 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1397  patatin  22.77 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0173142  normal  0.188155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5313  patatin  25.26 
 
 
405 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  28.5 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  26.24 
 
 
283 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0455  patatin  23.66 
 
 
323 aa  70.9  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1160  hypothetical protein  24.04 
 
 
374 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2756  patatin  24.28 
 
 
377 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2133  patatin  24.8 
 
 
410 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4527  patatin  25.77 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0502566  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5712  patatin  25.77 
 
 
405 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.25761  normal  0.0781089 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>