More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5067 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5067  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 212 aa  435  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.533186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3014  beta-lactamase domain protein  53.33 
 
 		 213 aa  237  8e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  50.47 
 
 		 212 aa  228  4e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3235  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 213 aa  227  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  50.94 
 
 		 212 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0630  hypothetical protein  43.6 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  41.71 
 
 		 214 aa  174  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0243  beta-lactamase domain protein  41.9 
 
 		 215 aa  170  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  40.48 
 
 		 214 aa  169  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  40.58 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  38.94 
 
 		 207 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  40.57 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3268  Beta-lactamase-like  40.39 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3433  beta-lactamase-like protein  41.38 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3014  beta-lactamase domain protein  38.97 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.309827  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  38.42 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  37.93 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  40.1 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4317  putative metallo-beta-lactamase family protein  38.39 
 
 		 214 aa  148  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  36.49 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  37.93 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  40.1 
 
 		 209 aa  148  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  37.93 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  37.93 
 
 		 215 aa  147  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  41.06 
 
 		 209 aa  147  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.58 
 
 		 209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  38.54 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  38.54 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0194  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.113604  hitchhiker  0.00000000306881 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  38.54 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  36.49 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  39.61 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0044  metallo-beta-lactamase superfamily protein  38.39 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  40.58 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3388  Beta-lactamase-like  37.44 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  40.58 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  35.89 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3151  metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  39.23 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  38.28 
 
 		 209 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0267  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.497778 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3822  metallo-beta-lactamase family protein  38.39 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2969  metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2909  metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.457315  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  37.44 
 
 		 215 aa  145  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3400  metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00696268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1632  metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2821  beta-lactamase-like  36.97 
 
 		 237 aa  145  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.97926  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3903  metallo-beta-lactamase family protein  37.91 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0285  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394027  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  40.1 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  40.1 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  38.57 
 
 		 206 aa  145  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.39 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0402  beta-lactamase domain protein  37.44 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 		 212 aa  144  9e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  37.14 
 
 		 211 aa  143  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  35.81 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  37.98 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  39.11 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  37.38 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  35.1 
 
 		 209 aa  142  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  37.81 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  36.49 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  36.27 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  36.97 
 
 		 218 aa  142  5e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  35.71 
 
 		 303 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2753  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  36.95 
 
 		 210 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  39.41 
 
 		 215 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0120  beta-lactamase domain-containing protein  36.97 
 
 		 214 aa  141  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3016  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 		 209 aa  141  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  36.59 
 
 		 214 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.97 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4704  Beta-lactamase-like  37.8 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551492 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  33.65 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  36.1 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  35.07 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0890  glyoxylase II family protein  36.79 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  36.1 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.99 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  39.05 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0841  Beta-lactamase-like  37.07 
 
 		 213 aa  137  8.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0225813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3138  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3268  hypothetical protein  34.29 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  36.84 
 
 		 215 aa  136  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  37.13 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>