More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5029 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  44.84 
 
 
850 aa  668    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  49.73 
 
 
786 aa  762    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  47.7 
 
 
854 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
765 aa  1593    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  73.9 
 
 
767 aa  1192    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  50.42 
 
 
762 aa  720    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  44.53 
 
 
743 aa  641    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  49.86 
 
 
759 aa  713    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  62.1 
 
 
785 aa  986    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  44.31 
 
 
815 aa  631  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  44.34 
 
 
768 aa  615  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  44.58 
 
 
772 aa  606  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  42.33 
 
 
773 aa  565  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  41.9 
 
 
740 aa  556  1e-157  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  40.49 
 
 
794 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  40.16 
 
 
786 aa  519  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  39.68 
 
 
783 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  38.01 
 
 
776 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  38.29 
 
 
730 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.18 
 
 
752 aa  434  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  37.71 
 
 
760 aa  436  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  36.78 
 
 
774 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  37.5 
 
 
755 aa  429  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  37.57 
 
 
907 aa  426  1e-118  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  38.1 
 
 
762 aa  421  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.97 
 
 
841 aa  419  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.32 
 
 
750 aa  417  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  37.37 
 
 
826 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  34.86 
 
 
810 aa  406  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 
850 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  34.38 
 
 
862 aa  403  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  36.15 
 
 
838 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
801 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 
857 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 
857 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.59 
 
 
834 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 
858 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  35.99 
 
 
821 aa  399  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 
857 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  35.25 
 
 
870 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  36.3 
 
 
787 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  36.03 
 
 
839 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 
846 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  36.03 
 
 
928 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 
888 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  36.03 
 
 
844 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  36.03 
 
 
839 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  36.03 
 
 
844 aa  386  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.57 
 
 
846 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  36.03 
 
 
844 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  36.03 
 
 
844 aa  386  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  35.17 
 
 
846 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  35.53 
 
 
787 aa  377  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  34.82 
 
 
742 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 
743 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  34.96 
 
 
743 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 
743 aa  363  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  33.78 
 
 
728 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 
732 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  34.39 
 
 
698 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  33.71 
 
 
675 aa  351  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
678 aa  329  9e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  32.33 
 
 
686 aa  315  1.9999999999999998e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.14 
 
 
795 aa  315  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  29.99 
 
 
830 aa  308  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  29.27 
 
 
748 aa  304  4.0000000000000003e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  28.8 
 
 
815 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  28.91 
 
 
818 aa  300  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  29.06 
 
 
817 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  29.19 
 
 
817 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  29.19 
 
 
817 aa  298  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  30.87 
 
 
797 aa  297  4e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.75 
 
 
794 aa  294  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  28.37 
 
 
794 aa  293  6e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  28.24 
 
 
814 aa  293  6e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  28.43 
 
 
823 aa  293  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  28.3 
 
 
814 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  28.52 
 
 
843 aa  291  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  28.91 
 
 
817 aa  292  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  28.27 
 
 
796 aa  291  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  29.35 
 
 
831 aa  291  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  28.3 
 
 
823 aa  291  4e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  28.29 
 
 
844 aa  290  7e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  28.29 
 
 
844 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  29.03 
 
 
830 aa  289  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  28.29 
 
 
844 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  28.3 
 
 
841 aa  289  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  28.74 
 
 
833 aa  288  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  27.35 
 
 
835 aa  286  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  29.13 
 
 
829 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  29.61 
 
 
819 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  27.59 
 
 
839 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  27.54 
 
 
803 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  28.61 
 
 
822 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  28.89 
 
 
802 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  28.19 
 
 
779 aa  282  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  29.13 
 
 
835 aa  282  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.57 
 
 
827 aa  281  4e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  28.63 
 
 
794 aa  280  5e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  27.78 
 
 
839 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>