More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4910 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  100 
 
 
738 aa  1509    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  54.98 
 
 
716 aa  856    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  63.13 
 
 
721 aa  968    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  40 
 
 
727 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  39.67 
 
 
738 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  40.5 
 
 
727 aa  557  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  38.92 
 
 
734 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  38.92 
 
 
734 aa  547  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  36.81 
 
 
739 aa  506  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  35.96 
 
 
760 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0719  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.98 
 
 
717 aa  457  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00348631  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  34.88 
 
 
1040 aa  439  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  35.01 
 
 
1019 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  34.73 
 
 
1038 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  34.59 
 
 
1038 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  32.97 
 
 
759 aa  421  1e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  33.75 
 
 
747 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  34.4 
 
 
1018 aa  419  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  33.42 
 
 
1018 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  35.94 
 
 
906 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  35.8 
 
 
906 aa  417  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  34.4 
 
 
1018 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  34.81 
 
 
721 aa  416  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  34.26 
 
 
716 aa  412  1e-113  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  36.2 
 
 
908 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  35.12 
 
 
1013 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  34.88 
 
 
908 aa  405  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  33.61 
 
 
1011 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  31.62 
 
 
722 aa  389  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1097  bacteriocin-processing peptidase  31.99 
 
 
1042 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.610594  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.81 
 
 
1000 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0558  ABC transporter related  32.83 
 
 
725 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  33.33 
 
 
722 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  34.12 
 
 
716 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  30.89 
 
 
715 aa  362  2e-98  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1296  ABC transporter related  33.2 
 
 
730 aa  358  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  32.14 
 
 
1003 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  31.24 
 
 
736 aa  353  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4927  toxin secretion ABC transporter protein  30.82 
 
 
731 aa  352  1e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1837  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.5 
 
 
1001 aa  352  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.548602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1659  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.81 
 
 
1013 aa  349  1e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000123584  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  32.5 
 
 
715 aa  349  1e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4225  Type I secretion system ATPase, HlyB  28.91 
 
 
865 aa  347  5e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2316  type I secretion system ATPase  29.75 
 
 
724 aa  347  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2693  type I secretion system ATPase  29.75 
 
 
724 aa  347  5e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3578  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  29.78 
 
 
1024 aa  347  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0545  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.36 
 
 
1008 aa  346  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.782135  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0528  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.36 
 
 
1008 aa  346  8e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  32.15 
 
 
714 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  31.87 
 
 
741 aa  345  2e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  30.94 
 
 
700 aa  345  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  30.74 
 
 
968 aa  345  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1455  cyclic nucleotide-binding protein  28.51 
 
 
892 aa  342  2e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2576  type I secretion system ATPase  30.3 
 
 
750 aa  341  2e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00352017 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1224  ATPase  31.82 
 
 
980 aa  341  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.25476  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4165  type I secretion system ATPase  30.96 
 
 
726 aa  341  2.9999999999999998e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.143199  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  41.49 
 
 
455 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  30.7 
 
 
720 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  31.21 
 
 
722 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01291  hypothetical protein  30.72 
 
 
986 aa  337  5e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.838373 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21011  ATPase  30.18 
 
 
930 aa  336  7.999999999999999e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.625289 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1843  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  30.37 
 
 
1012 aa  336  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00224426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5423  toxin secretion ABC transporter (ATP-binding and membrane protein)  31.25 
 
 
705 aa  336  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.192107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0635  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.98 
 
 
1016 aa  335  1e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000920365  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2527  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.33 
 
 
976 aa  335  2e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.76843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  30.06 
 
 
738 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1869  ABC transporter related  31.34 
 
 
726 aa  334  3e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  33.04 
 
 
971 aa  333  5e-90  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0019  type I secretion system ATPase family protein  31.42 
 
 
706 aa  333  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0292  cyclolysin-type secretion composite ATP-binding transmembrane ABC transporter protein  32.12 
 
 
725 aa  331  4e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0404575 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  32.48 
 
 
735 aa  330  5.0000000000000004e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00861  ABC transporter, multi drug efflux family protein  34.04 
 
 
975 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.02392 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1352  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31 
 
 
999 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.897617  normal  0.235 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  30.47 
 
 
731 aa  326  9e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5157  type I secretion system ATPase  30.68 
 
 
728 aa  326  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.819615 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0117  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  30.48 
 
 
1006 aa  326  1e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.152098  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5003  type I secretion system ATPase  30.63 
 
 
728 aa  325  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19193  normal  0.91049 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2998  type I secretion system ATPase  31.7 
 
 
753 aa  325  2e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  31.97 
 
 
726 aa  324  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5329  ABC transporter related  29.88 
 
 
735 aa  323  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.580332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  29.25 
 
 
737 aa  323  9.000000000000001e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1182  ATPase  32.81 
 
 
982 aa  322  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1446  leukotoxin translocation ATP-binding protein LktB  34.62 
 
 
699 aa  318  2e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0404979  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  29.94 
 
 
739 aa  317  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  31.87 
 
 
728 aa  316  8e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  29.8 
 
 
741 aa  316  9e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  30.44 
 
 
733 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  30.65 
 
 
695 aa  312  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2369  type I secretion system ATPase  30.38 
 
 
743 aa  312  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0890  ABC transporter related protein  30.01 
 
 
771 aa  311  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6211  ABC transporter related  29.68 
 
 
714 aa  310  6.999999999999999e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.16806 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6407  ABC transporter related  29.4 
 
 
714 aa  310  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  30.73 
 
 
721 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  41.38 
 
 
521 aa  308  3e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1499  type I secretion system ATPase  32.15 
 
 
720 aa  308  3e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3807  ABC transporter related  28.45 
 
 
726 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0349479 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6772  type I secretion system ATPase  31.07 
 
 
712 aa  306  7e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  29.53 
 
 
743 aa  306  7e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3626  colicin V processing peptidase  30.32 
 
 
772 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.689244  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3619  putative toxin secretion ABC transporter, ATP-binding protein  30.65 
 
 
753 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>