267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4811 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  100 
 
 
183 aa  382  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  50.62 
 
 
163 aa  177  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1569  dihydrofolate reductase  49.06 
 
 
161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.210391  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04648  dihydrofolate reductase  45.73 
 
 
164 aa  159  2e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20271  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  46.75 
 
 
179 aa  158  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 
174 aa  157  6e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  49.08 
 
 
161 aa  157  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2886  Dihydrofolate reductase  48.45 
 
 
166 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0664  Dihydrofolate reductase  46.63 
 
 
163 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.618324  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 
172 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13348  dihydrofolate reductase  50.31 
 
 
160 aa  155  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.704546  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2659  dihydrofolate reductase  48.73 
 
 
166 aa  155  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.691401 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 
171 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  43.79 
 
 
172 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2781  Dihydrofolate reductase  47.5 
 
 
166 aa  154  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.258533 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1448  dihydrofolate reductase  43.35 
 
 
188 aa  154  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
167 aa  154  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  46.91 
 
 
162 aa  153  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  44.59 
 
 
164 aa  152  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  43.03 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  48.17 
 
 
169 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  43.79 
 
 
172 aa  151  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1855  Dihydrofolate reductase  48.43 
 
 
171 aa  149  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.513687  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  46.24 
 
 
179 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  44.51 
 
 
160 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
160 aa  148  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
160 aa  148  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0899  Dihydrofolate reductase  46.58 
 
 
177 aa  147  6e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0096  Dihydrofolate reductase  44.79 
 
 
161 aa  147  8e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0487  Dihydrofolate reductase  50 
 
 
164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0380  dihydrofolate reductase  44.58 
 
 
162 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0573  dihydrofolate reductase  45.61 
 
 
175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
160 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0235  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  45.12 
 
 
160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
160 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2819  dihydrofolate reductase  43.79 
 
 
173 aa  144  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.198345  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  47.85 
 
 
163 aa  144  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1503  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
166 aa  144  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  39.43 
 
 
178 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  41.57 
 
 
178 aa  143  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
160 aa  143  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4006  Dihydrofolate reductase  46.2 
 
 
180 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.813687  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 
160 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  42.01 
 
 
176 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  41.71 
 
 
195 aa  143  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
160 aa  142  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  44.65 
 
 
163 aa  142  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
160 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
160 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
167 aa  142  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
167 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
167 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
160 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
167 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
167 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
167 aa  142  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03728  dihydrofolate reductase type I, trimethoprim resistance  46.58 
 
 
167 aa  141  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.794995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2019  dihydrofolate reductase  42.77 
 
 
187 aa  141  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  42.59 
 
 
166 aa  141  6e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2922  dihydrofolate reductase  46.94 
 
 
160 aa  140  7e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000038363  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  43.48 
 
 
166 aa  140  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
167 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  42.68 
 
 
160 aa  140  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 
167 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  43.9 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 
171 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0300  hypothetical protein  44.38 
 
 
164 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.201622 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2858  dihydrofolate reductase  44.72 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000404405  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4526  dihydrofolate reductase  44.3 
 
 
166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85477  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  44.23 
 
 
183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0386  Dihydrofolate reductase  45.34 
 
 
162 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0958  dihydrofolate reductase  40.57 
 
 
195 aa  139  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  43.64 
 
 
171 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  44.87 
 
 
163 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  40.51 
 
 
167 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  42.86 
 
 
160 aa  138  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 
160 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  41.61 
 
 
162 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  40.12 
 
 
166 aa  137  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0962  dihydrofolate reductase  42.94 
 
 
166 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.505116  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  42.33 
 
 
169 aa  137  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  41.62 
 
 
209 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
166 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00805  hypothetical protein  43.95 
 
 
159 aa  136  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  47.71 
 
 
161 aa  136  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  40.37 
 
 
219 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  41.18 
 
 
170 aa  135  2e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0914  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 
167 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1058  dihydrofolate reductase  39.39 
 
 
167 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3104  dihydrofolate reductase  44.6 
 
 
162 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.172131  hitchhiker  0.0000000000100648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  39.88 
 
 
162 aa  135  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
166 aa  134  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 
161 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  42.41 
 
 
161 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0443  dihydrofolate reductase  44.22 
 
 
168 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4505  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 
170 aa  134  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  41.72 
 
 
171 aa  134  8e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  40.49 
 
 
162 aa  134  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  37.34 
 
 
167 aa  134  9e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>