113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4621 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4621  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
188 aa  386  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5396  protein of unknown function DUF820  38.51 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5071  protein of unknown function DUF820  35.29 
 
 
190 aa  122  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1609  protein of unknown function DUF820  27.94 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3414  protein of unknown function DUF820  28.22 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2373  protein of unknown function DUF820  24.39 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0747431  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1703  hypothetical protein  32.38 
 
 
184 aa  61.6  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2428  protein of unknown function DUF820  34.62 
 
 
192 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1412  hypothetical protein  30.77 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359049 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0734  protein of unknown function DUF820  26.67 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.188938  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1702  hypothetical protein  32.38 
 
 
184 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0749103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1209  protein of unknown function DUF820  35.05 
 
 
195 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2702  protein of unknown function DUF820  27.61 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.993643  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1413  hypothetical protein  29.51 
 
 
184 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00371058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2170  protein of unknown function DUF820  33.65 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.102631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2598  protein of unknown function DUF820  28.43 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.855565  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1833  hypothetical protein  20.38 
 
 
185 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2174  protein of unknown function DUF820  27.22 
 
 
181 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0729554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2896  protein of unknown function DUF820  25.58 
 
 
193 aa  58.2  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.627457  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0999  protein of unknown function DUF820  32.99 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3655  protein of unknown function DUF820  24.6 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1321  protein of unknown function DUF820  25.32 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2815  protein of unknown function DUF820  29.7 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1350  protein of unknown function DUF820  25.32 
 
 
178 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.946881  hitchhiker  0.0000000359977 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3284  protein of unknown function DUF820  29.7 
 
 
189 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000638939  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0100  hypothetical protein  31.68 
 
 
194 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637727  normal  0.188122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1440  protein of unknown function DUF820  24 
 
 
208 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0017  protein of unknown function DUF820  24.53 
 
 
180 aa  55.5  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2023  protein of unknown function DUF820  24.76 
 
 
192 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2049  protein of unknown function DUF820  24.76 
 
 
192 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4062  hypothetical protein  25.34 
 
 
178 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.654583  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0267  protein of unknown function DUF820  27.88 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2387  protein of unknown function DUF820  31.37 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0267  protein of unknown function DUF820  28.95 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2438  protein of unknown function DUF820  31.37 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.873691  normal  0.192917 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1895  protein of unknown function DUF820  29.9 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0713  protein of unknown function DUF820  29.52 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.277122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3972  protein of unknown function DUF820  26.57 
 
 
192 aa  52.4  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1028  protein of unknown function DUF820  29.9 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030096 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1919  protein of unknown function DUF820  29.9 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00741747  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2128  hypothetical protein  28.85 
 
 
192 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0102  hypothetical protein  25.95 
 
 
187 aa  51.6  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5097  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
193 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1466  hypothetical protein  26.52 
 
 
188 aa  51.2  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0533838 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0553  hypothetical protein  25.47 
 
 
213 aa  51.2  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3416  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
190 aa  51.2  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2505  hypothetical protein  31.17 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2017  protein of unknown function DUF820  27.84 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0724  protein of unknown function DUF820  21.82 
 
 
187 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2042  protein of unknown function DUF820  27.84 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000371183  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2463  protein of unknown function DUF820  27.36 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0607621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4387  hypothetical protein  31.73 
 
 
200 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  27.35 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2366  protein of unknown function DUF820  26.42 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1790  hypothetical protein  25 
 
 
192 aa  49.3  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2465  protein of unknown function DUF820  32.67 
 
 
190 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3227  protein of unknown function DUF820  28.3 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5150  protein of unknown function DUF820  32.88 
 
 
194 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1489  protein of unknown function DUF820  30.41 
 
 
203 aa  48.5  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2987  protein of unknown function DUF820  22.99 
 
 
182 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.156144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3010  protein of unknown function DUF820  24.74 
 
 
191 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3494  protein of unknown function DUF820  26.58 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4506  protein of unknown function DUF820  26.47 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.289489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4918  protein of unknown function DUF820  27.2 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.417991 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1357  hypothetical protein  27.93 
 
 
204 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000002681  normal  0.0119499 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3996  hypothetical protein  29.79 
 
 
186 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1493  protein of unknown function DUF820  28.87 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000252154 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2886  protein of unknown function DUF820  25.64 
 
 
184 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.491355 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3644  protein of unknown function DUF820  31.68 
 
 
190 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.514853  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3926  hypothetical protein  22.58 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.746975  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3061  protein of unknown function DUF820  23.78 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000687112  decreased coverage  0.000000069205 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3458  hypothetical protein  29.08 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0111361 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1761  protein of unknown function DUF820  24.07 
 
 
194 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1789  protein of unknown function DUF820  24.07 
 
 
194 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0815635  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  28.46 
 
 
206 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  31.09 
 
 
203 aa  45.4  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2406  protein of unknown function DUF820  24.53 
 
 
185 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0891  protein of unknown function DUF820  32.88 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0761  hypothetical protein  19.79 
 
 
189 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.450507  normal  0.591699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0963  protein of unknown function DUF820  30.14 
 
 
196 aa  45.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000104175  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0952  protein of unknown function DUF820  26.09 
 
 
184 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.472157  normal  0.397022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3323  protein of unknown function DUF820  25.74 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2794  protein of unknown function DUF820  25.74 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274491  normal  0.405143 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5248  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.73684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3948  hypothetical protein  28.57 
 
 
204 aa  43.9  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0198383 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2037  hypothetical protein  23.88 
 
 
253 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000309479  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1857  hypothetical protein  22.5 
 
 
202 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39074 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0076  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0594  protein of unknown function DUF820  22.16 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1255  protein of unknown function DUF820  29.29 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0074  protein of unknown function DUF820  26.4 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.716542 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0609  protein of unknown function DUF820  22.16 
 
 
191 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.214979  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1268  protein of unknown function DUF820  22.7 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  hitchhiker  0.00936719 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3217  protein of unknown function DUF820  22.63 
 
 
187 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4400  protein of unknown function DUF820  24.49 
 
 
187 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000243926 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1714  protein of unknown function DUF820  27.59 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000557218  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2054  hypothetical protein  26.81 
 
 
203 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.266115 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1238  protein of unknown function DUF820  22.7 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2879  protein of unknown function DUF820  24.76 
 
 
187 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2009  DNA binding domain protein, excisionase family  22.76 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0310521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>