More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4608 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02385  Prolyl endopeptidase  49.16 
 
 
719 aa  669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4948  prolyl oligopeptidase  50.73 
 
 
689 aa  679    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0086  prolyl endopeptidase  49.72 
 
 
723 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6402  Prolyl oligopeptidase  47.4 
 
 
745 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0462  prolyl oligopeptidase  50.58 
 
 
689 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.14887 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05093  protease  48.9 
 
 
679 aa  658    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4608  Prolyl oligopeptidase  100 
 
 
703 aa  1451    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.638407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5257  Prolyl oligopeptidase  71.16 
 
 
701 aa  1000    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1313  prolyl oligopeptidase  49.72 
 
 
700 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.437162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2782  prolyl oligopeptidase  50.93 
 
 
724 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.119974  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001383  prolyl endopeptidase  52.04 
 
 
719 aa  693    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3157  prolyl oligopeptidase  47.62 
 
 
703 aa  654    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.385606  hitchhiker  0.000562539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001226  serine protease of the peptidase family S9A  50 
 
 
677 aa  671    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4245  Prolyl oligopeptidase  49.34 
 
 
688 aa  670    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3925  Prolyl oligopeptidase  51.09 
 
 
695 aa  687    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.999576  normal  0.0353969 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0746  Prolyl oligopeptidase  50.15 
 
 
688 aa  689    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06386  peptidase  50.72 
 
 
730 aa  682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2458  Prolyl oligopeptidase  51.71 
 
 
713 aa  710    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.768929  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4307  Prolyl oligopeptidase  49.34 
 
 
688 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  0.0613524 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2893  Prolyl oligopeptidase  49.56 
 
 
682 aa  646    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2323  Prolyl oligopeptidase  54.68 
 
 
685 aa  756    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0810  peptidase S9A prolyl oligopeptidase domain protein beta-propeller  49.64 
 
 
708 aa  686    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0382  Prolyl oligopeptidase  47.66 
 
 
685 aa  622  1e-177  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.450015  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1195  prolyl endopeptidase  46.46 
 
 
685 aa  617  1e-175  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00494828  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2753  prolyl endopeptidase  43.92 
 
 
727 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1602  prolyl oligopeptidase  44.99 
 
 
729 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000159045  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2543  Prolyl oligopeptidase  44.8 
 
 
727 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000249468  hitchhiker  0.000000327157 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2091  prolyl oligopeptidase  45 
 
 
718 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000105582  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1737  prolyl oligopeptidase  44.65 
 
 
727 aa  601  1e-170  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000036721  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2373  prolyl oligopeptidase  44.77 
 
 
727 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000160004  normal  0.331023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2445  prolyl oligopeptidase  43.78 
 
 
727 aa  600  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000119752  normal  0.316847 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1780  prolyl oligopeptidase  44.51 
 
 
727 aa  599  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000219198  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1741  prolyl oligopeptidase  44.65 
 
 
727 aa  602  1e-170  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000789532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2736  prolyl oligopeptidase  45.66 
 
 
714 aa  596  1e-169  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.304191  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2536  prolyl oligopeptidase  43.42 
 
 
726 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000370848  normal  0.321881 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2569  prolyl oligopeptidase  45.21 
 
 
718 aa  597  1e-169  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000045371  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1852  prolyl oligopeptidase  46.5 
 
 
718 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0419328  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1522  prolyl oligopeptidase  44.78 
 
 
696 aa  585  1e-166  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.2073  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1978  prolyl oligopeptidase  45.68 
 
 
719 aa  579  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.370537 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1324  prolyl oligopeptidase  43.53 
 
 
710 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.198944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01001  Prolyl endopeptidase  43.72 
 
 
719 aa  564  1.0000000000000001e-159  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2524  prolyl oligopeptidase  42.26 
 
 
714 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.260792  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2525  prolyl oligopeptidase  44.19 
 
 
711 aa  534  1e-150  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.440403  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1967  Prolyl oligopeptidase  40.06 
 
 
670 aa  523  1e-147  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00433613  normal  0.203518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0615  prolyl oligopeptidase  39.06 
 
 
719 aa  477  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0129  Prolyl oligopeptidase  38.57 
 
 
726 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4142  prolyl oligopeptidase  37.97 
 
 
707 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.199893 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  35.78 
 
 
1283 aa  402  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3951  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  35.27 
 
 
740 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.26671  normal  0.109471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2940  Prolyl oligopeptidase  34.45 
 
 
713 aa  392  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000682776  hitchhiker  0.000230055 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1339  Prolyl oligopeptidase  33.19 
 
 
703 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.234666  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3423  Prolyl oligopeptidase  33.95 
 
 
697 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2982  Prolyl oligopeptidase  33.85 
 
 
704 aa  363  4e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.35677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6440  Prolyl oligopeptidase  33 
 
 
666 aa  356  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.575381  normal  0.082879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2543  prolyl oligopeptidase  33.19 
 
 
690 aa  355  1e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768819  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1536  Prolyl oligopeptidase  32.09 
 
 
692 aa  352  8.999999999999999e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469574  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7338  Prolyl oligopeptidase  32.67 
 
 
690 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1604  prolyl oligopeptidase  32.76 
 
 
723 aa  349  8e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.115584  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1137  Prolyl oligopeptidase  31.42 
 
 
705 aa  342  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7340  Prolyl oligopeptidase  31.09 
 
 
709 aa  340  7e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2212  prolyl oligopeptidase  31.84 
 
 
702 aa  334  3e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1364  Prolyl oligopeptidase  32.82 
 
 
742 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.199496  hitchhiker  0.000136214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3530  Prolyl oligopeptidase  31.24 
 
 
717 aa  327  4.0000000000000003e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.345733  normal  0.681062 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00580  Prolyl endopeptidase, putative  29.55 
 
 
803 aa  283  5.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1444  Prolyl oligopeptidase  29.86 
 
 
734 aa  283  6.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1129  Prolyl oligopeptidase  30.2 
 
 
614 aa  280  9e-74  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.107697  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5032  prolyl oligopeptidase  29.04 
 
 
718 aa  277  6e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1757  prolyl oligopeptidase  29.16 
 
 
696 aa  275  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0107679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1786  oligopeptidase B  30.09 
 
 
688 aa  273  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0781  prolyl oligopeptidase  28.63 
 
 
733 aa  273  8.000000000000001e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.515058  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3588  prolyl oligopeptidase  29.47 
 
 
695 aa  264  4e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.331687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3635  prolyl oligopeptidase  38.32 
 
 
697 aa  260  6e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2047  prolyl oligopeptidase family protein  28.97 
 
 
697 aa  259  8e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2098  prolyl oligopeptidase  28.55 
 
 
701 aa  258  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0491197  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1041  Prolyl oligopeptidase  28.76 
 
 
704 aa  258  3e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.726536  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2255  prolyl oligopeptidase  28.68 
 
 
697 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000270623  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2090  Prolyl oligopeptidase  28.53 
 
 
697 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000397024  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2372  prolyl oligopeptidase  28.24 
 
 
697 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000969986  normal  0.312788 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1010  oligopeptidase B  28.87 
 
 
732 aa  251  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.371768  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2104  prolyl oligopeptidase  28.74 
 
 
697 aa  250  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.258358  normal  0.949573 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2371  prolyl oligopeptidase  27.74 
 
 
690 aa  250  8e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2229  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  28.74 
 
 
697 aa  250  8e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.271219  normal  0.279234 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1870  prolyl oligopeptidase  28.59 
 
 
697 aa  246  9e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010219  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2232  prolyl oligopeptidase  38.52 
 
 
696 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000449493 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1498  Prolyl oligopeptidase  28.45 
 
 
730 aa  243  6e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4734  Oligopeptidase B  26.68 
 
 
705 aa  240  5e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.979421  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4870  prolyl oligopeptidase  35.08 
 
 
722 aa  239  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1095  Oligopeptidase B  27.38 
 
 
671 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.392481  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2940  prolyl oligopeptidase  34.59 
 
 
710 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.029506  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000831  putative protease  28.45 
 
 
696 aa  236  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.125808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6532  Oligopeptidase B  27.89 
 
 
721 aa  233  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0448855  normal  0.250213 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06740  protease  28.49 
 
 
696 aa  232  2e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0623  prolyl oligopeptidase  28.18 
 
 
663 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0636  prolyl oligopeptidase  28.18 
 
 
663 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0616  prolyl oligopeptidase  28.18 
 
 
663 aa  231  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.271655 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3026  protease II  26.93 
 
 
704 aa  230  5e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0568  protease II  26.83 
 
 
702 aa  231  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1856  prolyl oligopeptidase  28.38 
 
 
686 aa  231  5e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0569  protease II  26.83 
 
 
702 aa  230  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0734  Prolyl oligopeptidase  28.8 
 
 
681 aa  230  7e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>