29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4598 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4598  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 448 aa  887    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0778  polysaccharide biosynthesis protein  35.9 
 
 		 442 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.699251  normal  0.0159711 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  35.8 
 
 		 457 aa  281  2e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1814  polysaccharide biosynthesis protein  30.49 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0724  polysaccharide biosynthesis protein  27.48 
 
 		 448 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3499  polysaccharide biosynthesis protein  28.96 
 
 		 451 aa  147  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2971  O antigen flippase  25.7 
 
 		 461 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.436606  hitchhiker  0.000000132287 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0311  polysaccharide biosynthesis protein  24.61 
 
 		 418 aa  109  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.673346  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3155  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 457 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.910859  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4935  polysaccharide biosynthesis protein  24.64 
 
 		 442 aa  93.6  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.378753  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3059  polysaccharide biosynthesis protein  23.34 
 
 		 454 aa  93.2  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2213  putative O-antigen transporter  24.59 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.163882  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2314  putative O-antigen transporter  24.59 
 
 		 426 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0335708 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2321  putative O-antigen transporter  24.83 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0603153  normal  0.0137212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2555  polysaccharide biosynthesis protein  24.59 
 
 		 513 aa  67  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3186  LPS side chain defect: putative O-antigen transferase  21.88 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.15241  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2427  putative O-antigen transporter  25.46 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.279606  hitchhiker  0.000454993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3796  polysaccharide biosynthesis protein  23.61 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 499 aa  53.5  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  22.14 
 
 		 501 aa  53.1  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2211  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 		 494 aa  51.6  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.167884  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  25.78 
 
 		 457 aa  50.1  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3785  polysaccharide biosynthesis protein  21.21 
 
 		 442 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2595  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 		 452 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1637  polysaccharide biosynthesis protein  20.54 
 
 		 504 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3391  polysaccharide biosynthesis protein  21.85 
 
 		 512 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273655  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2610  polysaccharide biosynthesis protein  22 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.151394 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2518  polysaccharide exporter, (PST) family  25.23 
 
 		 486 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0230734 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>