168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4488 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4488  glucose/galactose transporter  100 
 
 		 440 aa  887    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.797276  normal  0.125839 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1696  glucose/galactose transporter  77.8 
 
 		 444 aa  702    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0309117  normal  0.239808 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0776  glucose/galactose transporter  76.82 
 
 		 441 aa  678    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.747868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6211  glucose/galactose transporter  69.63 
 
 		 431 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3397  glucose/galactose transporter  48.56 
 
 		 419 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3038  multiple antibiotic resistance (MarC)-related proteins  44.3 
 
 		 443 aa  367  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1199  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  45.25 
 
 		 438 aa  366  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.985389  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6560  glucose/galactose transporter  42.89 
 
 		 438 aa  361  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0948  multiple antibiotic resistance (MarC)-related protein  44.87 
 
 		 441 aa  358  8e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000625246  normal  0.50538 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1104  glucose/galactose transporter  44.65 
 
 		 437 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0045785  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1002  glucose/galactose transporter  46.4 
 
 		 406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00935633  normal  0.690968 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0875  glucose/galactose transporter  45.48 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.742352  hitchhiker  0.000720356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4175  glucose/galactose transporter  40.68 
 
 		 446 aa  349  6e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4115  glucose/galactose transporter  46.67 
 
 		 429 aa  346  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.312497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2077  glucose/galactose transporter  43.48 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0466  glucose/galactose transporter  42.99 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.187531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1315  glucose/galactose transporter  39.13 
 
 		 435 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0258067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2530  major facilitator transporter  43.09 
 
 		 452 aa  326  7e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2597  major facilitator transporter  42.86 
 
 		 452 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.802084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3114  glucose/galactose transporter  46.93 
 
 		 430 aa  322  6e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00000902202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1088  glucose/galactose transporter  37.7 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.307429  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3207  glucose/galactose transporter  37.7 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1148  glucose/galactose transporter  37.7 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0988235  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2696  major facilitator transporter  40.69 
 
 		 452 aa  319  7e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1182  glucose/galactose transporter  37.7 
 
 		 432 aa  318  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2702  glucose/galactose transporter  38.15 
 
 		 433 aa  318  1e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0791256  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1080  glucose/galactose transporter  37.7 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000174019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3687  glucose/galactose transporter  42.79 
 
 		 413 aa  315  9e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.202302  normal  0.04252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04321  glucose-galactose transporter  42.34 
 
 		 407 aa  315  9e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3424  glucose/galactose transporter  41 
 
 		 429 aa  312  5.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.640609  normal  0.0976131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2931  glucose/galactose transporter  38.96 
 
 		 432 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000470631  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3013  glucose/galactose transporter  38.96 
 
 		 432 aa  310  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0638848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3110  glucose/galactose transporter  38.96 
 
 		 432 aa  311  2e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0409592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0805  glucose/galactose transporter  39.34 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1215  glucose/galactose transporter  37.93 
 
 		 434 aa  308  9e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000975208  normal  0.526597 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3503  glucose/galactose transporter  38.15 
 
 		 435 aa  307  3e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0716  glucose/galactose transporter  38.64 
 
 		 429 aa  306  6e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1028  glucose/galactose transporter family protein  37.44 
 
 		 433 aa  305  1.0000000000000001e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1119  glucose/galactose transporter  38.86 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000391013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1259  L-fucose transporter  32.79 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1396  glucose/galactose transporter  32.84 
 
 		 1140 aa  213  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.866269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5644  L-fucose transporter  33.02 
 
 		 417 aa  213  7e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.183274  normal  0.735779 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  30.32 
 
 		 436 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4021  L-fucose transporter  33.72 
 
 		 417 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3671  glucose/galactose transporter  30.54 
 
 		 435 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1890  glucose/galactose transporter  33.25 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.621908  normal  0.769175 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4572  hypothetical protein  32.04 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2286  glucose/galactose transporter  32.04 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2298  glucose/galactose transporter  32.04 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00747197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2087  glucose/galactose transporter  32.04 
 
 		 423 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1994  L-fucose transporter  31.65 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.486095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2040  glucose/galactose transporter  31.8 
 
 		 423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.441952  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0292  glucose/galactose transporter  33.17 
 
 		 389 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2211  glucose/galactose transporter  31.48 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17788  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1017  glucose/galactose transporter  31.26 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1148  glucose/galactose transporter  30.51 
 
 		 428 aa  193  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0931456  normal  0.671302 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1317  glucose/galactose transporter  29.37 
 
 		 435 aa  193  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4128  L-fucose transporter  32.16 
 
 		 431 aa  193  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1403  glucose/galactose transporter  31.49 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000325262  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0119  glucose/galactose transporter  31.73 
 
 		 425 aa  189  1e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1663  glucose/galactose transporter  31.63 
 
 		 415 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.24323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2027  glucose/galactose transporter  31.48 
 
 		 415 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5388  glucose/galactose transporter  30.26 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2132  glucose/galactose transporter  31.72 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2208  glucose/galactose transporter  31.72 
 
 		 423 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  30.18 
 
 		 420 aa  186  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  30.27 
 
 		 407 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2986  glucose/galactose transporter  29.75 
 
 		 412 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3930  glucose/galactose transporter  32.07 
 
 		 436 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.121013  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1273  glucose/galactose transporter  32.69 
 
 		 426 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01229  glucose-galactose transporter  31.58 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194609  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1266  L-fucose-proton symporter  30.54 
 
 		 403 aa  183  6e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1217  glucose/galactose transporter  31.37 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00556902  normal  0.207324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2310  glucose/galactose transporter  31.07 
 
 		 423 aa  182  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.788662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1241  glucose/galactose transporter  32.37 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.184837  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1132  glucose/galactose transporter  30.7 
 
 		 431 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.165253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1656  glucose/galactose transporter  28.44 
 
 		 458 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  31.38 
 
 		 410 aa  179  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3173  glucose/galactose transporter  30.88 
 
 		 431 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000854879  normal  0.83373 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1789  glucose/galactose transporter  29.86 
 
 		 421 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0540025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2606  glucose/galactose transporter  29.43 
 
 		 435 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.246448  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1776  glucose/galactose transporter  30.73 
 
 		 437 aa  172  7.999999999999999e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.223071  normal  0.453321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2750  L-fucose transporter  32.3 
 
 		 431 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  30.38 
 
 		 428 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08721  glucose/galactose transporter  28.51 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.066118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2311  glucose/galactose transporter  29.33 
 
 		 471 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0619981  normal  0.0518008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0773  fucose permease  27.08 
 
 		 485 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2125  glucose/galactose transporter  27.67 
 
 		 468 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.957571 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3606  fucose permease  25.63 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3292  glucose/galactose transporter  29.44 
 
 		 428 aa  159  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2428  L-fucose permease  30.57 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4488  L-fucose permease  27.9 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.530054  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0887  L-fucose transporter  27.63 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2945  L-fucose transporter  27.63 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3106  L-fucose transporter  27.63 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.101933  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0911  L-fucose transporter  27.63 
 
 		 438 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5334  glucose/galactose transporter  26.68 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120939  normal  0.764594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2942  L-fucose transporter  27.4 
 
 		 438 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4065  L-fucose transporter  27.4 
 
 		 438 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1066  L-fucose:H+ symporter permease  26.17 
 
 		 399 aa  144  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0827702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>