72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4473 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3972  hypothetical protein  70.75 
 
 		 595 aa  827    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000000648751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4473  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1169    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.302672 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1809  putative secreted protein  54.88 
 
 		 527 aa  558  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3446  FAD dependent oxidoreductase  54.66 
 
 		 537 aa  548  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.585223 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3391  hypothetical protein  51.57 
 
 		 532 aa  526  1e-148  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.112201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2722  secreted protein  51.56 
 
 		 532 aa  522  1e-147  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.824763  normal  0.351955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2514  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.87 
 
 		 540 aa  520  1e-146  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.292276  normal  0.0120808 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4983  FAD dependent oxidoreductase  48.84 
 
 		 538 aa  494  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000279482  decreased coverage  0.00229382 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3103  secreted protein  49.8 
 
 		 531 aa  489  1e-137  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3383  hypothetical protein  50.49 
 
 		 530 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1299  secreted protein  48.43 
 
 		 549 aa  477  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0194  FAD dependent oxidoreductase  46.73 
 
 		 534 aa  474  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3394  hypothetical protein  47.74 
 
 		 619 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3567  secreted protein  43.48 
 
 		 514 aa  435  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2240  hypothetical protein  44.75 
 
 		 621 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.387852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2159  FAD dependent oxidoreductase  27.2 
 
 		 676 aa  154  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.351176  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0766  hypothetical protein  26.32 
 
 		 679 aa  147  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0737  hypothetical protein  26.75 
 
 		 679 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0044  hypothetical protein  25.93 
 
 		 660 aa  147  7.0000000000000006e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.958133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0953  FAD dependent oxidoreductase  26.99 
 
 		 661 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.128101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1485  hypothetical protein  26.5 
 
 		 675 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000503553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2844  hypothetical protein  25.18 
 
 		 692 aa  140  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.919934  normal  0.438174 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0835  hypothetical protein  27.3 
 
 		 696 aa  133  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0863  hypothetical protein  27.3 
 
 		 696 aa  131  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.352663  normal  0.656039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0190  hypothetical protein  25.26 
 
 		 669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.474919  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3078  hypothetical protein  25.35 
 
 		 691 aa  110  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.46062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3719  glucose-inhibited division protein A  24.86 
 
 		 582 aa  97.1  7e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3718  hypothetical protein  26.04 
 
 		 584 aa  93.6  9e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.38977  normal  0.417465 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3664  hypothetical protein  25.85 
 
 		 584 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0151  hypothetical protein  25.24 
 
 		 595 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1139  hypothetical protein  26.41 
 
 		 595 aa  83.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0990781  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2765  hypothetical protein  25.05 
 
 		 599 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.214597 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1140  hypothetical protein  25.2 
 
 		 585 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.815958  normal  0.956406 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2610  hypothetical protein  32.34 
 
 		 757 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00722891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14761  hypothetical protein  32.44 
 
 		 601 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.1592 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2605  putative pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29 
 
 		 600 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2836  hypothetical protein  29.7 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0245888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0966  hypothetical protein  23.16 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.740483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5943  putative xanthan lyase  22.38 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0457  hypothetical protein  27.82 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.38501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4710  xanthan lyase  22.55 
 
 		 680 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.442658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3542  hypothetical protein  29.15 
 
 		 758 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0274155  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4452  hypothetical protein  22.62 
 
 		 491 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0551436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2301  hypothetical protein  30.52 
 
 		 748 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.845052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2272  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 475 aa  57.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000667529  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2138  hypothetical protein  26.52 
 
 		 624 aa  57  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2074  hypothetical protein  22.22 
 
 		 706 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.838738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3971  hypothetical protein  22.04 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000911124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1335  hypothetical protein  29.37 
 
 		 595 aa  55.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0432267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1867  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.43 
 
 		 472 aa  55.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00543949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0108  hypothetical protein  25.64 
 
 		 668 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0893554 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2420  hypothetical protein  28.08 
 
 		 764 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.544034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3588  hypothetical protein  26.37 
 
 		 764 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0950  HI0933 family protein  26.62 
 
 		 435 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00109997  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08150  hypothetical protein  26.17 
 
 		 618 aa  52.4  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3997  hypothetical protein  27.6 
 
 		 549 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.308755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3355  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.39 
 
 		 722 aa  51.2  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.718335  decreased coverage  0.00294765 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0522  hypothetical protein  22.51 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2097  hypothetical protein  25.71 
 
 		 606 aa  50.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3110  hypothetical protein  22.73 
 
 		 672 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.63 
 
 		 643 aa  49.3  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0317  hypothetical protein  22.97 
 
 		 761 aa  47.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0424  glucose-inhibited division protein A  22.2 
 
 		 445 aa  47.4  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3436  FAD dependent oxidoreductase  25.27 
 
 		 464 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0942  hypothetical protein  23.84 
 
 		 457 aa  47  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3168  hypothetical protein  23.23 
 
 		 600 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00556795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0071  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.04 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  42 
 
 		 578 aa  44.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0892  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  33.77 
 
 		 641 aa  44.7  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1770  NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase  38.96 
 
 		 666 aa  44.3  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0231  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3243  hypothetical protein  20.93 
 
 		 448 aa  43.5  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>