134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4442 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4442  transposase  100 
 
 
135 aa  275  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1880  transposase  100 
 
 
135 aa  275  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.999489 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2171  transposase  71.64 
 
 
133 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.680566 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2306  transposase  71.64 
 
 
133 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.900425 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2323  transposase  71.64 
 
 
133 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.617912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2539  transposase  71.64 
 
 
133 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2542  transposase  71.64 
 
 
133 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3057  transposase  71.64 
 
 
133 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.464376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3283  transposase  71.64 
 
 
133 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267707  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3617  transposase  71.64 
 
 
133 aa  183  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.659641  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2000  transposase  57.14 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.683542  hitchhiker  0.00023796 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2067  transposase  57.14 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0302377  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3734  transposase  57.14 
 
 
131 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.475497  hitchhiker  0.00031126 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1757  transposase  57.14 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.926733  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2390  transposase  57.14 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.224522  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0934  transposase  57.14 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000418233  normal  0.0829612 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2297  transposase  57.14 
 
 
131 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000692881  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2642  transposase  56.25 
 
 
131 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4488  transposase  56.25 
 
 
131 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0166047  normal  0.0142246 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2778  transposase  53.91 
 
 
131 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3225  transposase  53.91 
 
 
131 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3515  transposase  53.91 
 
 
131 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3586  transposase  53.91 
 
 
131 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.865682  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3709  transposase  53.91 
 
 
131 aa  130  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.76368  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0093  transposase  56.25 
 
 
131 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1556  transposase  56.25 
 
 
131 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.19956  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2798  transposase  56.25 
 
 
131 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.340793  normal  0.132893 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0340  transposase  56.25 
 
 
131 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.487576  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1549  transposase  56.25 
 
 
131 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000548512  normal  0.103876 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1644  transposase  56.25 
 
 
131 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.765642  normal  0.520277 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1382  transposase  54.78 
 
 
131 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4289  transposase  53.91 
 
 
131 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.207975  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2603  transposase  54.78 
 
 
131 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000501028  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0016  transposase  56.25 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000647262 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0435  transposase  56.25 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000027279  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0644  transposase  56.25 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.829613  hitchhiker  0.00011649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1912  transposase  56.25 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0701676  hitchhiker  0.0000000637024 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2046  transposase  56.25 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0564097  hitchhiker  0.0072323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3127  transposase  56.25 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000627522  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3981  transposase  56.25 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.118365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2116  transposase  57.14 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0777  transposase  56.25 
 
 
131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0240429 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0870  transposase  52.85 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1674  transposase  52.85 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0282712  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2987  transposase  52.85 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0016  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0023  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0402  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1105  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000299322  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1494  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1615  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00133826  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1915  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.794502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2424  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2465  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.364332  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3258  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3706  transposase  53.98 
 
 
132 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3518  hypothetical protein  53.15 
 
 
409 aa  124  5e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0609241 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3467  transposase  51.2 
 
 
411 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.313669  hitchhiker  0.000138187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3827  hypothetical protein  51.2 
 
 
411 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2161  transposase  51.2 
 
 
411 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.847526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3334  transposase  51.2 
 
 
411 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000411837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0059  transposase  51.2 
 
 
411 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  hitchhiker  0.00000353059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0573  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0389976  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0682  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.891218  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0798  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1018  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0189019  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1623  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1976  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0455365  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2331  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2572  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000021064  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3083  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4069  transposase  48.03 
 
 
127 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0465  transposase  53.15 
 
 
131 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.767451  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3339  transposase  53.15 
 
 
131 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.880716  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3563  transposase  53.15 
 
 
131 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1234  transposase  50.88 
 
 
135 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1728  transposase  50.88 
 
 
135 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000136689  normal  0.0656378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2587  transposase  50.88 
 
 
135 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168791  normal  0.209881 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3306  transposase  50.88 
 
 
135 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3491  transposase  50.88 
 
 
135 aa  120  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.503078  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1370  transposase  50.88 
 
 
135 aa  120  7e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297697 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0936  transposase orfA  54.21 
 
 
126 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506606  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0716  putative transposase orfA  54.21 
 
 
130 aa  118  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.162354  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2673  ISPsy11, transposase OrfA  50.43 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.451281  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2788  ISPsy11, transposase OrfA  50.43 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1019  ISPsy11, transposase OrfA  50.43 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00833205  normal  0.0895755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1120  ISPsy11, transposase OrfA  50.43 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.123327  normal  0.37757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3618  ISPsy11, transposase OrfA  50.43 
 
 
132 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1951  ISPsy11, transposase OrfA  52.14 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.183596  normal  0.0546962 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3220  ISPsy11, transposase OrfA  52.14 
 
 
132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3677  ISPsy11, transposase OrfA  47.83 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3377  ISPsy11, transposase OrfA  47.83 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4795  ISPsy11, transposase OrfA  47.83 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2058  ISPsy11, transposase OrfA  47.83 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.587475  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1089  ISPsy11, transposase OrfA  47.83 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0726  ISPsy11, transposase OrfA  47.83 
 
 
133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000366028  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1877  ISPsy11, transposase OrfA  46.55 
 
 
133 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4510  ISPsy11, transposase OrfA  46.55 
 
 
133 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.432045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2076  IS3 family transposase orfA  45.83 
 
 
132 aa  114  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.045184  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3381  ISPsy11, transposase OrfA  46.96 
 
 
133 aa  113  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.547165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>