More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4439 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  100 
 
 		 170 aa  345  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  51.14 
 
 		 171 aa  167  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  48.52 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  45.76 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  44.51 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  48.24 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  43.79 
 
 		 152 aa  134  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  43.26 
 
 		 165 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  45.88 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  42.51 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  52.89 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  43.11 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  54.4 
 
 		 167 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  52.89 
 
 		 164 aa  131  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  42.01 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  52.89 
 
 		 164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  53.21 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  46.2 
 
 		 175 aa  128  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  40.8 
 
 		 172 aa  127  5.0000000000000004e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  45.29 
 
 		 160 aa  127  6e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  37.65 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  47.98 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  47.98 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  47.98 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  47.98 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  47.98 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  47.98 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  47.98 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  47.98 
 
 		 178 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  50.41 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  49.03 
 
 		 146 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  44.75 
 
 		 177 aa  127  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  56.6 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  39.77 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  55.36 
 
 		 190 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 163 aa  125  3e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  47.73 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  45.86 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 200 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  45.4 
 
 		 173 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  53.57 
 
 		 142 aa  124  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  46.43 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  40.44 
 
 		 184 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0156  single-strand binding protein  52.73 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  53.7 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  43.26 
 
 		 170 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  53.77 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  42.95 
 
 		 222 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  53.21 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  49.22 
 
 		 219 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  40.59 
 
 		 161 aa  122  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  46.32 
 
 		 238 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  49.62 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 149 aa  121  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  48.41 
 
 		 148 aa  121  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  46.1 
 
 		 236 aa  121  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 182 aa  120  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  44.75 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  46.21 
 
 		 234 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  40.12 
 
 		 158 aa  120  7e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  46.21 
 
 		 234 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  46.21 
 
 		 234 aa  120  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 186 aa  120  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  41.53 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  42.25 
 
 		 180 aa  120  9e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 199 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 196 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  41.53 
 
 		 156 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 192 aa  120  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  42.11 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  43.59 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  55.14 
 
 		 179 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  46.67 
 
 		 236 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  48.57 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6107  single-stranded DNA-binding protein  54.21 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3819  single-strand binding protein  48.41 
 
 		 175 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131469  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  49.07 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  43.7 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  48.78 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2695  single-stranded DNA-binding protein  54.21 
 
 		 186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2837  single-stranded DNA-binding protein  54.21 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0731757  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5019  single-strand binding protein  50 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0663797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2788  single-stranded DNA-binding protein  54.21 
 
 		 183 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.481192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  48.39 
 
 		 158 aa  118  3e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2163  single-stranded DNA-binding protein  54.21 
 
 		 184 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2777  single-stranded DNA-binding protein  54.21 
 
 		 184 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450674  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 168 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  48.85 
 
 		 163 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4373  single-stranded DNA-binding protein  42.62 
 
 		 166 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.394884  normal  0.18478 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  36.26 
 
 		 159 aa  117  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  42.69 
 
 		 158 aa  117  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  52.78 
 
 		 156 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  50.47 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5424  single-strand binding protein  49.17 
 
 		 130 aa  117  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0611  single-stranded DNA-binding protein  53.27 
 
 		 179 aa  117  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0353597 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  53.27 
 
 		 177 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  53.27 
 
 		 181 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>