More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4430 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4430  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 		 416 aa  844    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0494311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  70.91 
 
 		 416 aa  591  1e-168  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6814  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.65 
 
 		 415 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0152004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2337  gamma-glutamyl phosphate reductase  57.59 
 
 		 415 aa  497  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.226119 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1574  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.93 
 
 		 417 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1415  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.93 
 
 		 417 aa  426  1e-118  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0861  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.16 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0911248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1100  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.72 
 
 		 418 aa  409  1e-113  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1576  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 		 419 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725209 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.28 
 
 		 418 aa  396  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000378604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1684  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 		 418 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000238537  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1479  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.71 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1865  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 		 418 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.63 
 
 		 411 aa  376  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.74 
 
 		 425 aa  360  2e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.21 
 
 		 424 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.26 
 
 		 418 aa  358  9.999999999999999e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.71 
 
 		 418 aa  353  2e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.25 
 
 		 418 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0634  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.79 
 
 		 407 aa  353  2.9999999999999997e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.78 
 
 		 423 aa  353  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.28 
 
 		 415 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.52 
 
 		 420 aa  350  4e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.19 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.54 
 
 		 418 aa  349  5e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0408  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.34 
 
 		 418 aa  348  7e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.72 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.3 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.26 
 
 		 423 aa  346  5e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.9 
 
 		 416 aa  345  7e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0284  gamma-glutamyl phosphate reductase  46 
 
 		 417 aa  344  1e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.8 
 
 		 414 aa  344  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.06 
 
 		 418 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.46 
 
 		 409 aa  342  7e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.54 
 
 		 419 aa  341  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0792  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.86 
 
 		 410 aa  341  2e-92  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.48 
 
 		 418 aa  340  4e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0968  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.24 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.41 
 
 		 418 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.53 
 
 		 418 aa  339  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0761  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.91 
 
 		 445 aa  338  7e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0336329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2804  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.11 
 
 		 420 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.29 
 
 		 415 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2502  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.01 
 
 		 417 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.32 
 
 		 418 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0784  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.78 
 
 		 423 aa  336  5e-91  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1018  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  43.45 
 
 		 425 aa  335  5.999999999999999e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.58 
 
 		 416 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.69 
 
 		 418 aa  333  4e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.74 
 
 		 413 aa  332  6e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.01 
 
 		 418 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.24 
 
 		 425 aa  332  8e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0439463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2847  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.31 
 
 		 429 aa  331  1e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.948477  normal  0.581146 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0901  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.11 
 
 		 417 aa  332  1e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0955  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.24 
 
 		 425 aa  331  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.06 
 
 		 419 aa  331  1e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.47 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0991  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.24 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.145269  normal  0.460355 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0644  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.57 
 
 		 415 aa  331  2e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0349753  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0936  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.37 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.22 
 
 		 428 aa  329  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.53 
 
 		 418 aa  329  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0978  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.88 
 
 		 413 aa  329  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.925276  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2254  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.93 
 
 		 430 aa  328  8e-89  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3197  gamma-glutamyl phosphate reductase  43 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3430  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.98 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000815894  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1863  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.87 
 
 		 417 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000148264  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.57 
 
 		 415 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0619  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.33 
 
 		 415 aa  327  3e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00446157  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.56 
 
 		 417 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.75 
 
 		 422 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.83 
 
 		 414 aa  326  4.0000000000000003e-88  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.36 
 
 		 441 aa  325  8.000000000000001e-88  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.82 
 
 		 417 aa  325  9e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  40.82 
 
 		 417 aa  325  9e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.17 
 
 		 425 aa  325  9e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.75 
 
 		 420 aa  324  2e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.29 
 
 		 423 aa  323  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004267  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.34 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000573407  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3283  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.89 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.58 
 
 		 417 aa  323  3e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18230  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  41.87 
 
 		 426 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  46.89 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.17 
 
 		 429 aa  323  3e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1122  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.01 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1319  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.55 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.73 
 
 		 416 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01163  gamma-glutamyl phosphate reductase  42.58 
 
 		 411 aa  322  7e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.12 
 
 		 424 aa  322  9.000000000000001e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2009  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.34 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00109825  hitchhiker  0.000000000000564296 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2952  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.55 
 
 		 415 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.434526  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  43.59 
 
 		 418 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.76 
 
 		 435 aa  320  1.9999999999999998e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3415  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.61 
 
 		 424 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0715531 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3149  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.91 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.485003  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3287  gamma-glutamyl phosphate reductase  40.91 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0357  gamma-glutamyl phosphate reductase  41.08 
 
 		 416 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>