More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4412 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4412  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  74.58 
 
 		 185 aa  275  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  62.22 
 
 		 187 aa  230  9e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3511  thioesterase superfamily protein  62.07 
 
 		 189 aa  230  1e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.269627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02221  Thioesterase superfamily protein  55.36 
 
 		 169 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  52.22 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 182 aa  187  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  54.73 
 
 		 180 aa  185  3e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  55.84 
 
 		 163 aa  181  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  52.87 
 
 		 167 aa  170  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  52.87 
 
 		 167 aa  170  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  56.34 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  55.94 
 
 		 188 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  55.24 
 
 		 160 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 171 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  52.76 
 
 		 173 aa  164  5.9999999999999996e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  52.63 
 
 		 167 aa  164  9e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 161 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  50.66 
 
 		 161 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  56.2 
 
 		 188 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 		 160 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  56.93 
 
 		 178 aa  162  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  49.68 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  49.38 
 
 		 166 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  50.34 
 
 		 166 aa  160  7e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  50.33 
 
 		 169 aa  160  7e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  54.11 
 
 		 146 aa  160  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5405  thioesterase superfamily protein  49.69 
 
 		 161 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  47.02 
 
 		 168 aa  159  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  51.53 
 
 		 161 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  48.98 
 
 		 168 aa  158  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  50.92 
 
 		 161 aa  158  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  50.63 
 
 		 161 aa  157  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 		 168 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 		 162 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  54.74 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 161 aa  154  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 167 aa  152  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5356  thioesterase superfamily protein  50.63 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.923329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  53.1 
 
 		 153 aa  147  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5264  thioesterase superfamily protein  50.63 
 
 		 161 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.62859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3558  putative thioesterase  50.99 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2092  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1352  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0082018  hitchhiker  0.000000391158 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  52.9 
 
 		 161 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  53.51 
 
 		 180 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0016  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 179 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.704012  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4520  thioesterase superfamily protein  48.53 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  45.03 
 
 		 158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  43.33 
 
 		 167 aa  125  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7651  thioesterase superfamily protein  45.59 
 
 		 248 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0410  thioesterase superfamily protein  40.62 
 
 		 171 aa  122  4e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.106264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 155 aa  119  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  46.53 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  39.33 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1586  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 159 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00531862  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.86 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2809  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2569  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029827  hitchhiker  0.00345212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1720  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00965102  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1763  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.159605  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1723  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.847646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2772  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.14 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2309  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1607  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 162 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000128786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2392  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2462  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.146341  hitchhiker  0.00677922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2555  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 		 159 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0159828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001332  acyl-CoA hydrolase  40 
 
 		 161 aa  110  8.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000629116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2620  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000119255  hitchhiker  0.000000252749 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1977  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40 
 
 		 159 aa  108  5e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00309488  hitchhiker  0.00204138 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1334  putative thioesterase  37.16 
 
 		 161 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.806608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 		 170 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2948  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 		 168 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300986  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0440  thioesterase family protein  38.57 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1037  long-chain acyl-CoA thioester hydrolase  39.16 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2290  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 161 aa  106  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0256526  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2490  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.530412  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1458  thioesterase superfamily protein  41.14 
 
 		 170 aa  105  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.110696  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0878  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.758014  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4068  thioesterase superfamily protein  36.49 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00186471  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  41.3 
 
 		 161 aa  102  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  39.32 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2766  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00729283  normal  0.4675 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  39.32 
 
 		 163 aa  102  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0936  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2046  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 		 158 aa  99.4  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00153231  decreased coverage  0.00531586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01905  acyl-CoA thioester hydrolase  38.89 
 
 		 163 aa  98.6  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.139009  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4578  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 149 aa  98.6  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1684  thioesterase family protein  41.53 
 
 		 187 aa  97.1  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0492  thioesterase family protein  41.53 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2827  thioesterase family protein  41.53 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3841  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 149 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2888  thioesterase family protein  41.53 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1048  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 170 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.175803  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0890  thioesterase family protein  41.53 
 
 		 168 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.584979  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1089  thioesterase superfamily protein  42.28 
 
 		 170 aa  96.7  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>