More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4409 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  100 
 
 		 177 aa  364  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  58.76 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  55.68 
 
 		 175 aa  213  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  51.72 
 
 		 182 aa  198  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  51.7 
 
 		 174 aa  197  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  48.59 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  46.89 
 
 		 176 aa  184  8e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  43.75 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  42.37 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  42.37 
 
 		 183 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  42.53 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  42.37 
 
 		 183 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  41.28 
 
 		 181 aa  154  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  41.04 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  45.73 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  41.14 
 
 		 180 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  38.29 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  41.38 
 
 		 183 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  37.85 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  38.51 
 
 		 204 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  39.41 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  40.91 
 
 		 190 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  42.37 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  39.88 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  39.53 
 
 		 196 aa  143  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  39.31 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  38.95 
 
 		 182 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  39.41 
 
 		 182 aa  142  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  38.95 
 
 		 196 aa  141  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  40.74 
 
 		 182 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  38.01 
 
 		 187 aa  139  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  38.37 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  42.11 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  33.33 
 
 		 188 aa  138  3e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  40.94 
 
 		 189 aa  138  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  37.79 
 
 		 175 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  39.43 
 
 		 197 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  36.05 
 
 		 184 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  35.59 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  34.88 
 
 		 182 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  38.86 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  38.24 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  38.24 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  37.57 
 
 		 201 aa  134  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  37.65 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  36.63 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  38.15 
 
 		 201 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  35.84 
 
 		 219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  37.79 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  39.51 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  37.21 
 
 		 195 aa  132  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3701  YceI  35.26 
 
 		 187 aa  131  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.634464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  37.04 
 
 		 178 aa  131  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  37.79 
 
 		 200 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  36.63 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  40.94 
 
 		 189 aa  130  9e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  37.85 
 
 		 183 aa  129  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  31.61 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  38.95 
 
 		 185 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  35.67 
 
 		 186 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  38.01 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  36.16 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  38.73 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  36.16 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  36.16 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  36.72 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7029  YceI family protein  36.63 
 
 		 183 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.244841 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  34.3 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  37.79 
 
 		 178 aa  128  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  37.79 
 
 		 181 aa  127  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2032  YceI  41.92 
 
 		 192 aa  127  7.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.267829  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  38.6 
 
 		 174 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1264  YceI family protein  36.47 
 
 		 173 aa  127  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  38.07 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  37.65 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  34.52 
 
 		 199 aa  124  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  36.11 
 
 		 199 aa  124  6e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0872  YceI family protein  36.63 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.467624  normal  0.0780201 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  34.83 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  35.26 
 
 		 182 aa  123  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  37.42 
 
 		 190 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  40.61 
 
 		 192 aa  121  6e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  34.88 
 
 		 209 aa  121  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  36.47 
 
 		 188 aa  120  8e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  35.19 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  35.2 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1380  YceI family protein  32.56 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181422  normal  0.385301 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  33.71 
 
 		 182 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  40 
 
 		 192 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  35.12 
 
 		 190 aa  117  7e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  33.53 
 
 		 181 aa  117  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07170  hypothetical protein  35.93 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0441  YceI family protein  36.05 
 
 		 183 aa  116  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.886129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  34.68 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  36.05 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  36.05 
 
 		 171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  45.16 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  36.14 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  34.88 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  38.79 
 
 		 192 aa  114  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>