More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4367 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 125 aa  248  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  79.2 
 
 		 125 aa  208  2e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  77.6 
 
 		 125 aa  203  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  77.6 
 
 		 126 aa  202  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  76 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0374  30S ribosomal protein S13  75.2 
 
 		 124 aa  186  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05835  30S ribosomal protein S13  71.2 
 
 		 124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.147231  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  70.4 
 
 		 124 aa  178  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0173  30S ribosomal protein S13  72.27 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.190252 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 126 aa  167  6e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1914  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 126 aa  166  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  63.2 
 
 		 125 aa  161  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 121 aa  159  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 121 aa  159  8.000000000000001e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 124 aa  159  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2399  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 125 aa  159  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000797962  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2205  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 125 aa  157  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000397378  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 121 aa  156  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1807  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  155  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.258513  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  60.8 
 
 		 125 aa  155  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  156  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  61.6 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 121 aa  154  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  61.9 
 
 		 127 aa  153  9e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  61.29 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 124 aa  152  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0204  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 125 aa  152  1e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 		 116 aa  152  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  60.34 
 
 		 127 aa  150  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000175069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 121 aa  150  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 121 aa  150  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 123 aa  150  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2040  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 125 aa  150  7e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000297672  normal  0.161129 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0313  30S ribosomal protein S13  59.65 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000333021  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1827  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 		 125 aa  148  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  147  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  59.2 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  57.02 
 
 		 121 aa  147  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  56 
 
 		 126 aa  147  7e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  57.85 
 
 		 124 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 124 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  56.56 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  55.2 
 
 		 125 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 		 121 aa  145  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 123 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  56.1 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 		 124 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  144  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 121 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1731  30S ribosomal protein S13  56 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  57.02 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 122 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 121 aa  144  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  56.91 
 
 		 127 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  56.8 
 
 		 126 aa  144  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  144  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0342  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 		 120 aa  144  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000749433  unclonable  0.0000000390706 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 128 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 		 121 aa  143  8.000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  61.74 
 
 		 128 aa  143  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  58.2 
 
 		 121 aa  142  1e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142424  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  142  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2272  30S ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00112148  hitchhiker  0.00311978 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  143  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4727  30S ribosomal protein S13  58.97 
 
 		 118 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.478097  normal  0.348822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0509  30S ribosomal protein S13  58.12 
 
 		 118 aa  141  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.176791  hitchhiker  0.00957459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>