More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4363 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4363  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
437 aa  875    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0120386  normal  0.169527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5767  preprotein translocase, SecY subunit  79.72 
 
 
439 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.800902 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0177  preprotein translocase subunit SecY  58.99 
 
 
435 aa  555  1e-157  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.158062 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3142  preprotein translocase subunit SecY  57.69 
 
 
440 aa  532  1e-150  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0487569  normal  0.382691 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  58.72 
 
 
444 aa  528  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1635  preprotein translocase subunit SecY  56.57 
 
 
447 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1918  preprotein translocase subunit SecY  58.17 
 
 
446 aa  500  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0862  preprotein translocase, SecY subunit  53.99 
 
 
438 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.148817  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0377  preprotein translocase subunit SecY  53.38 
 
 
448 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05820  preprotein translocase SecY  53.17 
 
 
447 aa  455  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  50.67 
 
 
443 aa  449  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1167  preprotein translocase subunit SecY  51.35 
 
 
447 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.221673  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0201  preprotein translocase subunit SecY  50.22 
 
 
443 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.124191  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  50.11 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  51.11 
 
 
443 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2276  preprotein translocase subunit SecY  50.9 
 
 
441 aa  435  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000725785  hitchhiker  0.00410487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  50.22 
 
 
441 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2209  preprotein translocase subunit SecY  49.55 
 
 
443 aa  432  1e-120  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000211329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.46 
 
 
445 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  45.37 
 
 
424 aa  359  5e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  44.96 
 
 
447 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  44.96 
 
 
447 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  45.18 
 
 
420 aa  353  2.9999999999999997e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  43.63 
 
 
418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  42.34 
 
 
446 aa  351  1e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  44.86 
 
 
419 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  44.96 
 
 
447 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  42.86 
 
 
429 aa  348  9e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  45.56 
 
 
421 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  43.08 
 
 
435 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  42.27 
 
 
437 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  43.21 
 
 
435 aa  344  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  42.86 
 
 
437 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0207  preprotein translocase, SecY subunit  40.75 
 
 
500 aa  344  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  45.31 
 
 
430 aa  341  1e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  41.7 
 
 
435 aa  342  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  43.4 
 
 
421 aa  341  2e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  43.76 
 
 
435 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  44.5 
 
 
419 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  41.69 
 
 
435 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  42.95 
 
 
435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  43.31 
 
 
437 aa  337  2.9999999999999997e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  44.03 
 
 
443 aa  336  3.9999999999999995e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  41.12 
 
 
435 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3686  preprotein translocase, SecY subunit  42.43 
 
 
441 aa  335  1e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000792509  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  43.59 
 
 
444 aa  334  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  43.96 
 
 
445 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 
443 aa  333  3e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3985  preprotein translocase, SecY subunit  44.32 
 
 
448 aa  333  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00342615  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  44.1 
 
 
443 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5144  preprotein translocase, SecY subunit  42.66 
 
 
437 aa  333  4e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.552257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  42.96 
 
 
429 aa  332  7.000000000000001e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  44.19 
 
 
448 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 
447 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2181  preprotein translocase, SecY subunit  43.49 
 
 
447 aa  330  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0326  preprotein translocase subunit SecY  43.32 
 
 
437 aa  330  2e-89  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000568003 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  42.82 
 
 
435 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  43.78 
 
 
445 aa  330  4e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2626  preprotein translocase subunit SecY  41.72 
 
 
442 aa  329  5.0000000000000004e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.512513  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  42.95 
 
 
432 aa  329  7e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  44.63 
 
 
446 aa  329  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  43.39 
 
 
429 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  42.86 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  43.29 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  44.39 
 
 
446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  42.47 
 
 
435 aa  328  2.0000000000000001e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  43.69 
 
 
444 aa  327  3e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  43.16 
 
 
447 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6594  preprotein translocase subunit SecY  43.64 
 
 
436 aa  327  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1360  preprotein translocase, SecY subunit  42.59 
 
 
423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  42.31 
 
 
438 aa  326  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0973  preprotein translocase subunit SecY  41.51 
 
 
428 aa  325  1e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0797  preprotein translocase subunit SecY  38.34 
 
 
457 aa  323  4e-87  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.14214  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  42.89 
 
 
443 aa  323  4e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  43.52 
 
 
443 aa  322  8e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1374  preprotein translocase subunit SecY  40.36 
 
 
431 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0289241  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  40.24 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  40.24 
 
 
442 aa  321  1.9999999999999998e-86  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  43.79 
 
 
443 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0560  preprotein translocase, SecY subunit  43.12 
 
 
442 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  44.03 
 
 
446 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4487  preprotein translocase, SecY subunit  43.4 
 
 
436 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  41.27 
 
 
440 aa  319  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  43.49 
 
 
446 aa  319  7.999999999999999e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2887  preprotein translocase, SecY subunit  41.72 
 
 
441 aa  318  9e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0626195  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  42.19 
 
 
448 aa  318  1e-85  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0582  preprotein translocase subunit SecY  42.12 
 
 
435 aa  318  1e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  41.42 
 
 
426 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  43.46 
 
 
443 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  40.84 
 
 
443 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3397  preprotein translocase, SecY subunit  40.14 
 
 
439 aa  317  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  41.44 
 
 
430 aa  317  3e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  42.2 
 
 
446 aa  317  4e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04180  preprotein translocase subunit SecY  39.91 
 
 
435 aa  316  4e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132635  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  39.95 
 
 
443 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  39.95 
 
 
443 aa  316  5e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10746  preprotein translocase subunit SecY  41.2 
 
 
441 aa  316  6e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.329828 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3903  preprotein translocase subunit SecY  40.5 
 
 
441 aa  316  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.340332  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29540  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  39.82 
 
 
429 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.498773  normal  0.844433 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1000  preprotein translocase, SecY subunit  41.27 
 
 
419 aa  315  8e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00382146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>