More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4357 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4357  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 132 aa  266  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000370382  normal  0.0738718 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5773  ribosomal protein S8  80.3 
 
 		 132 aa  226  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142927  normal  0.547889 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3148  30S ribosomal protein S8  79.84 
 
 		 130 aa  223  6e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.341893  normal  0.584755 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0616  ribosomal protein S8  73.48 
 
 		 132 aa  202  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.998954 
 
 
-
 
NC_002950  PG1924  30S ribosomal protein S8  70.99 
 
 		 131 aa  194  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0383  30S ribosomal protein S8  68.18 
 
 		 132 aa  193  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.987697  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05790  ribosomal protein S8  68.94 
 
 		 132 aa  192  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1161  30S ribosomal protein S8  68.94 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000284312  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0183  30S ribosomal protein S8  67.67 
 
 		 133 aa  189  1e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.287486 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1629  ribosomal protein S8  65.15 
 
 		 132 aa  183  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 132 aa  156  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0772  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000396885  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  55.3 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  57.69 
 
 		 132 aa  152  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  54.55 
 
 		 132 aa  150  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  56.49 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  51.52 
 
 		 132 aa  148  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  53.79 
 
 		 134 aa  147  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1560  ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 131 aa  146  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00168005  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  52.27 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  143  9e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  143  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  53.44 
 
 		 132 aa  142  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  55.73 
 
 		 132 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2263  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00271668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2304  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  140  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00657198  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  48.09 
 
 		 132 aa  140  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  48.48 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  50.77 
 
 		 133 aa  137  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  53.44 
 
 		 131 aa  137  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  137  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  47.73 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  49.24 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3991  ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.246659  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 132 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5138  ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.632245 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 132 aa  134  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 133 aa  134  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  49.25 
 
 		 136 aa  134  5e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  52.67 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 132 aa  133  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  49.24 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  133  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  48.48 
 
 		 132 aa  132  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0776  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  50.38 
 
 		 132 aa  131  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  48.51 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  50 
 
 		 133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 130 aa  130  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1124  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 		 134 aa  131  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.176656  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0781  ribosomal protein S8  50 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000256719  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1199  30S ribosomal protein S8  49.25 
 
 		 135 aa  130  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0257081 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1170  ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 136 aa  130  6e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.210245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23161  30S ribosomal protein S8  48.06 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  49.62 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  48.85 
 
 		 134 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  50.76 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0363  30S ribosomal protein S8  49.61 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.10558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3909  30S ribosomal protein S8  50.75 
 
 		 135 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.239493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1271  ribosomal protein S8  51.91 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2700  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2385  30S ribosomal protein S8  46.21 
 
 		 132 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  48.09 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  49.62 
 
 		 132 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  50.38 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  51.15 
 
 		 132 aa  129  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>