More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4353 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4353  ribosomal protein L14  100 
 
 		 122 aa  241  1.9999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000335969  normal  0.0420195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5777  ribosomal protein L14  96.72 
 
 		 122 aa  235  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0874335  normal  0.409061 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3152  50S ribosomal protein L14P  91.8 
 
 		 122 aa  230  6e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.614669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0612  ribosomal protein L14  90.98 
 
 		 122 aa  224  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0187  50S ribosomal protein L14  81.15 
 
 		 122 aa  200  5e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.396504 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0387  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  194  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1157  50S ribosomal protein L14  79.51 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000242417  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1625  ribosomal protein L14  75.41 
 
 		 122 aa  193  8.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0852  ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 122 aa  192  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05770  ribosomal protein L14  77.87 
 
 		 122 aa  190  6e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2677  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2965  50S ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0187772  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23700  LSU ribosomal protein L14P  71.31 
 
 		 122 aa  185  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0331269  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0597  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  184  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5037  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.000278288  normal  0.502921 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0637  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.456474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2649  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  183  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0698  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.432308 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4311  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  183  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.212373  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17060  LSU ribosomal protein L14P  69.67 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0000553202  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04080  LSU ribosomal protein L14P  68.03 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3133  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0408  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.900032  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1332  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000712057  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1928  50S ribosomal protein L14  77.05 
 
 		 121 aa  180  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2636  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  180  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.499658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4305  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.59616  normal  0.0114507 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20770  LSU ribosomal protein L14P  68.85 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3713  ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.73396  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6039  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.867205  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3913  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  179  8.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0572  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0316  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0592  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  177  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29640  LSU ribosomal protein L14P  68.85 
 
 		 122 aa  177  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.542219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3421  ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1096  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  177  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0893652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0941  ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  176  8e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0897119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01270  ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.630309  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0121  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.666809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1565  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0117  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  175  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0718  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  174  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.248999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1384  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000822769  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1302  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  173  7e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000716767  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2286  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000233129  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2247  50S ribosomal protein L14  70.49 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000965477  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3895  50S ribosomal protein L14  72.95 
 
 		 122 aa  171  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4924  ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00747276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1735  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  171  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000298754  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0777  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0816328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0114  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  170  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000639835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2054  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  7.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000371952  normal  0.398869 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0089  50S ribosomal protein L14  68.85 
 
 		 122 aa  169  9e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890299 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0132  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.09851e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0120  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000694706  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0120  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000304915  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0116  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.32667e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0114  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0151  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000001313  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0120  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0141  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000080176  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2323  ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000119223  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5185  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000182859  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6604  ribosomal protein L14  71.31 
 
 		 122 aa  169  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0115  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000483187  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2219  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065108  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0191  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  169  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00380745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1841  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0521679  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0601  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2055  ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000741427  normal  0.051973 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0670  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.170156  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1897  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2413  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000959501  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1755  50S ribosomal protein L14  67.21 
 
 		 122 aa  168  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.487668  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1174  ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00146372  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0296  ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000987094  normal  0.0625902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1936  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0877  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0344551  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0264  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.188398  normal  0.453731 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0432  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000188868  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1943  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3985  ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0295  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.830026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2028  50S ribosomal protein L14  63.11 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479722  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1821  50S ribosomal protein L14  66.39 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.27073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0068  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2897  ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  167  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0206  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2308  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000566046  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2267  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  166  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000819494  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1514  50S ribosomal protein L14  64.75 
 
 		 122 aa  166  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.364182  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1921  50S ribosomal protein L14  63.93 
 
 		 122 aa  166  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.547966 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1725  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.535477  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2524  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0371  50S ribosomal protein L14  68.03 
 
 		 122 aa  166  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4016  50S ribosomal protein L14  65.57 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0331608  hitchhiker  0.0000209267 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1054  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0459954  normal  0.514901 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1025  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.000360024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1042  50S ribosomal protein L14  69.67 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.0000125925  normal  0.188139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>