More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4338 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 648 aa  1326    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  59.64 
 
 		 668 aa  763    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  36.99 
 
 		 656 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  32.42 
 
 		 643 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  32.58 
 
 		 653 aa  299  1e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  31.13 
 
 		 666 aa  295  2e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  31.93 
 
 		 650 aa  294  3e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  30.99 
 
 		 660 aa  278  2e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  33.69 
 
 		 626 aa  259  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  30.88 
 
 		 645 aa  256  1.0000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  29.51 
 
 		 665 aa  252  1e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  32.14 
 
 		 642 aa  248  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 		 631 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  29.92 
 
 		 903 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  30.64 
 
 		 677 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.14 
 
 		 673 aa  242  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  30.41 
 
 		 640 aa  241  4e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  29.37 
 
 		 641 aa  238  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  30.9 
 
 		 671 aa  238  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  30.07 
 
 		 630 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  30.13 
 
 		 672 aa  225  2e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 		 658 aa  220  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  28.82 
 
 		 757 aa  216  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  27.52 
 
 		 656 aa  211  5e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  28.46 
 
 		 638 aa  210  7e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  27.7 
 
 		 620 aa  205  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  29.98 
 
 		 630 aa  203  7e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  28.84 
 
 		 679 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  33.26 
 
 		 509 aa  196  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 		 712 aa  189  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  27.98 
 
 		 631 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  26.37 
 
 		 798 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  29.17 
 
 		 585 aa  161  4e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  26.79 
 
 		 710 aa  158  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  40.61 
 
 		 813 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  31.44 
 
 		 734 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 778 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  26.68 
 
 		 471 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  28.45 
 
 		 694 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  27.33 
 
 		 613 aa  143  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  27.45 
 
 		 537 aa  141  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  27.78 
 
 		 669 aa  140  7.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  28.81 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  29.1 
 
 		 670 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  26.48 
 
 		 712 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  24.42 
 
 		 648 aa  133  9e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  25.3 
 
 		 704 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  26.61 
 
 		 673 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  30.12 
 
 		 594 aa  124  6e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  40.41 
 
 		 568 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  27.58 
 
 		 525 aa  117  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  26.72 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  27.49 
 
 		 586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  38.67 
 
 		 340 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1585  OmpA family outer membrane protein  30.23 
 
 		 517 aa  104  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.167386  normal  0.202036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3868  OmpA/MotB domain protein  42.97 
 
 		 412 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0187  peptidoglycan-associated outer membrane protein  31.68 
 
 		 239 aa  99.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.281065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  39.19 
 
 		 263 aa  97.4  8e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 374 aa  93.2  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0046  OmpA/MotB domain protein  31.98 
 
 		 432 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.970824  normal  0.132697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 		 241 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  38.84 
 
 		 440 aa  92.4  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  37.76 
 
 		 293 aa  91.3  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.31 
 
 		 319 aa  91.3  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  40.34 
 
 		 427 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  37.8 
 
 		 362 aa  89.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  41.44 
 
 		 637 aa  89.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3536  outer membrane protein  39.34 
 
 		 505 aa  89  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4643  OmpA/MotB domain protein  40.91 
 
 		 361 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000815983  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  42.98 
 
 		 466 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 623 aa  85.1  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  44.76 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  24.9 
 
 		 504 aa  84.3  0.000000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  35.66 
 
 		 537 aa  84.3  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1698  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  35.14 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000000014556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  35.96 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.76 
 
 		 445 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  35.43 
 
 		 365 aa  83.6  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  43.27 
 
 		 242 aa  82.4  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.45 
 
 		 266 aa  82.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  40.38 
 
 		 243 aa  82.8  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1932  outer membrane protein  41.28 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.259358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1452  cysteine-rich repeat protein  33.81 
 
 		 1793 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  40.71 
 
 		 219 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  34.68 
 
 		 1755 aa  82  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  37.17 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  38.02 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.17 
 
 		 217 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  40.74 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.61 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  44.64 
 
 		 454 aa  80.5  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.14 
 
 		 240 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36.75 
 
 		 544 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3786  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.432228  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  37.72 
 
 		 320 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  42.42 
 
 		 386 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  39.05 
 
 		 230 aa  79.7  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 218 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4286  OmpA/MotB domain protein  33.08 
 
 		 540 aa  79.7  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451181  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  41.35 
 
 		 218 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>