More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4332 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  100 
 
 
497 aa  978    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  63.19 
 
 
501 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6851  amino acid/peptide transporter  49.29 
 
 
498 aa  410  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0689877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  43.51 
 
 
495 aa  411  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  43.25 
 
 
483 aa  371  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  42.09 
 
 
507 aa  363  6e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  41.67 
 
 
524 aa  362  9e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  42.36 
 
 
520 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  40.29 
 
 
517 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  44.09 
 
 
497 aa  353  5e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  42.37 
 
 
499 aa  352  8e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  39.71 
 
 
517 aa  348  1e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  41.31 
 
 
528 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  42.22 
 
 
498 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  42.83 
 
 
509 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  40.57 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  38.59 
 
 
512 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  38.59 
 
 
512 aa  330  4e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  41.48 
 
 
496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  40.04 
 
 
462 aa  326  5e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  39.29 
 
 
516 aa  325  9e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  38.87 
 
 
495 aa  325  1e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  39.1 
 
 
517 aa  325  1e-87  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  39.13 
 
 
490 aa  323  6e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  44.64 
 
 
527 aa  322  8e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  38.02 
 
 
501 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  38.93 
 
 
501 aa  319  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  38.74 
 
 
501 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  38.74 
 
 
501 aa  319  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  40.17 
 
 
504 aa  317  2e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  38.74 
 
 
489 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  38.74 
 
 
489 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  39.41 
 
 
500 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  38.54 
 
 
489 aa  316  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  37.3 
 
 
451 aa  313  5.999999999999999e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  38.16 
 
 
491 aa  312  1e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  38.14 
 
 
489 aa  310  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  37.19 
 
 
501 aa  310  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  39.12 
 
 
479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  40.25 
 
 
464 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  38.17 
 
 
461 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  36.26 
 
 
461 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  36.26 
 
 
461 aa  302  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  36.26 
 
 
461 aa  301  1e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  36.26 
 
 
461 aa  302  1e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  36.26 
 
 
461 aa  302  1e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  36.45 
 
 
461 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  36.06 
 
 
461 aa  301  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  37.22 
 
 
446 aa  301  2e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  37.22 
 
 
446 aa  301  2e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  36.26 
 
 
461 aa  301  3e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  36.06 
 
 
461 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1444  proton/peptide symporter family protein  38.26 
 
 
490 aa  297  2e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000293034  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  36.36 
 
 
461 aa  295  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  36.31 
 
 
516 aa  293  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  36.26 
 
 
463 aa  293  7e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0134  amino acid/peptide transporter  37.4 
 
 
489 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  40.26 
 
 
484 aa  291  2e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  37.2 
 
 
483 aa  291  2e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0277  amino acid/peptide transporter  36 
 
 
499 aa  290  3e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000259644  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  36.88 
 
 
516 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  35.66 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  35.66 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  36.64 
 
 
482 aa  286  5e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  37.35 
 
 
489 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0734  di-/tripeptide transporter  37.64 
 
 
497 aa  286  8e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0279102  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0521  dipeptide/tripeptide permease  34.31 
 
 
498 aa  286  8e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000167951  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  35.86 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  35.66 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1954  amino acid/peptide transporter  39.74 
 
 
501 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  37.21 
 
 
544 aa  280  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2746  amino acid/peptide transporter  37.2 
 
 
482 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.210246  normal  0.74954 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  37.21 
 
 
544 aa  276  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  35.44 
 
 
486 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  34.91 
 
 
501 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  34.91 
 
 
501 aa  270  4e-71  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  37.8 
 
 
467 aa  269  8e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  36.76 
 
 
510 aa  268  1e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  35.14 
 
 
477 aa  269  1e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  35.59 
 
 
539 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  36.07 
 
 
539 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  36.07 
 
 
539 aa  266  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  35.87 
 
 
539 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  35.65 
 
 
395 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  36.98 
 
 
499 aa  263  8e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  35.9 
 
 
510 aa  260  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  35.82 
 
 
534 aa  260  3e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04805  proton/peptide symporter family protein  35.67 
 
 
533 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  36.33 
 
 
558 aa  254  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0392  di-tripeptide transporter, putative  35.15 
 
 
501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  31.67 
 
 
497 aa  253  5.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2903  amino acid/peptide transporter  32.12 
 
 
584 aa  253  8.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00422026 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  34.06 
 
 
494 aa  252  9.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2239  amino acid/peptide transporter  33.65 
 
 
603 aa  243  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.478529  normal  0.0257492 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  33.41 
 
 
502 aa  239  1e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194.1  peptide transporter  37.7 
 
 
324 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  32.45 
 
 
511 aa  231  2e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  32.12 
 
 
492 aa  226  9e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  32.12 
 
 
492 aa  224  2e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  32.46 
 
 
514 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>