More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4317 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4317  protein of unknown function DUF37  100 
 
 
69 aa  147  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.915656  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1083  protein of unknown function DUF37  76.81 
 
 
70 aa  124  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.227045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4202  hypothetical protein  66.67 
 
 
69 aa  103  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0312658  decreased coverage  0.00189987 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1496  protein of unknown function DUF37  65.22 
 
 
69 aa  104  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1545  protein of unknown function DUF37  62.32 
 
 
76 aa  100  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.277852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1511  hypothetical protein  62.32 
 
 
123 aa  99.4  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.553641  normal  0.573012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0577  hypothetical protein  63.77 
 
 
69 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2412  protein of unknown function DUF37  63.77 
 
 
136 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.143753  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2420  hypothetical protein  56.52 
 
 
79 aa  95.1  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3146  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 
70 aa  95.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.848373  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2332  protein of unknown function DUF37  60.87 
 
 
69 aa  94.4  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1968  protein of unknown function DUF37  57.97 
 
 
87 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.160703  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3758  hypothetical protein  59.42 
 
 
69 aa  92  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3896  hypothetical protein  56.52 
 
 
97 aa  91.7  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264867  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04091  ribonuclease P  55.07 
 
 
88 aa  92  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.827269  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1057  protein of unknown function DUF37  58.57 
 
 
76 aa  91.3  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.354161  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2267  hypothetical protein  58.46 
 
 
79 aa  91.3  5e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00795  hypothetical protein  53.62 
 
 
70 aa  90.9  5e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358192  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28530  conserved hypothetical protein TIGR00278  59.09 
 
 
77 aa  90.1  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000113088  hitchhiker  0.00114014 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1592  hypothetical protein  62.32 
 
 
83 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2667  hypothetical protein  50.72 
 
 
104 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.152351  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0640  hypothetical protein  53.73 
 
 
73 aa  89.4  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.200519  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0005  hypothetical protein  57.58 
 
 
70 aa  88.6  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0470636 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38060  hypothetical protein  55.07 
 
 
86 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.281723  hitchhiker  0.00627783 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1354  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0376719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1332  hypothetical protein  56.52 
 
 
81 aa  88.6  3e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174281  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6057  hypothetical protein  55.07 
 
 
96 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.316993  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3917  hypothetical protein  50.72 
 
 
214 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0922453  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3616  hypothetical protein  57.58 
 
 
70 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248385 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5300  protein of unknown function DUF37  59.42 
 
 
95 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.438936  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0809  protein of unknown function DUF37  59.09 
 
 
98 aa  87  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3242  hypothetical protein  53.62 
 
 
99 aa  87  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0120  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
85 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.552201  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2790  hypothetical protein  55.07 
 
 
77 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000129723  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1486  hypothetical protein  55.07 
 
 
82 aa  85.5  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0068  hypothetical protein  59.02 
 
 
84 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3228  hypothetical protein  49.28 
 
 
206 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0857934 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1918  hypothetical protein  52.17 
 
 
86 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.168441  normal  0.136226 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2156  hypothetical protein  55.88 
 
 
119 aa  85.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0200  hypothetical protein  56.06 
 
 
76 aa  84.7  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2535  hypothetical protein  56.92 
 
 
78 aa  84.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.38648  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0874  hypothetical protein  54.55 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4698  hypothetical protein  50.72 
 
 
92 aa  84.3  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.506402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52460  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  83.6  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2398  hypothetical protein  53.42 
 
 
73 aa  83.6  9e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.454507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2840  protein of unknown function DUF37  52.17 
 
 
75 aa  82.8  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3004  hypothetical protein  50.72 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0185261  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0310  hypothetical protein  57.97 
 
 
82 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0331  protein of unknown function DUF37  53.62 
 
 
73 aa  82.8  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.116679  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_912  hypothetical protein  49.28 
 
 
70 aa  82  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000074763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2722  hypothetical protein  50.72 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0539661 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1061  hypothetical protein  50.72 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1589  hypothetical protein  56.06 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2735  hypothetical protein  51.52 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.19955  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1073  hypothetical protein  52.94 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.310426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1039  hypothetical protein  52.94 
 
 
123 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0811786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3462  hypothetical protein  53.62 
 
 
75 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2759  hypothetical protein  51.52 
 
 
70 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000635821  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4794  hypothetical protein  51.47 
 
 
105 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0320  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3614  hypothetical protein  50.72 
 
 
96 aa  81.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4947  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4526  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3461  hypothetical protein  53.62 
 
 
98 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0296727  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2437  hypothetical protein  50.72 
 
 
78 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3338  hypothetical protein  46.38 
 
 
115 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.199978  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4932  hypothetical protein  53.62 
 
 
78 aa  81.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0007  hypothetical protein  46.38 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5744  hypothetical protein  47.83 
 
 
81 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103389  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04621  hypothetical protein  49.28 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7098  protein of unknown function DUF37  51.52 
 
 
89 aa  80.5  0.000000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.262653  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3319  hypothetical protein  47.83 
 
 
82 aa  80.5  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5135  hypothetical protein  46.38 
 
 
81 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4627  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4913  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5613  conserved hypothetical protein TIGR00278  46.38 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4688  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4545  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4496  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4515  protein of unknown function DUF37  46.38 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1745  hypothetical protein  49.28 
 
 
79 aa  80.1  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5310  hypothetical protein  46.38 
 
 
81 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0788  hypothetical protein  54.55 
 
 
92 aa  79.7  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.729241  normal  0.024971 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5048  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2601  protein of unknown function DUF37  55.74 
 
 
85 aa  79.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.286006  normal  0.900477 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2550  hypothetical protein  49.28 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0765  hypothetical protein  55.07 
 
 
68 aa  80.1  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0089362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3182  hypothetical protein  49.28 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.190037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4918  hypothetical protein  52.17 
 
 
78 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3164  hypothetical protein  49.28 
 
 
88 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.345187  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1356  hypothetical protein  50.72 
 
 
82 aa  79.3  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2395  hypothetical protein  49.28 
 
 
86 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000000189964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4243  hypothetical protein  47.83 
 
 
94 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000148519  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3214  hypothetical protein  55.38 
 
 
70 aa  78.6  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1367  protein of unknown function DUF37  48.48 
 
 
78 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.528431  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1630  hypothetical protein  50.72 
 
 
81 aa  79  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.265757  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2575  hypothetical protein  50.72 
 
 
68 aa  79.3  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1730  protein of unknown function DUF37  50.72 
 
 
79 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1234  hypothetical protein  52.17 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0659963  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21151  hypothetical protein  51.52 
 
 
88 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>