57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4309 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4309  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  953    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0549386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0032  hypothetical protein  38.26 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0037  hypothetical protein  37.3 
 
 		 428 aa  265  1e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0046  hypothetical protein  36.94 
 
 		 426 aa  262  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.379833 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3923  hypothetical protein  34.92 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0011  putative ATP/GTP-binding protein  36.77 
 
 		 408 aa  252  1e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551197  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4109  hypothetical protein  35.99 
 
 		 427 aa  251  2e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5122  hypothetical protein  36.98 
 
 		 416 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.116872 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4054  hypothetical protein  37.59 
 
 		 404 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3901  hypothetical protein  37.35 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0014  conserved hypothetical protein  37.14 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03516  hypothetical protein  37.35 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0014  hypothetical protein  37.14 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4198  hypothetical protein  37.35 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03572  hypothetical protein  37.35 
 
 		 404 aa  244  3e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4039  putative cytoplasmic protein  37.03 
 
 		 408 aa  242  9e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4201  putative ATP/GTP-binding protein  36.98 
 
 		 408 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0009  hypothetical protein  35.85 
 
 		 433 aa  238  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4230  hypothetical protein  36.29 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  30.65 
 
 		 354 aa  54.3  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2704  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.03 
 
 		 660 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00329778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3040  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  37.63 
 
 		 678 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.157189 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  26.15 
 
 		 919 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  31.36 
 
 		 1167 aa  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1427  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.16 
 
 		 682 aa  49.7  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1375  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  30.83 
 
 		 708 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.635972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3323  transcriptional regulator domain protein  30.07 
 
 		 774 aa  48.9  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0826316  normal  0.463581 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  31.67 
 
 		 1062 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.2 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  28.44 
 
 		 862 aa  47.4  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0272  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  36.9 
 
 		 686 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 		 642 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  27.21 
 
 		 1028 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30.08 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7275  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.25 
 
 		 624 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.3 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  36.51 
 
 		 1097 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  34.58 
 
 		 427 aa  45.1  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  32.35 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0650  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like  27.27 
 
 		 648 aa  44.7  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.78996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  42.03 
 
 		 442 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  28.8 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  26.92 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3086  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  31.78 
 
 		 605 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.243477  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  29.77 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  27.14 
 
 		 717 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  30.36 
 
 		 1076 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.35 
 
 		 298 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  27.23 
 
 		 443 aa  43.5  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  29.81 
 
 		 444 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  29.17 
 
 		 631 aa  43.9  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  29.81 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  26.76 
 
 		 443 aa  43.5  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  29.81 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0121  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  39.51 
 
 		 674 aa  43.5  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.34 
 
 		 427 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>