49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4281 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4281  putative transmembrane transport protein  100 
 
 		 386 aa  755    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0028  permease (transport protein)  57.18 
 
 		 395 aa  450  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.37673  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1097  metal Ion (Mn2+/Fe2+) transporter, NRAMP family  56.12 
 
 		 395 aa  444  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.156832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1443  putative transmembrane transport protein  53.41 
 
 		 413 aa  409  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2227  branched-chain amino acid transport system II carrier protein  55.29 
 
 		 394 aa  409  1e-113  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0711  transmembrane transport protein  55.56 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119432  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0987  manganese transporter NRAMP  51.24 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0438146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1695  hypothetical protein  50 
 
 		 409 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1661  manganese transporter NRAMP  50 
 
 		 409 aa  363  3e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3559  hypothetical protein  49.87 
 
 		 416 aa  351  1e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.476897  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2199  Mn2+/Fe2- transporter, NRAMP family  50 
 
 		 414 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19210  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  50.26 
 
 		 427 aa  349  5e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1167  hypothetical protein  50.52 
 
 		 414 aa  347  2e-94  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.367951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3381  manganese transporter NRAMP  48.24 
 
 		 408 aa  344  1e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.764333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5193  hypothetical protein  50 
 
 		 412 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.249883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0496  hypothetical protein  49.1 
 
 		 410 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00410  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  47.77 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.455948 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5852  hypothetical protein  47.44 
 
 		 425 aa  323  4e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0575384  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0319  hypothetical protein  47.01 
 
 		 411 aa  316  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5377  hypothetical protein  45.76 
 
 		 410 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31598  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000480  hypothetical protein  41.27 
 
 		 412 aa  296  6e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0536  hypothetical protein  47.12 
 
 		 421 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131848  decreased coverage  0.00419582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3271  manganese transporter NRAMP  41.04 
 
 		 412 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  27.42 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  26.4 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  26.41 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04897  manganese transport protein MntH  22.89 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  24.44 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  25.55 
 
 		 401 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1815  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.28 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149494  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  23.62 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0529  putative manganese transport protein  25.77 
 
 		 423 aa  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1064  natural resistance-associated macrophage protein  23.1 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.262705  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  24.38 
 
 		 397 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  22.57 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  22.39 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1581  natural resistance-associated macrophage protein  25.99 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  24.11 
 
 		 420 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  22.89 
 
 		 452 aa  47.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  22.42 
 
 		 429 aa  46.6  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  22.52 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  23.15 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  24.26 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  23.17 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3815  natural resistance-associated macrophage protein  22.16 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4892  natural resistance-associated macrophage protein  22.16 
 
 		 423 aa  44.7  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  22.47 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  19.01 
 
 		 434 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  21.29 
 
 		 412 aa  43.1  0.008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>