121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4264 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4264  protein of unknown function DUF124  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.191522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4893  protein of unknown function DUF124  75.97 
 
 		 259 aa  427  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1108  hypothetical protein  58.62 
 
 		 262 aa  328  6e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1656  hypothetical protein  58.69 
 
 		 266 aa  313  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1571  hypothetical protein  60.08 
 
 		 264 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.005738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1146  protein of unknown function DUF124  58.47 
 
 		 261 aa  307  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000459152  normal  0.0631256 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1673  hypothetical protein  59.69 
 
 		 264 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.095515  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2479  hypothetical protein  59.69 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00285287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2726  hypothetical protein  59.3 
 
 		 264 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.260895  normal  0.414698 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2289  hypothetical protein  59.3 
 
 		 264 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2613  hypothetical protein  59.3 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000175451  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2651  hypothetical protein  59.3 
 
 		 264 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.203413  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1734  protein of unknown function DUF124  59.3 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.929674  hitchhiker  0.00192382 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2361  hypothetical protein  59.3 
 
 		 264 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000120346  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1966  hypothetical protein  59.69 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2160  hypothetical protein  60.96 
 
 		 264 aa  300  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3366  hypothetical protein  62.04 
 
 		 248 aa  300  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2324  hypothetical protein  58.69 
 
 		 262 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.42555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0812  protein of unknown function DUF124  57.44 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39350  hypothetical protein  59.18 
 
 		 248 aa  287  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.805149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1442  hypothetical protein  58.37 
 
 		 248 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0049  hypothetical protein  56.03 
 
 		 263 aa  282  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1826  hypothetical protein  57.51 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.768491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16590  hypothetical protein  58.37 
 
 		 248 aa  280  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0564  protein of unknown function DUF124  54.58 
 
 		 264 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3113  hypothetical protein  54.09 
 
 		 327 aa  279  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0092623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3109  hypothetical protein  58.44 
 
 		 242 aa  274  9e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0692  hypothetical protein  53.78 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3337  hypothetical protein  52.67 
 
 		 272 aa  265  5e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0972  hypothetical protein  52.34 
 
 		 251 aa  263  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08951  hypothetical protein  52.47 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0247  hypothetical protein  55.2 
 
 		 260 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00113613  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5020  hypothetical protein  55.2 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4702  hypothetical protein  56.12 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00413063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5002  hypothetical protein  55.2 
 
 		 260 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2218  hypothetical protein  52.23 
 
 		 270 aa  259  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0491928  normal  0.970799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4991  hypothetical protein  55.2 
 
 		 260 aa  260  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.012605  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0036  protein of unknown function DUF124  49.04 
 
 		 338 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0214903  hitchhiker  0.0000202128 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4615  hypothetical protein  56.12 
 
 		 263 aa  258  6e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000211636  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4593  hypothetical protein  56.12 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00756177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4973  hypothetical protein  56.12 
 
 		 260 aa  258  8e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03595  hypothetical protein  53.5 
 
 		 336 aa  258  9e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0318  hypothetical protein  53.76 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0312  hypothetical protein  53.76 
 
 		 265 aa  253  3e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0683  hypothetical protein  51.18 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0422401  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0814  hypothetical protein  51.05 
 
 		 291 aa  248  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0947  hypothetical protein  51.05 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1709  hypothetical protein  48.47 
 
 		 277 aa  237  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.109729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2602  protein of unknown function DUF124  53.11 
 
 		 256 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3272  hypothetical protein  46.36 
 
 		 275 aa  227  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0969  hypothetical protein  49.61 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1909  protein of unknown function DUF124  51.29 
 
 		 234 aa  217  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000612078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4755  hypothetical protein  53.2 
 
 		 226 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.122726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5116  hypothetical protein  53.2 
 
 		 226 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.197425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0253  hypothetical protein  43.72 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.485303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3626  protein of unknown function DUF124  41.96 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.56616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2078  protein of unknown function DUF124  40.98 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1861  hypothetical protein  44.59 
 
 		 228 aa  188  7e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4353  hypothetical protein  41.38 
 
 		 340 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4068  hypothetical protein  44.4 
 
 		 253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3221  hypothetical protein  43.97 
 
 		 269 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1202  hypothetical protein  44.4 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3709  hypothetical protein  42.25 
 
 		 319 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0906247  hitchhiker  0.000000182656 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3851  predicted protein  36.68 
 
 		 218 aa  164  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_5132  predicted protein  34.45 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0355992  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45622  predicted protein  34.91 
 
 		 305 aa  135  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.885288  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1587  protein of unknown function DUF124  33.33 
 
 		 254 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.215755  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1941  protein of unknown function DUF124  32.75 
 
 		 225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0845  hypothetical protein  35.5 
 
 		 224 aa  125  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.42306  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2565  protein of unknown function DUF124  30.96 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0893  hypothetical protein  31.2 
 
 		 230 aa  123  4e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0472  hypothetical protein  31.53 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000159087  normal  0.0186431 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3312  protein of unknown function DUF124  33.88 
 
 		 263 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.134776 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1337  hypothetical protein  31.06 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1496  hypothetical protein  29.63 
 
 		 221 aa  99  8e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.96996  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1525  protein of unknown function DUF124  29.77 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0869599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0898  hypothetical protein  32.05 
 
 		 224 aa  97.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00114056  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1430  protein of unknown function DUF124  29.77 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.166696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2433  hypothetical protein  29.06 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.428414  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39292  predicted protein  27.43 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.240986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0565  hypothetical protein  31.22 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000124544  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45623  predicted protein  31.25 
 
 		 259 aa  92.4  6e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0551  hypothetical protein  30.77 
 
 		 225 aa  91.7  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000146225  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0322  protein of unknown function DUF124  33.07 
 
 		 235 aa  90.9  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.038985  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0268  hypothetical protein  30.57 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.151971  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1446  hypothetical protein  27.41 
 
 		 246 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0069  protein of unknown function DUF124  31.03 
 
 		 232 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.381731  normal  0.770139 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0071  protein of unknown function DUF124  31.03 
 
 		 232 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1044  protein of unknown function DUF124  32.16 
 
 		 228 aa  89  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0982  hypothetical protein  29.26 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1244  hypothetical protein  30.17 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156362  normal  0.0947193 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0457  hypothetical protein  28.45 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0458  hypothetical protein  29.05 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1074  protein of unknown function DUF124  30.58 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.306573  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0344  hypothetical protein  30.53 
 
 		 227 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2257  protein of unknown function DUF124  31.75 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.518189  normal  0.805361 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45624  predicted protein  27.16 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.322694  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0507  hypothetical protein  31.17 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1646  hypothetical protein  27.95 
 
 		 222 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.158074  normal  0.97381 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0459  hypothetical protein  30.7 
 
 		 349 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>