More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4262 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 516 aa  1061    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  70.22 
 
 		 509 aa  747    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  66.41 
 
 		 517 aa  717    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  58.25 
 
 		 512 aa  617  1e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  55.49 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  54.19 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 500 aa  547  1e-154  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  52.59 
 
 		 500 aa  536  1e-151  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 501 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  49.8 
 
 		 502 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 511 aa  508  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 502 aa  409  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 		 504 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 503 aa  410  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 502 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  40.42 
 
 		 502 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 502 aa  394  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 503 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  41.29 
 
 		 493 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 492 aa  361  2e-98  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 		 506 aa  359  8e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 491 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 492 aa  355  1e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  41.73 
 
 		 507 aa  353  5e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 484 aa  352  1e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 493 aa  350  3e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 486 aa  350  4e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 		 506 aa  348  2e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2273  glutamyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 503 aa  347  3e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0229263 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 493 aa  346  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 504 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.77 
 
 		 487 aa  345  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  39.22 
 
 		 485 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  38.1 
 
 		 501 aa  343  4e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 476 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 484 aa  342  7e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  37.3 
 
 		 480 aa  341  2e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 490 aa  340  4e-92  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  38.99 
 
 		 489 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  38.55 
 
 		 479 aa  337  3.9999999999999995e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.1 
 
 		 495 aa  337  3.9999999999999995e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 480 aa  335  1e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  39.21 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 493 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 493 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.33 
 
 		 489 aa  334  2e-90  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1508  glutamyl-tRNA synthetase  38.86 
 
 		 493 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.180371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  37.64 
 
 		 505 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  38.15 
 
 		 493 aa  332  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 		 509 aa  332  1e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  38.45 
 
 		 469 aa  330  3e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  38.94 
 
 		 503 aa  330  5.0000000000000004e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  39.02 
 
 		 494 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 509 aa  329  7e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  37.94 
 
 		 495 aa  329  8e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  38.66 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  38.7 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  38.75 
 
 		 490 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  38.25 
 
 		 469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  37.28 
 
 		 490 aa  326  6e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  37.74 
 
 		 490 aa  326  7e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 479 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 482 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 504 aa  324  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20110  glutamyl-tRNA synthetase  38.46 
 
 		 493 aa  323  5e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  36.43 
 
 		 491 aa  323  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 		 514 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.565798 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  37.57 
 
 		 488 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  37.04 
 
 		 490 aa  317  4e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  38.67 
 
 		 499 aa  317  4e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 469 aa  317  4e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1994  glutamyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 494 aa  316  6e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23560  glutamyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 		 494 aa  315  9e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  38.09 
 
 		 485 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3858  glutamyl-tRNA synthetase  38.49 
 
 		 484 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131091  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  36.24 
 
 		 504 aa  312  9e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  38.15 
 
 		 546 aa  311  1e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 485 aa  310  4e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3419  glutamyl-tRNA synthetase  37.65 
 
 		 484 aa  310  5e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.464739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  36.59 
 
 		 483 aa  310  5e-83  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf641  glutamyl-tRNA synthetase  36.96 
 
 		 464 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1919  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1965  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 490 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1899  glutamyl-tRNA synthetase  37.45 
 
 		 490 aa  307  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.339627 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 		 485 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 465 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3717  glutamyl-tRNA synthetase  37.09 
 
 		 488 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.352208 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0456  glutamyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 		 480 aa  304  3.0000000000000004e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  36.54 
 
 		 492 aa  303  7.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  36.17 
 
 		 488 aa  301  2e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1728  glutamyl-tRNA synthetase  34.38 
 
 		 469 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000433955  normal  0.283148 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57984  glutamyl-tRNA synthetase, mitochondrial  36.35 
 
 		 491 aa  301  2e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.604011  normal  0.184646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  35.13 
 
 		 472 aa  300  5e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 		 488 aa  300  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  34.77 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04820  glutamyl-tRNA synthetase  37.08 
 
 		 467 aa  299  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  35.45 
 
 		 467 aa  298  1e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>