More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4260 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4260  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 172 aa  354  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.166669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0539  thioesterase superfamily protein  77.78 
 
 		 171 aa  256  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.847872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1262  thioesterase superfamily protein  69.05 
 
 		 174 aa  225  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.68115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6613  thioesterase superfamily protein  56.55 
 
 		 171 aa  203  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184351  normal  0.0168769 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0987  thioesterase superfamily protein  57.14 
 
 		 169 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03525  acyl-CoA thioester hydrolase  56.8 
 
 		 170 aa  196  9e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1929  acyl-CoA thioester hydrolase  60.84 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.504595  normal  0.403739 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1229  thioesterase superfamily protein  55.29 
 
 		 175 aa  191  4e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.506551  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3253  thioesterase superfamily protein  46.31 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.190225 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1361  thioesterase superfamily protein  46.48 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.104738  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1965  thioesterase superfamily protein  61.19 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0857  thioesterase superfamily protein  45.21 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.424877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2687  thioesterase superfamily protein  51.18 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.793889  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1596  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 161 aa  122  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4040  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2659  thioesterase superfamily protein  41.55 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.69095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2365  thioesterase superfamily protein  41.83 
 
 		 168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.405025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5550  YkhA  41.98 
 
 		 170 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3943  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1188  thioesterase superfamily protein  42.19 
 
 		 159 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.894197  normal  0.542392 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4022  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  unclonable  0.0000000809189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4748  Thioesterase superfamily  40.71 
 
 		 169 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.198787 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5219  thioesterase superfamily protein  41.36 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5401  YkhA  41.36 
 
 		 170 aa  112  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3908  thioesterase superfamily protein  39.22 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.000000000524164  normal  0.88258 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4153  thioesterase superfamily protein  43.24 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.104889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5606  YkhA  41.36 
 
 		 170 aa  111  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.266475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3266  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.4 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0875914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2043  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.4 
 
 		 168 aa  111  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.701837  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0629  thioesterase superfamily protein  42.76 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.74816  normal  0.12456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1695  thioesterase superfamily protein  40.27 
 
 		 161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.472508  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5554  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.74 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000863396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1906  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.74 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.399329  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1869  acyl-CoA hydrolase  39.74 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000146008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1859  acyl-CoA hydrolase  39.74 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00890651  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5122  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  40.12 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000417727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2053  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.74 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.255856  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2086  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.74 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1903  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00295729  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2154  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.74 
 
 		 168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0276384  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5521  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.12 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3968  hypothetical protein  39.87 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.539187  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0822  cytosolic acyl-CoA thioester hydrolase family protein  41.91 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05225  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  38.16 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.917425 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5278  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.12 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19219  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5105  acyl-CoA hydrolase (cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase)  40.12 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.441022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5675  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  40.12 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29290  hypothetical protein  39.87 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5821  thioesterase superfamily protein  38.03 
 
 		 185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380127 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  44.17 
 
 		 133 aa  108  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6320  hypothetical protein  38.31 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.329807  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72810  hypothetical protein  38.31 
 
 		 188 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.432575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1542  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 168 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00786106  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01760  Thioesterase superfamily protein  38.78 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2122  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.07 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.548255  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1557  thioesterase superfamily protein  38 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000371893  hitchhiker  0.00000555084 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0796  acyl-CoA thioester hydrolase, putative  36.42 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1416  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  39.58 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.639059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5520  cytosolic long-chain acyl-CoA thioester hydrolase family protein  42.31 
 
 		 161 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1870  thioesterase superfamily protein  36.18 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.489148  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0694  thioesterase superfamily protein  35.33 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0261705  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5649  thioesterase superfamily protein  39.71 
 
 		 160 aa  104  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146738 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3519  thioesterase superfamily protein  39.44 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0788817  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2101  thioesterase superfamily protein  39.74 
 
 		 168 aa  103  8e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0616916  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2333  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00814892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5069  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 		 161 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1140  thioesterase superfamily protein  41.48 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2512  thioesterase superfamily protein  36.91 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00440997 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2844  thioesterase superfamily protein  39.29 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  37.75 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0732  thioesterase superfamily protein  36.6 
 
 		 178 aa  101  5e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.424709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1200  thioesterase superfamily protein  43.41 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1417  thioesterase family protein  38.97 
 
 		 163 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.674589  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2327  thioesterase superfamily protein  37.67 
 
 		 164 aa  100  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2164  thioesterase superfamily protein  39.53 
 
 		 176 aa  100  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3367  thioesterase superfamily protein  38.85 
 
 		 178 aa  100  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.241986  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11393  putative acyl-CoA thioester hydrolase  32.89 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2910  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0240786  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5134  thioesterase superfamily protein  38.24 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.245583 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1269  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.798024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2516  putative acyl-CoA hydrolase  35.62 
 
 		 158 aa  99.8  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3024  acyl CoA thioester hydrolase family protein  36.88 
 
 		 187 aa  99.4  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1966  hypothetical protein  36.48 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0769925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1932  hypothetical protein  36.48 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4528  thioesterase superfamily protein  41.13 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1441  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0743  acyl-CoA thioester hydrolase-related protein  35.26 
 
 		 187 aa  97.4  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0023  acyl-CoA hydrolase  36.6 
 
 		 173 aa  97.4  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1354  acyl-CoA hydrolase  37.5 
 
 		 163 aa  97.4  8e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.383087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2480  Acyl-CoA hydrolase-like  35.76 
 
 		 185 aa  97.1  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2617  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2829  thioesterase superfamily protein  39.84 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.61254  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1797  thioesterase superfamily protein  36.05 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.076404  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0336  thioesterase family protein  36.81 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000518739  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2939  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0724  thioesterase superfamily protein  38.06 
 
 		 327 aa  96.7  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.823012  hitchhiker  0.000000302759 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1994  thioesterase family protein  39.26 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2184  acyl-CoA thioester hydrolase  37.9 
 
 		 140 aa  93.6  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.117978  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2214  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 		 170 aa  94  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0127  Acyl-Coa thioester hydrolase protein  41.67 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>