24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4246 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  40.36 
 
 		 1152 aa  807    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3237  hypothetical protein  38.58 
 
 		 1296 aa  728    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  100 
 
 		 1110 aa  2284    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  32.84 
 
 		 1125 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1556  hypothetical protein  30.9 
 
 		 1278 aa  483  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05470  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1279 aa  444  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1347 aa  427  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  27.55 
 
 		 1123 aa  374  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1134 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1017 aa  104  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2371  hypothetical protein  25.68 
 
 		 1267 aa  95.5  5e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.217084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  24.57 
 
 		 882 aa  90.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  25.05 
 
 		 882 aa  84.7  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  22.99 
 
 		 865 aa  84  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  26.84 
 
 		 884 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5106  hypothetical protein  25.11 
 
 		 857 aa  59.7  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4542  hypothetical protein  20.25 
 
 		 1113 aa  58.2  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2797  hypothetical protein  20.04 
 
 		 1343 aa  58.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1568  hypothetical protein  20.93 
 
 		 1685 aa  53.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.518804  normal  0.238693 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5046  hypothetical protein  26.6 
 
 		 325 aa  51.6  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.137607  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  21.16 
 
 		 1706 aa  50.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0566  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1086 aa  49.3  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0506  arginine-specific cysteine proteinase  21.16 
 
 		 736 aa  49.3  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.441013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  29.25 
 
 		 994 aa  46.2  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>