50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4195 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4195  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  361  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115309  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2944  hypothetical protein  32.58 
 
 
197 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.163618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3168  hypothetical protein  32.58 
 
 
181 aa  105  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.235057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1703  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.53 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.749707  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1685  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.53 
 
 
194 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3176  hypothetical protein  31.46 
 
 
197 aa  89  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3153  hypothetical protein  31.46 
 
 
197 aa  88.6  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3162  hypothetical protein  30.9 
 
 
197 aa  87.4  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0731561  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3102  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
188 aa  87.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.270956  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2087  hypothetical protein  30.9 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2918  hypothetical protein  30.9 
 
 
197 aa  87.4  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2799  hypothetical protein  34.68 
 
 
186 aa  85.5  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3287  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.49 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0893  hypothetical protein  27.49 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1022  hypothetical protein  26.16 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.830686 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5034  hypothetical protein  29.71 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.289652 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.05 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0584531  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19650  hypothetical protein  28.4 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.104813  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0100  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0103  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0579  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.735898  normal  0.0837341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2897  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.41 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2318  hypothetical protein  43.04 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28650  hypothetical protein  31.03 
 
 
184 aa  67.4  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1184  hypothetical protein  27.01 
 
 
190 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0809  hypothetical protein  23.7 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.408823  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4106  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.43 
 
 
223 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0501266 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1740  hypothetical protein  28.26 
 
 
199 aa  61.2  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.947815  normal  0.634845 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4616  hypothetical protein  23.7 
 
 
186 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4492  hypothetical protein  23.7 
 
 
186 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4631  hypothetical protein  23.12 
 
 
186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.827591  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1723  hypothetical protein  27.57 
 
 
199 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.660602  decreased coverage  0.000569336 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3925  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.95 
 
 
198 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.694666  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3293  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 
307 aa  58.2  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52614  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1965  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.26 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4399  hypothetical protein  24.85 
 
 
198 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.330046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3968  hypothetical protein  24.85 
 
 
198 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
325 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49730  predicted protein  27.37 
 
 
282 aa  51.2  0.000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42340  antibiotic biosynthesis monooxigenase  28 
 
 
177 aa  49.3  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0461  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.95 
 
 
310 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.53292  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0423  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 
192 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00495591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1913  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.1 
 
 
188 aa  45.8  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4805  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.97 
 
 
318 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0573672 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0683  hypothetical protein  36.67 
 
 
213 aa  45.1  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4812  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
205 aa  44.3  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1290  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
312 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.541544 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.31 
 
 
205 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.325578  normal  0.304097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2696  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.33 
 
 
329 aa  42  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.816764  normal  0.726885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>