More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4131 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  100 
 
 
438 aa  879    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  68.11 
 
 
438 aa  606  9.999999999999999e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  54.82 
 
 
438 aa  468  9.999999999999999e-131  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  54.04 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  47.19 
 
 
444 aa  395  1e-109  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  45.5 
 
 
444 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  42.98 
 
 
442 aa  333  4e-90  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  42.38 
 
 
447 aa  326  6e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  37.25 
 
 
469 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  38.59 
 
 
440 aa  300  4e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  36.85 
 
 
453 aa  281  1e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  36.7 
 
 
453 aa  275  8e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  35.79 
 
 
446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  35.68 
 
 
453 aa  269  7e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  35.57 
 
 
453 aa  263  3e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  34.32 
 
 
439 aa  258  2e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  37.2 
 
 
453 aa  256  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  34.87 
 
 
454 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  32.82 
 
 
439 aa  206  9e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  33.7 
 
 
446 aa  195  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.35 
 
 
441 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.09 
 
 
446 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  30.89 
 
 
438 aa  174  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  29.29 
 
 
494 aa  170  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  30.31 
 
 
466 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  30.73 
 
 
450 aa  164  3e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.45 
 
 
455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.7 
 
 
454 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  28.24 
 
 
461 aa  161  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  28.3 
 
 
461 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  30.04 
 
 
461 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  30.15 
 
 
480 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  28.24 
 
 
469 aa  160  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.39 
 
 
455 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  28.73 
 
 
428 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.43 
 
 
444 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  29.59 
 
 
463 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1409  peptidase RseP  28.82 
 
 
450 aa  156  8e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.139701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.12 
 
 
456 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1279  putative membrane-associated zinc metallopeptidase  31.21 
 
 
456 aa  155  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253686  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 
458 aa  155  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.53 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  29.53 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  28.92 
 
 
448 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2606  membrane-associated zinc metalloprotease  29.04 
 
 
456 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.69 
 
 
456 aa  152  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1108  peptidase RseP  27.86 
 
 
450 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.200515  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.65 
 
 
444 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1367  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.89 
 
 
444 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0141782 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.45 
 
 
463 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.96 
 
 
463 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.96 
 
 
463 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0981  peptidase RseP  29.91 
 
 
443 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.238067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.96 
 
 
463 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.96 
 
 
463 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.96 
 
 
463 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.96 
 
 
463 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.72 
 
 
453 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.97 
 
 
463 aa  149  9e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1442  peptidase RseP  28.38 
 
 
463 aa  149  9e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000104376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.52 
 
 
450 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2454  peptidase RseP  28.51 
 
 
443 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000129388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.33 
 
 
455 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.96 
 
 
450 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  27.06 
 
 
456 aa  146  8.000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.39 
 
 
456 aa  146  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.27 
 
 
448 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  29.12 
 
 
452 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  29.14 
 
 
454 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.54 
 
 
449 aa  145  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  27.84 
 
 
450 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  30.47 
 
 
456 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  30.47 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  30.11 
 
 
456 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  27.41 
 
 
450 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 
456 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4179  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 
450 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.374735  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  29.68 
 
 
456 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  26.21 
 
 
462 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.21 
 
 
462 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  27.08 
 
 
462 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  28.45 
 
 
454 aa  142  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  28.04 
 
 
452 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1256  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.91 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000401781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.23 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1490  RIP metalloprotease RseP  27.84 
 
 
450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1598  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.98 
 
 
452 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4633  membrane-associated zinc metalloprotease  27.19 
 
 
488 aa  141  3e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1498  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.42 
 
 
445 aa  140  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.21525  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1264  membrane-associated zinc metalloprotease  26.11 
 
 
456 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308182  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3154  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.12 
 
 
461 aa  139  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000101225  hitchhiker  0.00850689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  29.46 
 
 
456 aa  139  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  28.13 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0260  peptidase M50  26.75 
 
 
496 aa  137  4e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.650665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.15 
 
 
456 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  27.37 
 
 
457 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.89 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.27 
 
 
457 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3046  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.11 
 
 
450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3783  zinc metallopeptidase RseP  28.35 
 
 
451 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00251012  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>