More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4066 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4066  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 447 aa  927    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000027865  hitchhiker  0.000000464548 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5067  oxidoreductase domain protein  69.76 
 
 		 452 aa  660    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00280647  normal  0.971233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1134  oxidoreductase domain protein  66.89 
 
 		 442 aa  601  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.492133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0812  oxidoreductase domain protein  59.91 
 
 		 445 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000177397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0037  oxidoreductase domain protein  50.11 
 
 		 436 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1207  oxidoreductase domain protein  41.61 
 
 		 435 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.274803  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1606  oxidoreductase domain protein  43.15 
 
 		 435 aa  321  9.999999999999999e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.687359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2873  oxidoreductase domain protein  44.86 
 
 		 419 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000305709  normal  0.0375286 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2975  oxidoreductase domain-containing protein  38.14 
 
 		 428 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0111  oxidoreductase domain protein  37.09 
 
 		 475 aa  277  2e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.480309  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1216  oxidoreductase domain protein  31.97 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153592  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3510  oxidoreductase domain protein  23.58 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4489  oxidoreductase domain protein  25.61 
 
 		 457 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933956  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4717  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 		 448 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1695  oxidoreductase domain protein  24.15 
 
 		 451 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.438213  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1392  oxidoreductase domain protein  24.78 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0127888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4303  oxidoreductase domain protein  23.23 
 
 		 477 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.503542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4960  oxidoreductase domain protein  25.06 
 
 		 428 aa  87  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1052  oxidoreductase domain-containing protein  27.39 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.704406  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0777  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3509  oxidoreductase domain-containing protein  22.48 
 
 		 436 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.237244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4997  oxidoreductase domain protein  22.68 
 
 		 439 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.704924  normal  0.390331 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0006  oxidoreductase domain protein  22.84 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.696561  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4672  oxidoreductase domain protein  24.66 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377369  hitchhiker  0.00000419648 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1532  oxidoreductase domain protein  27.97 
 
 		 483 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.344847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4311  dehydrogenases related protein  24.51 
 
 		 437 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.557864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2839  oxidoreductase domain protein  26.76 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6458  oxidoreductase domain protein  22.05 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3513  oxidoreductase domain-containing protein  24.57 
 
 		 463 aa  73.2  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.637874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0294  myo-inositol 2-dehydrogenase  23.37 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5677  oxidoreductase domain protein  25.31 
 
 		 446 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17291  putative oxidoreductase  23.82 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3338  inositol 2-dehydrogenase  22.19 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.886837 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0962  oxidoreductase domain-containing protein  26.96 
 
 		 357 aa  70.1  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2918  oxidoreductase domain protein  24.31 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.438434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0297  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 459 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.628697  normal  0.651102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3348  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 		 349 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3183  oxidoreductase domain protein  23.5 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0147039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1699  oxidoreductase domain-containing protein  25.19 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1465  oxidoreductase domain-containing protein  24.07 
 
 		 456 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0437  oxidoreductase domain protein  25.73 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.116301  normal  0.584964 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1843  oxidoreductase domain protein  23.38 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6570  oxidoreductase domain protein  21.95 
 
 		 448 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1332  putative oxidoreductase  27.74 
 
 		 347 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2554  oxidoreductase domain protein  23.53 
 
 		 365 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000229173  normal  0.104007 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0333  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 360 aa  67  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.137144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0351  oxidoreductase domain-containing protein  24.79 
 
 		 360 aa  67  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2203  oxidoreductase domain protein  23.62 
 
 		 452 aa  66.6  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.13021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1564  oxidoreductase domain protein  23.43 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.165215  hitchhiker  0.000406067 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2813  oxidoreductase domain-containing protein  23.43 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.625647  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2793  oxidoreductase domain-containing protein  23.43 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0994  oxidoreductase domain protein  26.25 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.332368  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4002  oxidoreductase domain protein  27.31 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725153  unclonable  0.000000000000020909 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2933  oxidoreductase domain-containing protein  23.01 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.446433 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  24.43 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3162  oxidoreductase domain protein  24.05 
 
 		 455 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1779  oxidoreductase domain-containing protein  24.68 
 
 		 326 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1594  oxidoreductase domain-containing protein  25.49 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.410074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6215  oxidoreductase domain protein  22.35 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4727  oxidoreductase domain protein  24.23 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2490  oxidoreductase domain-containing protein  21.34 
 
 		 459 aa  64.7  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.390305  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2803  oxidoreductase domain protein  28.47 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.25239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3080  Inositol 2-dehydrogenase  24.55 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5007  oxidoreductase domain protein  28.8 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1812  oxidoreductase domain protein  23 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0673481  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4144  oxidoreductase domain protein  25 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1494  oxidoreductase domain protein  25.35 
 
 		 476 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.823061  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1694  oxidoreductase domain-containing protein  26.53 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2227  oxidoreductase domain protein  24.5 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.103386  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  26.19 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1239  oxidoreductase domain protein  25.54 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3507  oxidoreductase domain-containing protein  21.97 
 
 		 428 aa  62.4  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4469  oxidoreductase domain-containing protein  24.17 
 
 		 330 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00179754  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06830  conserved hypothetical protein  22.61 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03120  conserved hypothetical protein  23.04 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 		 366 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1749  oxidoreductase domain-containing protein  22.95 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.143051  normal  0.0151703 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0536  oxidoreductase domain-containing protein  26.01 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.635758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0775  oxidoreductase domain protein  27.13 
 
 		 474 aa  61.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.374762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3120  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  22.18 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16670  predicted dehydrogenase  25.11 
 
 		 471 aa  61.2  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4012  oxidoreductase domain protein  22.25 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3924  oxidoreductase domain protein  24.83 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1027  oxidoreductase domain protein  25.86 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.420734  normal  0.331657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1059  oxidoreductase domain protein  28.04 
 
 		 462 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  25.59 
 
 		 337 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3765  oxidoreductase domain protein  24.44 
 
 		 518 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36959  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0706  putative oxidoreductase  22.37 
 
 		 331 aa  60.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00559097  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0245  oxidoreductase domain protein  27.8 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5561  Inositol 2-dehydrogenase  23.65 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8496  Inositol 2-dehydrogenase  24.14 
 
 		 325 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.42222  normal  0.801801 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4753  oxidoreductase domain protein  24.4 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0494696 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  25.59 
 
 		 337 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2857  oxidoreductase domain protein  23.31 
 
 		 447 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1283  oxidoreductase domain protein  21.82 
 
 		 464 aa  59.7  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.80375  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4008  oxidoreductase domain protein  22.31 
 
 		 337 aa  59.7  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5623  oxidoreductase domain protein  22.06 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  23.6 
 
 		 377 aa  58.9  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0088  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  21.24 
 
 		 349 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>