278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4061 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4061  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 586 aa  1164    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000018866  hitchhiker  0.000000049947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5093  TPR repeat-containing protein  42.83 
 
 		 590 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.556464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4799  TPR repeat-containing protein  35.84 
 
 		 563 aa  267  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4083  Tetratricopeptide domain protein  30.8 
 
 		 571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.446531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2012  TPR repeat-containing protein  26.93 
 
 		 489 aa  146  9e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0246566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0488  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 556 aa  141  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7021  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 571 aa  110  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 		 266 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  24.78 
 
 		 592 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  27.8 
 
 		 827 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.45 
 
 		 4079 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.11 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 824 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 1406 aa  67  0.0000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 486 aa  65.5  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 3301 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.83 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 643 aa  63.9  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  30.1 
 
 		 1694 aa  63.5  0.000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  30.06 
 
 		 992 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 3172 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.72 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  28.96 
 
 		 550 aa  61.6  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.84 
 
 		 988 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  27.27 
 
 		 573 aa  61.2  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 3035 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1429  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.24 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000479067  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  24.19 
 
 		 1979 aa  60.1  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 265 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1827 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0376  tetratricopeptide TPR_4  26.04 
 
 		 929 aa  60.1  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.03 
 
 		 1056 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 732 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  31.43 
 
 		 1154 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.95 
 
 		 265 aa  58.9  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 1486 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4605  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 878 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.74 
 
 		 810 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.2 
 
 		 784 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  25.24 
 
 		 808 aa  57.4  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.33 
 
 		 2240 aa  57.8  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  24.4 
 
 		 833 aa  57.4  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  24.15 
 
 		 828 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  34.96 
 
 		 1056 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 1276 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.82 
 
 		 624 aa  56.6  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  24.58 
 
 		 708 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 573 aa  55.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 399 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 409 aa  56.2  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 		 265 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 364 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 594 aa  55.8  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 626 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 614 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 626 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  31.03 
 
 		 725 aa  55.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 614 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 614 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 209 aa  55.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 614 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 602 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.51 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.13 
 
 		 1737 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  26.07 
 
 		 638 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 804 aa  54.7  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 543 aa  54.3  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.24 
 
 		 818 aa  54.3  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  23.11 
 
 		 1371 aa  54.3  0.000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 762 aa  54.3  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 280 aa  54.3  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 597 aa  54.3  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  27.6 
 
 		 614 aa  53.9  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  28.43 
 
 		 622 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 766 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  20.63 
 
 		 409 aa  53.9  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  26.39 
 
 		 414 aa  53.9  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.91 
 
 		 739 aa  53.9  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 750 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  26.98 
 
 		 764 aa  53.9  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.45 
 
 		 1022 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  24.03 
 
 		 729 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 		 409 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  25.45 
 
 		 265 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000044478  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  30.88 
 
 		 750 aa  52.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12541  Tfp pilus assembly protein PilF  25.91 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.34619  hitchhiker  0.00140851 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.22 
 
 		 639 aa  52.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  25.12 
 
 		 234 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 3145 aa  52.8  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  40 
 
 		 832 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 465 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 619 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 729 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  24.73 
 
 		 602 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.35 
 
 		 887 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>