More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3918 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3918  protease Do  100 
 
 		 508 aa  1018    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5152  protease Do  53.89 
 
 		 506 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000102653  normal  0.175523 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0052  serine protease  45.92 
 
 		 483 aa  399  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292411 
 
 
-
 
NC_002950  PG0593  htrA protein  46.24 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5949  HtrA2 peptidase  45.43 
 
 		 512 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.510006  normal  0.029563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0618  hypothetical protein  44.05 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0209  protease Do  45.07 
 
 		 517 aa  360  4e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0976741 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  42.86 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2092  protease Do  42.51 
 
 		 471 aa  341  1e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0019  protease Do  41.56 
 
 		 466 aa  323  5e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.822523  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1850  protease Do  46.8 
 
 		 535 aa  293  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.308912  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  40.36 
 
 		 474 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  40.36 
 
 		 474 aa  290  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12778  serine protease precursor  42.64 
 
 		 467 aa  288  2e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  41.03 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  41.03 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  41.63 
 
 		 450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  41.63 
 
 		 450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  41.03 
 
 		 450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  41.63 
 
 		 450 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  40.79 
 
 		 450 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  41.16 
 
 		 450 aa  281  2e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  37.73 
 
 		 469 aa  279  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  41.26 
 
 		 451 aa  279  1e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  38.64 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  39.78 
 
 		 502 aa  278  2e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0410  protease Do  38.48 
 
 		 474 aa  278  2e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  37.86 
 
 		 482 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  40.88 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  41.04 
 
 		 449 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.31 
 
 		 477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.31 
 
 		 477 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  36.71 
 
 		 497 aa  274  3e-72  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  38.08 
 
 		 492 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3640  peptidase S1C, Do  38.53 
 
 		 487 aa  273  4.0000000000000004e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.316615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0645  peptidase  35.73 
 
 		 509 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.146477 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0403  protease Do  37.77 
 
 		 483 aa  273  8.000000000000001e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.149111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  39.41 
 
 		 476 aa  271  2e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  37.04 
 
 		 514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  36.73 
 
 		 514 aa  270  4e-71  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  38.69 
 
 		 481 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  39.03 
 
 		 502 aa  270  5e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  41.71 
 
 		 450 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  37.25 
 
 		 479 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  46.61 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  36.61 
 
 		 503 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  36.54 
 
 		 503 aa  267  4e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  43.95 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  38.83 
 
 		 474 aa  267  4e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01713  periplasmic protease  37.02 
 
 		 528 aa  266  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  37.7 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  35.59 
 
 		 478 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1192  protease Do  38.27 
 
 		 493 aa  266  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0123913  normal  0.0156708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  35.53 
 
 		 505 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  37.14 
 
 		 491 aa  264  3e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  41.77 
 
 		 477 aa  264  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  41.77 
 
 		 477 aa  264  4e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1749  peptidase S1C, Do  37.78 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  45.43 
 
 		 450 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.35 
 
 		 472 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0602  protease Do  35.18 
 
 		 516 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000166487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  38.8 
 
 		 511 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  38.57 
 
 		 462 aa  261  2e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  38.19 
 
 		 449 aa  261  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2624  protease Do  38.24 
 
 		 490 aa  261  3e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  36.76 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  42.42 
 
 		 513 aa  260  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  38.28 
 
 		 471 aa  260  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  35.19 
 
 		 473 aa  259  6e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  39.88 
 
 		 478 aa  259  8e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1398  protease Do  36.75 
 
 		 496 aa  259  8e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  37.39 
 
 		 464 aa  258  1e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3271  protease Do  38.24 
 
 		 476 aa  259  1e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.168434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  43.82 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3243  protease Do  37.45 
 
 		 488 aa  258  2e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0128556 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  40.9 
 
 		 446 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38.77 
 
 		 455 aa  257  3e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  37.5 
 
 		 475 aa  257  3e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.68 
 
 		 398 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  37.83 
 
 		 457 aa  257  4e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  40 
 
 		 450 aa  256  5e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  37.35 
 
 		 476 aa  256  6e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  36.17 
 
 		 498 aa  256  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.36 
 
 		 380 aa  256  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  38.33 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  36.11 
 
 		 477 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  38.28 
 
 		 499 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1739  peptidase S1C, Do  36.67 
 
 		 493 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0778272  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2247  ATPase  37.32 
 
 		 464 aa  254  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000505452  normal  0.0343548 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  38.5 
 
 		 463 aa  254  3e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  37.64 
 
 		 457 aa  254  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  35.71 
 
 		 485 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  36.46 
 
 		 484 aa  253  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  34.99 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  34.99 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  37.44 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  34.99 
 
 		 502 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  34.29 
 
 		 481 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  38.5 
 
 		 457 aa  253  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  36.38 
 
 		 473 aa  253  6e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>