More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3908 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3908  PfkB domain protein  100 
 
 		 305 aa  625  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00598203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0279  carbohydrate kinase  73.36 
 
 		 306 aa  475  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5554  PfkB domain protein  76.82 
 
 		 306 aa  471  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3699  PfkB domain protein  67.21 
 
 		 306 aa  435  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0255551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03165  carbohydrate kinase, PfkB family protein  66.67 
 
 		 307 aa  424  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1131  ribokinase-like domain-containing protein  63.04 
 
 		 307 aa  408  1e-113  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0544  PfkB domain protein  63.93 
 
 		 308 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0962  PfkB domain protein  57.76 
 
 		 308 aa  383  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.319235  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  54 
 
 		 303 aa  348  7e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1121  PfkB domain protein  54.67 
 
 		 303 aa  348  9e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000198612  normal  0.396183 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1084  ribokinase-like domain-containing protein  54.79 
 
 		 303 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000291332  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1525  PfkB domain protein  53.47 
 
 		 303 aa  345  4e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0913434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1382  carbohydrate kinase  52.81 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1177  carbohydrate kinase  52.96 
 
 		 303 aa  338  7e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.602429  normal  0.0900523 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0962  PfkB domain protein  53.47 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  53.47 
 
 		 304 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1514  PfkB domain protein  50 
 
 		 318 aa  316  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  52.15 
 
 		 305 aa  316  4e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  51.49 
 
 		 305 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1113  carbohydrate kinase  51.49 
 
 		 313 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.173432  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2316  PfkB domain protein  49.5 
 
 		 314 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.102612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2228  PfkB domain protein  49.17 
 
 		 314 aa  305  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.657681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  51.16 
 
 		 305 aa  304  9.000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0432  ribokinase-like domain-containing protein  49.34 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0011312  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3606  PfkB domain protein  48.51 
 
 		 305 aa  302  6.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2179  ribokinase-like domain-containing protein  47.52 
 
 		 313 aa  296  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.608377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1632  carbohydrate kinase, PfkB  48.18 
 
 		 314 aa  295  5e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0650146  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6330  PfkB domain protein  49.67 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.43513  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2625  ribokinase family sugar kinase  48.87 
 
 		 308 aa  286  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.366344 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1095  PfkB domain protein  44.74 
 
 		 310 aa  264  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.840635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4382  PfkB domain protein  44.19 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1745  ribokinase-like domain-containing protein  43.85 
 
 		 297 aa  248  7e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0180  ribokinase-like domain-containing protein  39.32 
 
 		 302 aa  205  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.689739 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1917  PfkB domain protein  31.39 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000761128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  24.52 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  33.33 
 
 		 315 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  33.33 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  33.33 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  26.53 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  33.33 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  33.33 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  25 
 
 		 285 aa  72.4  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  34.11 
 
 		 403 aa  72  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  23.31 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  39.02 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  25.83 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  23.68 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  25.83 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  31.82 
 
 		 424 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3069  hypothetical protein  31.65 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.795207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  24.39 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  25.17 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 398 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.75 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3257  Adenosine kinase  27.31 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00285447  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  36.07 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  26.69 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.27 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  33.8 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3718  ribokinase  32.97 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  31.88 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.16 
 
 		 325 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  31.21 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7448  cyclic nucleotide-binding protein  30.14 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  26.92 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  23.47 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  25.88 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  22.92 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  26.58 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  35.83 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3431  PfkB domain protein  30.71 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0295739  normal  0.0158701 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  26.55 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  31.58 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  31.58 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1789  ribokinase  32.64 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000225274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3036  PfkB domain protein  35.23 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  23.84 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  23.84 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  23.84 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2121  PfkB  34.31 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.987568  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4394  ribokinase-like domain-containing protein  30.25 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0284996  normal  0.833034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  23.76 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.83 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1401  ribokinase  34.01 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.033164  normal  0.166986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5194  ribokinase  34.53 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  35.65 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  32.59 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4692  PfkB domain protein  23.99 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.099486  normal  0.349994 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2791  putative sugar kinase transferase protein  34.09 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00725009  normal  0.760664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2626  PfkB domain protein  34.09 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1627  PfkB domain protein  42.5 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  30.65 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1084  PfkB family DNA-binding protein/kinase  34.43 
 
 		 404 aa  59.3  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0569  ribokinase-like domain-containing protein  29.93 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.561391  decreased coverage  0.0000690864 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3683  adenosine kinase  29.93 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0117  adenosine kinase  29.93 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>