51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3904 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3904  peptidase M28  100 
 
 		 344 aa  717    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.581158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5551  peptidase M28  61.61 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3417  leucine aminopeptidase  50.45 
 
 		 339 aa  329  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2157  glutamine cyclotransferase-related protein  48.07 
 
 		 333 aa  300  2e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0768  hypothetical protein  45.12 
 
 		 335 aa  278  9e-74  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0856  peptidase M28  43.48 
 
 		 336 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1913  peptidase M28  33.23 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1040  peptidase M28  33.99 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0003  peptidase M28  32.1 
 
 		 319 aa  136  6.0000000000000005e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00570901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7526  hypothetical protein  32.65 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0134  peptidase M28  29.87 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2681  peptidase M28  28.45 
 
 		 325 aa  90.9  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  33.51 
 
 		 775 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02870  conserved hypothetical protein  25.36 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  26.5 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  26.94 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  25 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0871  peptidase M28  31.11 
 
 		 799 aa  57  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0578  peptidase M28  29.31 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.43286  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0815  alkaline phosphatase isozyme conversion aminopeptidase  27.46 
 
 		 357 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04750  peptidase, M20/M25/M40 family protein  28.03 
 
 		 783 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  28.35 
 
 		 432 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2428  M28 family peptidase  29.13 
 
 		 273 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3998  peptidase M28  31.43 
 
 		 440 aa  49.7  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.632162  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3876  peptidase M28  26.21 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0052  peptidase M28  34.23 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000295021 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2420  M28A family peptidase  33.33 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.564351  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1386  peptidase M28  33.33 
 
 		 323 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.492148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  25.19 
 
 		 407 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2112  peptidase M28  25.58 
 
 		 1247 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0150866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5560  peptidase M28  30.29 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17180  predicted aminopeptidase  28.99 
 
 		 747 aa  46.6  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00826733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5420  peptidase M28  25 
 
 		 759 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  28.57 
 
 		 415 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2998  peptidase M28  34.96 
 
 		 778 aa  46.2  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  24.45 
 
 		 346 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3438  peptidase M28  30.25 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.346638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  29.91 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  31.31 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4970  aminopeptidase-like protein  29.84 
 
 		 442 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  28.81 
 
 		 552 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4664  peptidase M28  28.48 
 
 		 526 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  24.16 
 
 		 598 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  26.97 
 
 		 555 aa  43.9  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  32.18 
 
 		 674 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0419  hypothetical protein  24.86 
 
 		 647 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0054  peptidase M28  33.33 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5156  peptidase M28  25.91 
 
 		 465 aa  42.7  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  25.48 
 
 		 1103 aa  42.7  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0754  peptidase M28  30.91 
 
 		 339 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.050482 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5720  peptidase M28  26.61 
 
 		 313 aa  42.7  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311136  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>