More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3873 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3873  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 147 aa  304  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.666215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5237  NUDIX hydrolase  43.62 
 
 		 150 aa  139  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.598281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3008  NUDIX hydrolase  37.24 
 
 		 149 aa  100  9e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0912  NUDIX hydrolase  39.72 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1184  NUDIX hydrolase  24.64 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  37.11 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  36.84 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  36.84 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  35.35 
 
 		 140 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3337  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000625808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  33.93 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3552  mutT/nudix family protein  30.58 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6173699999999999e-43 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3598  mutT/nudix family protein  29.75 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000783119  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  35.79 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  35.79 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  35.79 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1790  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000145412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0717  NUDIX hydrolase  27.54 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1301  MutT/nudix family protein  31.31 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.308038  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1195  MutT/nudix family protein  30.08 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1955  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  0.027192 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  34.74 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3302  MutT/Nudix family protein  28.93 
 
 		 131 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.973400000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3674  NUDIX hydrolase  29.86 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2057  NUDIX hydrolase  26.09 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169928  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1923  A/G-specific adenine glycosylase  37.65 
 
 		 383 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.417542  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3252  MutT/Nudix family protein  28.1 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000005811  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1648  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000051086  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3377  MutT/Nudix family protein  28.07 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  31.51 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3557  mutT/nudix family protein  26.45 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239001  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3327  MutT/Nudix family protein  27.19 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0490  NUDIX/MutT family protein  26.09 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000225283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  30.33 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0066  NUDIX family hydrolase  33.65 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1565  ADP-ribose pyrophosphatase  33.65 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1477  ADP-ribose pyrophosphatase  33.65 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.749409  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2431  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960036  normal  0.286625 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2463  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.101073  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3561  mutT/nudix family protein  26.45 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000836995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1287  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0960276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3311  NUDIX hydrolase  34.92 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3133  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3416  mutT/nudix family protein  36.51 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3685  mutT/nudix family protein  36.51 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3636  mutT/nudix family protein  36.51 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3653  mutT/nudix family protein  28.07 
 
 		 147 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3651  mutT/nudix family protein  28.1 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4142  NUDIX hydrolase  38.24 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3053  NUDIX hydrolase  37.86 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0321786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  26.8 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00160  ADP-ribose pyrophosphatase  29.57 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  28.93 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2153  NUDIX family hydrolase  29.23 
 
 		 173 aa  49.7  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0017  MutT/nudix family protein  33.33 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025421 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2714  mutT/nudix family protein  38.96 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0283427  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2611  mutT/nudix family protein  38.96 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000504287 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2699  mutT/nudix family protein  38.96 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4504  NUDIX hydrolase  41.27 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0549022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 230 aa  49.7  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1584  mutT/nudix family protein  36.51 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0325451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3223  hypothetical protein  31.72 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2646  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0278305  normal  0.974409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3644  mutT/nudix family protein  28.07 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  49.09 
 
 		 180 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3733  mutT/nudix family protein  36.51 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2278  NUDIX hydrolase  31.68 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.369324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0808  NUDIX hydrolase  30 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.291918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2453  MutT/Nudix family protein  37.66 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0206727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2424  MutT/Nudix family protein  38.96 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.919203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1666  mutT/nudix family protein  27.27 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000030835  hitchhiker  1.00436e-21 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2742  mutT/nudix family protein  37.66 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000947125  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2736  ADP-ribose pyrophosphatase  33.87 
 
 		 300 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000235258  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4733  NUDIX hydrolase  27.97 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.580905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2691  mutT/nudix family protein  38.96 
 
 		 148 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000651612 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1208  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00522859  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2664  NUDIX hydrolase family protein  28.45 
 
 		 161 aa  47.8  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.472799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1237  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  24.37 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1694  NUDIX hydrolase  29.93 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2831  NUDIX hydrolase  31.13 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00779282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02110  NUDIX family protein  32.32 
 
 		 399 aa  47.4  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2915  hypothetical protein  34.52 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13474  normal  0.624718 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0751  mutT/nudix family protein  35.53 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2492  mutT/nudix family protein  37.66 
 
 		 148 aa  47  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802073  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0465  NUDIX hydrolase  32.35 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  31.36 
 
 		 299 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2705  mutT/nudix family protein  29.81 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  28.32 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1257  NUDIX hydrolase  37.08 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1843  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  26.14 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3934  NUDIX hydrolase  27.41 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2457  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0350138  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  35.45 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>