More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3869 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3869  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5608  triosephosphate isomerase  67.06 
 
 		 254 aa  366  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  62.7 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1568  triosephosphate isomerase  55.38 
 
 		 254 aa  285  5e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.384591  normal  0.243152 
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  53.97 
 
 		 251 aa  268  5e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6209  triosephosphate isomerase  53.56 
 
 		 242 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.74008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3504  triosephosphate isomerase  50.39 
 
 		 250 aa  255  5e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.449389  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1507  hypothetical protein  46.83 
 
 		 267 aa  251  7e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0100  triosephosphate isomerase  50.4 
 
 		 249 aa  250  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1509  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1299  triosephosphate isomerase  50 
 
 		 248 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.734425  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2874  triosephosphate isomerase  50.99 
 
 		 248 aa  248  9e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00316882  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  49.21 
 
 		 250 aa  246  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  46.22 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  45.16 
 
 		 249 aa  231  6e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2989  Triose-phosphate isomerase  47.81 
 
 		 250 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292891  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2260  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  49.8 
 
 		 646 aa  229  3e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 250 aa  229  4e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  48.8 
 
 		 248 aa  228  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0139  triosephosphate isomerase  49.6 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0241686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0134  Triose-phosphate isomerase  48.02 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1023  Triose-phosphate isomerase  45.02 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00613564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1562  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000611161  hitchhiker  0.000778836 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 251 aa  224  1e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0767  triosephosphate isomerase  46 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0303972  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07150  triosephosphate isomerase  46.61 
 
 		 256 aa  222  4e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0209504  normal  0.846197 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  46.03 
 
 		 253 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  45.63 
 
 		 252 aa  222  4e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  45.85 
 
 		 250 aa  222  6e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  46.25 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1405  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  46.59 
 
 		 650 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00167236  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  45.1 
 
 		 252 aa  219  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.8 
 
 		 655 aa  219  3.9999999999999997e-56  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  46.03 
 
 		 249 aa  218  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1639  triosephosphate isomerase  45.24 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 254 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1618  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 251 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000123397  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 256 aa  216  4e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  47.22 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1261  triosephosphate isomerase  47.41 
 
 		 251 aa  214  7e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2065  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  42.86 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  42.29 
 
 		 261 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2802  triosephosphate isomerase  43.37 
 
 		 261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000097423  hitchhiker  0.00000994621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3268  triosephosphate isomerase  45.82 
 
 		 257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0193189 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  44.72 
 
 		 255 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3680  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000293066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5197  triosephosphate isomerase  42.17 
 
 		 261 aa  212  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15810  Triose-phosphate isomerase  43.82 
 
 		 250 aa  212  4.9999999999999996e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.187277  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  47.39 
 
 		 245 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0925  triosephosphate isomerase  46.99 
 
 		 245 aa  211  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0737109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 250 aa  211  5.999999999999999e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 251 aa  212  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  41.5 
 
 		 265 aa  211  7.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1893  triosephosphate isomerase  46.22 
 
 		 248 aa  211  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0274896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2199  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.468925  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  45.45 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  44.62 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  43.2 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  44.18 
 
 		 253 aa  209  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2338  triosephosphate isomerase  43.82 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000215074  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0525  triosephosphate isomerase  45.78 
 
 		 252 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1306  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 251 aa  209  4e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  44 
 
 		 253 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 252 aa  209  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  45.42 
 
 		 248 aa  208  5e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 256 aa  208  6e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1777  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 257 aa  208  7e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.464846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  208  7e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2059  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 251 aa  208  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000160979  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  43.65 
 
 		 253 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15890  triosephosphate isomerase  41.77 
 
 		 261 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.388365  normal  0.839835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  41.27 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20010  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.627972 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0870  triosephosphate isomerase  46.83 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.695096  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01285  triosephosphate isomerase  44.94 
 
 		 251 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3008  triosephosphate isomerase  42.23 
 
 		 258 aa  207  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0301778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  43.02 
 
 		 257 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 249 aa  206  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 256 aa  206  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2981  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 260 aa  206  3e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.322057  normal  0.030919 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl504  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5701  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 251 aa  205  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000644486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1882  triosephosphate isomerase  43.43 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  41.41 
 
 		 260 aa  206  4e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5251  triosephosphate isomerase  44.05 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00148512  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>