51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3863 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3863  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  550  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.725536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5614  hypothetical protein  54.62 
 
 		 261 aa  315  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0680  hypothetical protein  37.46 
 
 		 285 aa  185  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0702  hypothetical protein  37.46 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0635237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2359  hypothetical protein  41.11 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.367222  normal  0.303498 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49545  predicted protein  35.15 
 
 		 300 aa  182  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5605  hypothetical protein  38.01 
 
 		 324 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748883 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3720  hypothetical protein  36.69 
 
 		 293 aa  178  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000274124  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0977  hypothetical protein  36.53 
 
 		 288 aa  172  5e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.32556  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6282  hypothetical protein  37.73 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000883359  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1629  nicotinamidase  30.17 
 
 		 300 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000375318  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2694  hypothetical protein  33.92 
 
 		 353 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2254  hypothetical protein  29.73 
 
 		 345 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.108398  normal  0.210374 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2210  hypothetical protein  31.6 
 
 		 348 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.22069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0304  hypothetical protein  28.77 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0347012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2409  hypothetical protein  32.18 
 
 		 340 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000136883  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1379  nicotinamidase  28.12 
 
 		 298 aa  116  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07780  nicotinamidase, putative  30.49 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1258  nicotinamidase  27.05 
 
 		 221 aa  49.7  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.423099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3207  isochorismatase hydrolase  29.19 
 
 		 203 aa  49.3  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.126521  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1744  nicotinamidase  25.98 
 
 		 216 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  39.62 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1679  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.22 
 
 		 213 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0621591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3002  nicotinamidase  25.1 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.574264  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2023  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.65 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 193 aa  46.2  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2212  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.22 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33075  NAD(+) salvage pathway gene  25.36 
 
 		 235 aa  45.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0399  isochorismatase hydrolase  35.19 
 
 		 192 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1970  nicotinamidase/pyrazinamidase  23.56 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.348861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01725  hypothetical protein  25.22 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.286926  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2683  bifunctional pyrazinamidase/nicotinamidase  25.22 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.552581  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1423  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.65 
 
 		 213 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0812351  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1874  Nicotinamidase  25.22 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00592473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01737  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.22 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.191984  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1864  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.22 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.484449  decreased coverage  0.00000347313 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1992  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.22 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.46468  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1852  nicotinamidase/pyrazinamidase  25.22 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0167185  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0678  pyrazinamidase/nicotinamidase, putative  22.55 
 
 		 170 aa  43.9  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0274495 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0859  pyrazinamidase/nicotinamidase  43.18 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0085  nicotinamidase  26.05 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  38.89 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3430  nicotinamidase  27.8 
 
 		 201 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.498347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2050  Nicotinamidase  25.88 
 
 		 179 aa  43.9  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0750856  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1444  Nicotinamidase  27.31 
 
 		 205 aa  43.5  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0368636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2489  nicotinamidase/pyrazinamidase  24.78 
 
 		 213 aa  42.7  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.443134 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0851  nicotinamidase  29.23 
 
 		 198 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.908349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0822  Nicotinamidase  32 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0359505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1643  nicotinamidase  27.09 
 
 		 208 aa  42.4  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.721224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3227  nicotinamidase  29.46 
 
 		 210 aa  42.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108495  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  35.85 
 
 		 201 aa  42  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>