More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3817 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5632  aspartate kinase  75.85 
 
 		 441 aa  697    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000704481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3817  aspartate kinase  100 
 
 		 452 aa  929    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00114248  normal  0.367639 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3721  aspartate kinase  60.76 
 
 		 444 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.14309  normal  0.63585 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2333  aspartate kinase  57.5 
 
 		 437 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.299294  normal  0.136558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6874  aspartate kinase  53.76 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.52096 
 
 
-
 
NC_002950  PG2189  aspartate kinase  49.09 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03711  aspartate kinase III  36.2 
 
 		 450 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002356  aspartokinase  35.98 
 
 		 450 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2809  aspartate kinase III  36.28 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2177  aspartate kinase III  36.42 
 
 		 471 aa  268  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2583  aspartate kinase III  35.53 
 
 		 471 aa  266  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.270055  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2023  aspartate kinase III  36.11 
 
 		 471 aa  262  6.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2445  aspartate kinase III  36.03 
 
 		 471 aa  259  6e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.805892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2060  aspartate kinase III  35.16 
 
 		 471 aa  256  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.913174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2818  aspartate kinase III  34.82 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0817  aspartate kinase III  34.82 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.784951  hitchhiker  0.0000472432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2419  aspartate kinase III  36.02 
 
 		 471 aa  243  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2491  aspartate kinase III  35.5 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0680  aspartate kinase III  36.12 
 
 		 451 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0462  aspartate kinase III  33.7 
 
 		 455 aa  238  1e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2982  aspartate kinase III  34.8 
 
 		 449 aa  236  8e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3717  aspartate kinase III  34.38 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345443  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3986  aspartate kinase III  34.73 
 
 		 451 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0653  aspartate kinase III  34.29 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.515096  normal  0.20632 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3369  aspartate kinase III  34.29 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000680196  hitchhiker  0.00822859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0652  aspartate kinase III  34.29 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000108783  normal  0.0665157 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0372  aspartate kinase III  33.33 
 
 		 454 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3658  aspartate kinase III  34.59 
 
 		 451 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.492894  hitchhiker  0.000000794712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0788  aspartate kinase III  34.15 
 
 		 451 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.214158  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3840  aspartate kinase III  34.07 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.135381  hitchhiker  0.000112136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0301  aspartate kinase III  33.26 
 
 		 461 aa  229  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131687  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0735  aspartate kinase III  34.66 
 
 		 456 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000266355  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3764  aspartate kinase III  35.4 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226925  hitchhiker  0.00174261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0372  aspartate kinase III  33.04 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0603  aspartate kinase III  34.88 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.151789 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3919  aspartate kinase III  32.82 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.78738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3947  aspartate kinase III  31.79 
 
 		 458 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00605304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0535  aspartate kinase III  34.96 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4479  aspartate kinase III  32.44 
 
 		 455 aa  226  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.829602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3769  aspartate kinase III  31.79 
 
 		 458 aa  226  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0346162  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47956  predicted protein  33.19 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0229  aspartate kinase III  33.04 
 
 		 449 aa  223  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0205463  normal  0.315879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0779  aspartate kinase III  34.6 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705118  hitchhiker  0.0010565 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1482  aspartate kinase III  32.08 
 
 		 469 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.216774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2004  aspartate kinase III  31.74 
 
 		 456 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25490  aspartate kinase  35.24 
 
 		 450 aa  216  7e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03418  aspartate kinase III  31.09 
 
 		 449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000466048  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3804  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.06 
 
 		 815 aa  210  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2222  aspartate kinase  29.19 
 
 		 823 aa  209  9e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07425  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  31.01 
 
 		 814 aa  208  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148859  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4411  aspartate kinase III  31.87 
 
 		 449 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.135104  normal  0.165896 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03896  aspartate kinase III  32.02 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3973  aspartate kinase  32.02 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03856  hypothetical protein  32.02 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4477  aspartate kinase III  31.87 
 
 		 449 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4614  aspartate kinase III  31.87 
 
 		 449 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.476812 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5502  aspartate kinase III  32.02 
 
 		 449 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4562  aspartate kinase III  31.87 
 
 		 449 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.446451  normal  0.379136 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4562  aspartate kinase III  31.87 
 
 		 449 aa  206  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.518118 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4529  aspartate kinase III  32.02 
 
 		 449 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4514  aspartate kinase  32.05 
 
 		 818 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4485  aspartate kinase III  32.02 
 
 		 449 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0073  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.98 
 
 		 817 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4572  aspartate kinase III  32.02 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4263  aspartate kinase III  32.02 
 
 		 449 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_44504  predicted protein  32.03 
 
 		 463 aa  203  5e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2575  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.43 
 
 		 815 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4006  aspartate kinase III  31.8 
 
 		 449 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.193511 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0676  aspartate kinase  31.05 
 
 		 468 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3425  aspartate kinase III  31.37 
 
 		 452 aa  196  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000055532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3054  aspartate kinase  30.62 
 
 		 465 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0259  aspartate kinase  31.62 
 
 		 468 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.889739  hitchhiker  0.00874182 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1642  aspartate kinase  31.62 
 
 		 468 aa  191  2e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0577  aspartate kinase  31.2 
 
 		 468 aa  189  1e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.798745  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00814  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.39 
 
 		 835 aa  187  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661327  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1358  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.85 
 
 		 835 aa  186  6e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.82 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0437927  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.82 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.82 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.82 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186418  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3594  aspartate kinase  30.9 
 
 		 820 aa  183  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4508  aspartate kinase  31.55 
 
 		 478 aa  183  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.995886  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6475  aspartate kinase  29.07 
 
 		 446 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.82 
 
 		 820 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00002  bifunctional aspartokinase I/homoserine dehydrogenase I  30.9 
 
 		 820 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.843244  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.9 
 
 		 820 aa  183  6e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.880494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3653  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.9 
 
 		 820 aa  183  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00002  hypothetical protein  30.9 
 
 		 820 aa  183  6e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.964701  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00939  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.09 
 
 		 819 aa  183  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.9 
 
 		 820 aa  183  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.761608  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0001  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.9 
 
 		 820 aa  183  6e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1749  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.35 
 
 		 834 aa  183  7e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  0.135742 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0002  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.9 
 
 		 820 aa  183  7e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5429  aspartate kinase  29.75 
 
 		 815 aa  182  9.000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.788208  normal  0.56505 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004457  aspartokinase/homoserine dehydrogenase  28.39 
 
 		 819 aa  182  2e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1275  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  29.24 
 
 		 820 aa  181  2.9999999999999997e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1943  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  28.48 
 
 		 819 aa  180  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0938577  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0222  aspartate kinase  29.85 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.774613  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0003  bifunctional aspartokinase I/homeserine dehydrogenase I  30.74 
 
 		 818 aa  179  8e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0346  aspartate kinase  30.59 
 
 		 465 aa  179  9e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>