20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3804 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3804  hypothetical protein  100 
 
 		 538 aa  1087    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.387517  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0010  hypothetical protein  29.23 
 
 		 542 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3301  hypothetical protein  41.28 
 
 		 586 aa  180  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0509  hypothetical protein  28.05 
 
 		 547 aa  178  2e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01725  hypothetical protein  28.47 
 
 		 537 aa  166  6.9999999999999995e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0332705  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0895  hypothetical protein  37.2 
 
 		 491 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.686581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3504  hypothetical protein  25.5 
 
 		 518 aa  146  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0130458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0216  hypothetical protein  40.67 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1499  hypothetical protein  40.67 
 
 		 271 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0663  hypothetical protein  26.5 
 
 		 562 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0081  hypothetical protein  28.24 
 
 		 725 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0462  hypothetical protein  27.38 
 
 		 555 aa  104  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0329  hypothetical protein  25.55 
 
 		 372 aa  91.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0179467  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2021  hypothetical protein  26.29 
 
 		 380 aa  89.7  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0664622 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1809  hypothetical protein  26.01 
 
 		 376 aa  90.1  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.895599  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2190  hypothetical protein  27.7 
 
 		 348 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0219  hypothetical protein  26.07 
 
 		 569 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2378  hypothetical protein  26.09 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0217  hypothetical protein  26.18 
 
 		 286 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2247  hypothetical protein  25.31 
 
 		 570 aa  74.7  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>