More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3774 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  100 
 
 
446 aa  909  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  47.88 
 
 
475 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  33.94 
 
 
412 aa  264  2e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  32.41 
 
 
419 aa  229  1e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  33.04 
 
 
417 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  32.25 
 
 
418 aa  184  4e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  29.64 
 
 
431 aa  175  1e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  28.34 
 
 
407 aa  172  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  31.63 
 
 
422 aa  172  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  32.54 
 
 
429 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  27.62 
 
 
394 aa  148  2e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  23.86 
 
 
436 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  25.78 
 
 
400 aa  119  1e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  2.40238e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  27.75 
 
 
516 aa  116  1e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  3.8172e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  26.39 
 
 
503 aa  112  2e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  26.62 
 
 
495 aa  111  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  25.65 
 
 
503 aa  108  2e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.55 
 
 
455 aa  104  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  26.6 
 
 
465 aa  103  7e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  25.23 
 
 
440 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.11 
 
 
374 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.67566e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  31.3 
 
 
376 aa  91.7  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.73675e-08  hitchhiker  4.27958e-09 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  31.02 
 
 
456 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  31.02 
 
 
456 aa  90.5  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  31.02 
 
 
456 aa  90.5  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  28.05 
 
 
490 aa  88.2  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  27.37 
 
 
424 aa  86.7  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  27.03 
 
 
428 aa  85.5  2e-15  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  27.41 
 
 
433 aa  85.1  2e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  27.21 
 
 
377 aa  85.5  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.49 
 
 
441 aa  84.3  4e-15  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  24.48 
 
 
428 aa  83.6  6e-15  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1037  Peptidase M23  26.7 
 
 
477 aa  84  6e-15  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.501943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  40.8 
 
 
305 aa  82.4  1e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  6.81555e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  35.43 
 
 
404 aa  82.8  1e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  31.88 
 
 
375 aa  82  2e-14  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  1.52343e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  37.4 
 
 
372 aa  82  2e-14  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  23.06 
 
 
387 aa  82  2e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  23.42 
 
 
434 aa  80.9  4e-14  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  31.25 
 
 
379 aa  80.5  6e-14  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  24.46 
 
 
374 aa  80.5  6e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2736  peptidase family protein  29.74 
 
 
382 aa  79  2e-13  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0304965  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1211  Fis family transcriptional regulator  32.34 
 
 
382 aa  78.6  2e-13  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  23.24 
 
 
394 aa  78.2  3e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  30.77 
 
 
397 aa  77.4  5e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  26.24 
 
 
438 aa  77  6e-13  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  26.5 
 
 
438 aa  76.6  8e-13  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  27.37 
 
 
397 aa  76.6  9e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  26.27 
 
 
438 aa  75.9  1e-12  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  23.46 
 
 
391 aa  75.9  1e-12  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  26.33 
 
 
416 aa  74.7  3e-12  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  26.77 
 
 
375 aa  74.3  4e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.19165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002242  membrane-bound metallopeptidase  35.43 
 
 
375 aa  74.3  4e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1379  Peptidase M23  30.4 
 
 
420 aa  73.6  6e-12  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  31.86 
 
 
370 aa  73.6  6e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  26.75 
 
 
404 aa  73.6  7e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  5.21707e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1120  peptidase M23B  26.36 
 
 
398 aa  72.8  1e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  30.46 
 
 
397 aa  72.8  1e-11  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1443  hypothetical protein  26.33 
 
 
410 aa  72.8  1e-11  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2804  putative exported peptidase  31.35 
 
 
381 aa  71.6  2e-11  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.15 
 
 
398 aa  72.4  2e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  1.18753e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  26.14 
 
 
426 aa  72  2e-11  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  28.64 
 
 
379 aa  72  2e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  31.85 
 
 
271 aa  71.6  3e-11  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  32.58 
 
 
411 aa  70.9  5e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  23.96 
 
 
378 aa  70.5  6e-11  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  22.17 
 
 
396 aa  70.1  7e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.44038e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3985  hypothetical protein  22.5 
 
 
427 aa  70.1  8e-11  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.910741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  32.12 
 
 
373 aa  69.7  9e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  27.41 
 
 
388 aa  69.7  9e-11  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  32.45 
 
 
248 aa  69.7  9e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  34.56 
 
 
379 aa  69.7  9e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  31.08 
 
 
372 aa  69.7  1e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3287  Peptidase M23  31.16 
 
 
405 aa  69.7  1e-10  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  31.01 
 
 
509 aa  69.3  1e-10  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3167  peptidase M23B  30.15 
 
 
366 aa  68.9  2e-10  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.413148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  31.08 
 
 
372 aa  68.9  2e-10  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  24.19 
 
 
420 aa  68.9  2e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3904  hypothetical protein  22.27 
 
 
427 aa  67.8  3e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3923  hypothetical protein  22.27 
 
 
427 aa  68.2  3e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1882  membrane protein associated metalloendopeptidase  33.33 
 
 
430 aa  67.8  4e-10  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4091  hypothetical protein  22.27 
 
 
427 aa  67.8  4e-10  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  24.57 
 
 
433 aa  67.8  4e-10  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  31.54 
 
 
458 aa  67.8  4e-10  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  25.13 
 
 
387 aa  67  6e-10  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  33.33 
 
 
274 aa  67  6e-10  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2161  peptidase M23  33.07 
 
 
436 aa  67  7e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00288344  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2253  hypothetical protein  33.07 
 
 
436 aa  67  7e-10  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.945563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0097  peptidase M23B  29.66 
 
 
291 aa  66.6  9e-10  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  31.88 
 
 
324 aa  66.6  9e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  29.45 
 
 
475 aa  66.6  9e-10  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.38116e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0303  Peptidase M23  29.01 
 
 
432 aa  66.2  1e-09  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00113075 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0849  peptidase M23B  34.62 
 
 
251 aa  65.9  1e-09  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0416055  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0268  M23 peptidase domain protein  32.26 
 
 
417 aa  66.2  1e-09  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.171768  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  28.76 
 
 
304 aa  66.2  1e-09  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  23.98 
 
 
382 aa  65.9  1e-09  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.88 
 
 
430 aa  65.5  2e-09  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  4.6431e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  37.39 
 
 
465 aa  65.1  2e-09  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  29.77 
 
 
319 aa  64.7  3e-09  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2504  Peptidase M23  35.42 
 
 
290 aa  64.3  4e-09  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.241623  normal  0.0435896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>