More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3740 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3740  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
215 aa  428  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  63.43 
 
 
216 aa  283  1.0000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3274  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.87 
 
 
216 aa  228  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  49.52 
 
 
215 aa  197  7e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6513  protein of unknown function DUF205  51.94 
 
 
217 aa  193  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00773794  normal  0.103654 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  39.06 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  39.65 
 
 
235 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1269  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.27 
 
 
231 aa  148  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.747048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  38.43 
 
 
235 aa  148  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2816  membrane protein  38.89 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  37.77 
 
 
235 aa  145  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2417  membrane protein  38.3 
 
 
235 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  41.46 
 
 
207 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2025  membrane protein  37.44 
 
 
234 aa  137  8.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.83 
 
 
198 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.54 
 
 
198 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.54 
 
 
198 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.54 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.54 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.54 
 
 
198 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.05 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.05 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.32 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.32 
 
 
198 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.05 
 
 
198 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  37.69 
 
 
195 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.69 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.84 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  39.39 
 
 
195 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  39.81 
 
 
219 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1155  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  39.8 
 
 
212 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.327408  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2579  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.91 
 
 
197 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  37.75 
 
 
202 aa  124  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3050  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.52 
 
 
228 aa  124  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.0650966 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  38.92 
 
 
195 aa  122  3e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0417  hypothetical protein  39.61 
 
 
210 aa  122  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.032273  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  38.58 
 
 
198 aa  122  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  38.58 
 
 
198 aa  122  5e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  37.5 
 
 
190 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  37.5 
 
 
190 aa  121  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  38.38 
 
 
203 aa  121  8e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  40.28 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.41 
 
 
215 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3380  membrane protein  40.91 
 
 
195 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000102812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  37.31 
 
 
194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0781  membrane protein  41.41 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000234105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  37.37 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2130  protein of unknown function DUF205  35.87 
 
 
212 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.183332  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  37.76 
 
 
194 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  38.58 
 
 
193 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0632  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.61 
 
 
213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  38.27 
 
 
193 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  35.5 
 
 
200 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  33.99 
 
 
202 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  33.99 
 
 
202 aa  118  7.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  38.16 
 
 
198 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  38.92 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  37.11 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  38.81 
 
 
205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0247  protein of unknown function DUF205  37.75 
 
 
222 aa  115  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.491401 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  38.42 
 
 
197 aa  114  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0924  membrane protein  38.05 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.41 
 
 
194 aa  114  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3668  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.148826  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  39.13 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  37.44 
 
 
197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0998  hypothetical protein  37.86 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1023  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.14 
 
 
219 aa  112  5e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0416412  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1616  hypothetical protein  35.75 
 
 
202 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2903  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.81 
 
 
203 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000317667  normal  0.0212872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2985  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.81 
 
 
203 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000527205  normal  0.538474 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1064  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  43.54 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000173529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1109  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.28 
 
 
203 aa  111  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000633116  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1290  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.58 
 
 
203 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  33.19 
 
 
216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3082  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.81 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000753996  hitchhiker  0.0000265088 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2389  hypothetical protein  34.65 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000658646  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.76 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  32.75 
 
 
216 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  35.86 
 
 
192 aa  109  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  37.95 
 
 
210 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  32.75 
 
 
216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1001  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.2 
 
 
203 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0144207  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  33.5 
 
 
200 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  35.61 
 
 
198 aa  108  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.75 
 
 
192 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  33.33 
 
 
214 aa  108  6e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  36.07 
 
 
220 aa  108  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.84 
 
 
211 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1158  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.85 
 
 
202 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000140033  normal  0.0384563 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1111  hypothetical protein  34.58 
 
 
212 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.41 
 
 
203 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  36.81 
 
 
200 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3570  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.64 
 
 
211 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0795951  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  36.18 
 
 
198 aa  107  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  34.47 
 
 
201 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0793  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.76 
 
 
213 aa  106  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5145  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.85 
 
 
189 aa  106  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1955  membrane protein  37.96 
 
 
219 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0878963  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0027  membrane protein  37.93 
 
 
195 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>