More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3693 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  100 
 
 
230 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  39.47 
 
 
239 aa  165  6e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  40.77 
 
 
232 aa  158  7e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  36.73 
 
 
226 aa  155  5e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  35.04 
 
 
246 aa  150  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  38.6 
 
 
269 aa  145  7e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.45 
 
 
206 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  29.91 
 
 
226 aa  129  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  33.79 
 
 
232 aa  128  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  32.11 
 
 
236 aa  125  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  32.22 
 
 
271 aa  120  2e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  30.84 
 
 
230 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  30.22 
 
 
229 aa  119  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0336  phosphoribosyltransferase  34.65 
 
 
230 aa  119  4e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  31.95 
 
 
270 aa  118  8e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
231 aa  115  4e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  30 
 
 
245 aa  114  1e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  29.46 
 
 
230 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  33.2 
 
 
245 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  2.43751e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  31.51 
 
 
242 aa  111  1e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 
272 aa  110  2e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  109  4e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  31.67 
 
 
230 aa  109  4e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  7.15358e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  31.56 
 
 
238 aa  108  7e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
217 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  32.02 
 
 
217 aa  108  8e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0226  competence protein  30.95 
 
 
236 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  30.54 
 
 
267 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  33.19 
 
 
221 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 
254 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.67 
 
 
238 aa  104  9e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.02342e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  33.19 
 
 
215 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  34.42 
 
 
247 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  31.2 
 
 
223 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  2.98653e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.88 
 
 
207 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  33.76 
 
 
237 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  35.06 
 
 
219 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  36 
 
 
251 aa  102  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  31.82 
 
 
269 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  30.08 
 
 
243 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  31.5 
 
 
258 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  36.09 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  1.70778e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  31.93 
 
 
229 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 
245 aa  100  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  34.58 
 
 
233 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0218  competence protein,-like protein  28.39 
 
 
273 aa  99.8  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0828937  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  35.8 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  1.15929e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  31.28 
 
 
228 aa  99  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  30.52 
 
 
243 aa  98.2  8e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  33.33 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  29.03 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  33.12 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  32.63 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  28.11 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  31.3 
 
 
262 aa  95.9  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  37.5 
 
 
255 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  31.49 
 
 
264 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0601  phosphoribosyltransferase  31.34 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0317  gluconate periplasmic binding protein  40.35 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  31.94 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4012  competence protein ComF  31.48 
 
 
249 aa  93.2  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1405  competence protein F  33.76 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.509153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  31.98 
 
 
255 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  28.11 
 
 
249 aa  92.8  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  29.03 
 
 
255 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  27.6 
 
 
243 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2296  hypothetical protein  34.84 
 
 
241 aa  92  6e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.658532  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  30.77 
 
 
246 aa  92.4  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 
237 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  2.95242e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  29.63 
 
 
255 aa  91.7  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  31.53 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  32.43 
 
 
239 aa  91.3  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  39.42 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  28.75 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 
220 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  7.9712e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0572  ComF family protein  27.1 
 
 
204 aa  90.1  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2971  phosphoribosyltransferase  31.38 
 
 
268 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.566762 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  28.04 
 
 
233 aa  89  5e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  26.54 
 
 
234 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  28.82 
 
 
232 aa  88.6  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  26.54 
 
 
234 aa  88.6  8e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  26.7 
 
 
243 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  30.13 
 
 
237 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  30.13 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  28.5 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  29.65 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0177  competence protein ComF  29.03 
 
 
266 aa  87  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4231  amidophosphoribosyltransferases-like  29.26 
 
 
240 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  27.94 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  30.95 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  2.28235e-09  hitchhiker  2.30998e-07 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  27.54 
 
 
230 aa  87  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  30.29 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  27.8 
 
 
258 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  32.04 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  28 
 
 
246 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  30.9 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1028  competence protein F, putative  29.92 
 
 
262 aa  86.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3818  gluconate periplasmic binding protein  27.75 
 
 
227 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>