More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3537 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3537  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.878481 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1607  ABC transporter related  42.58 
 
 		 269 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000477386 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0168  hemin importer ATP-binding subunit  41.92 
 
 		 262 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1564  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 259 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575357  normal  0.641346 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2348  hemin importer ATP-binding subunit  40.78 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00837343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7222  ABC transporter related  40.45 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  41.09 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  40.6 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  40.39 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0126  hemin importer ATP-binding subunit  43.28 
 
 		 277 aa  188  7e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.27999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3809  hemin importer ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0346315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4866  hemin importer ATP-binding subunit  38.52 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.578744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  39.61 
 
 		 255 aa  185  7e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2832  hemin importer ATP-binding subunit  42.62 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  39.22 
 
 		 255 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  40.78 
 
 		 255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1967  hemin importer ATP-binding subunit  38.85 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4010  hemin importer ATP-binding subunit  38.82 
 
 		 254 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.240186 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  41.63 
 
 		 255 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2322  hemin importer ATP-binding subunit  40.07 
 
 		 269 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0161777  normal  0.765117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  38.43 
 
 		 255 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3675  hemin importer ATP-binding subunit  40.78 
 
 		 272 aa  178  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  38.46 
 
 		 418 aa  177  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3308  ABC transporter related  38.89 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.069398  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3618  hemin importer ATP-binding subunit  33.59 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.740254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2136  hemin importer ATP-binding subunit  39.13 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.740786  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0646  hemin importer ATP-binding subunit  41.32 
 
 		 266 aa  175  8e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.370261 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3893  hemin importer ATP-binding subunit  41.32 
 
 		 266 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3805  hemin importer ATP-binding subunit  41.32 
 
 		 266 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2409  hemin importer ATP-binding subunit  38.85 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.128742  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  38.04 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  36.72 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3241  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  38.26 
 
 		 262 aa  172  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2341  hemin importer ATP-binding subunit  37.4 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0724766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 255 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1444  hemin importer ATP-binding subunit  38.17 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3476  ABC transporter related  37.07 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1212  hemin importer ATP-binding subunit  41.6 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1752  ABC transporter related protein  35.55 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0105422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0180  ABC transporter related  38.96 
 
 		 260 aa  169  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.425432  normal  0.0680318 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2761  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.503989  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3564  ABC transporter related  42.28 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2780  ABC transporter related  38.1 
 
 		 274 aa  169  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3252  ABC transporter related  41.42 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000102185  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3333  hemin importer ATP-binding subunit  38.06 
 
 		 268 aa  168  7e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0180  ABC transporter related  39.31 
 
 		 258 aa  168  7e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2764  hemin importer ATP-binding subunit  43.17 
 
 		 265 aa  168  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2462  hemin importer ATP-binding subunit  39.29 
 
 		 265 aa  168  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.902212  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5378  hemin importer ATP-binding subunit  37.35 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1494  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems ATPase components  38.68 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0815348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2365  ABC transporter related  35.29 
 
 		 455 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0946  hemin importer ATP-binding subunit  40.85 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1048  hemin importer ATP-binding subunit  40.25 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.540282 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0703  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0576418  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  37.89 
 
 		 409 aa  166  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0571  hemin importer ATP-binding subunit  37.93 
 
 		 260 aa  165  8e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3272  hemin importer ATP-binding subunit  37.41 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00219245 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0249  ABC transporter related  35.66 
 
 		 252 aa  165  9e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2830  ABC transporter-like  36.58 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.652667  normal  0.515297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1737  hemin importer ATP-binding subunit  37.7 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.183409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3344  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 290 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.559601  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  34.24 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1756  hemin importer ATP-binding subunit  40.61 
 
 		 260 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00991527  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2143  hemin importer ATP-binding subunit  38.67 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4079  ABC transporter related  37.55 
 
 		 268 aa  163  3e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.465594  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0754  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 		 265 aa  162  4.0000000000000004e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0648275  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1015  hemin importer ATP-binding subunit  40 
 
 		 288 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  40 
 
 		 536 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2122  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.19567  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  37.05 
 
 		 260 aa  162  6e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0322  hemin importer ATP-binding subunit  35.83 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00006173  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  37.04 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  36.25 
 
 		 405 aa  162  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3576  ABC transporter related  37.98 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0297567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0217  hemin importer ATP-binding subunit  38.52 
 
 		 273 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  37.97 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2165  hemin importer ATP-binding subunit  42.34 
 
 		 261 aa  161  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.203707  normal  0.489491 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  40.16 
 
 		 490 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4373  ABC transporter related  38.43 
 
 		 271 aa  159  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0187  ABC transporter related  34.73 
 
 		 275 aa  159  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.184625  normal  0.796471 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3914  ABC transporter related  38.11 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.291945  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3528  ABC transporter related  38.59 
 
 		 444 aa  159  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1176  iron ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1010  ABC transporter related  32.95 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3581  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ferrichrome)  35.98 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1872  iron(III) dicitrate transport ATP-binding protein  38.27 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.345427  normal  0.281065 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3334  hemin importer ATP-binding subunit  37.86 
 
 		 280 aa  159  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319448  hitchhiker  0.00127806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3021  hemin importer ATP-binding subunit  35.61 
 
 		 264 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.65849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  38.04 
 
 		 266 aa  158  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0486  ABC transporter related  36.58 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281839 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2232  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.24 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.13376  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  33.07 
 
 		 266 aa  158  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0750  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>