36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3472 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3472  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  913    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0090694  normal  0.166385 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5669  hypothetical protein  64.25 
 
 		 436 aa  608  1e-173  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2208  hypothetical protein  46.11 
 
 		 470 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0167503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0293  hypothetical protein  45.31 
 
 		 404 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0247634  hitchhiker  0.00128473 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1639  hypothetical protein  38.5 
 
 		 464 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.347688  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01290  hypothetical protein  38.7 
 
 		 458 aa  283  4.0000000000000003e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0524  hypothetical protein  38.32 
 
 		 402 aa  248  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.140722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0226  hypothetical protein  36.44 
 
 		 417 aa  206  5e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.567411  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2416  hypothetical protein  32.19 
 
 		 409 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.039677  normal  0.33337 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0800  hypothetical protein  34.82 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.523609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0852  hypothetical protein  35.01 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0845  hypothetical protein  34.17 
 
 		 394 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.609913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0848  hypothetical protein  34.72 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3986  hypothetical protein  29.21 
 
 		 417 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74759  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1591  hypothetical protein  31.62 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1421  conserved hypothetical protein, membrane  35.81 
 
 		 253 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000100005  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3930  hypothetical protein  28.68 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0681798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3382  hypothetical protein  28.53 
 
 		 411 aa  122  9e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.725263  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1467  hypothetical protein  31.64 
 
 		 414 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.800329 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4144  hypothetical protein  31.99 
 
 		 414 aa  119  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2709  hypothetical protein  29.14 
 
 		 400 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.227296 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2999  hypothetical protein  28.78 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1242  hypothetical protein  25 
 
 		 392 aa  90.9  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2554  hypothetical protein  27.4 
 
 		 346 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.990789  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4432  signal peptide and transmembrane prediction  30.98 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.181697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0831  hypothetical protein  27.17 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.136835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0104  hypothetical protein  28.65 
 
 		 358 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00147272 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0123  hypothetical protein  27.54 
 
 		 358 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1812  polysulphide reductase, NrfD  22.91 
 
 		 456 aa  54.3  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  28.83 
 
 		 472 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5951  hypothetical protein  25 
 
 		 345 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0834  Polysulphide reductase NrfD  25.98 
 
 		 448 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.352451 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2552  molybdopterin oxidoreductase  25.42 
 
 		 430 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0223  Polysulphide reductase NrfD  25.71 
 
 		 484 aa  44.7  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1239  polysulphide reductase, NrfD  25.67 
 
 		 454 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.39739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0105  Polysulphide reductase NrfD  27.52 
 
 		 624 aa  43.1  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267927 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>