More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3420 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  100 
 
 		 463 aa  947    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  45.18 
 
 		 494 aa  390  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  46.39 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  37.53 
 
 		 481 aa  249  6e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  32.47 
 
 		 485 aa  214  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  33.86 
 
 		 490 aa  204  3e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  33.51 
 
 		 492 aa  177  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  31.22 
 
 		 406 aa  173  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  28.94 
 
 		 460 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  30.13 
 
 		 450 aa  143  7e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  28.94 
 
 		 518 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  28.78 
 
 		 496 aa  118  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  31.02 
 
 		 527 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  25 
 
 		 530 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  27.51 
 
 		 530 aa  91.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  26.93 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  25.59 
 
 		 440 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  24.59 
 
 		 488 aa  86.7  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  29.14 
 
 		 401 aa  85.1  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  24.83 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  27.15 
 
 		 402 aa  79.7  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  27.15 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  26.27 
 
 		 530 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  27.01 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  26.86 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  30.5 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  25.66 
 
 		 507 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  23.61 
 
 		 529 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  26.32 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3111  carboxyl-terminal protease  23.56 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000358486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  23.02 
 
 		 566 aa  70.5  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0184  carboxyl-terminal protease  25.26 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  28.77 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  25.44 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  26.83 
 
 		 554 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  28.04 
 
 		 444 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1693  carboxyl-terminal protease  25.52 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 401 aa  65.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  24.32 
 
 		 434 aa  66.6  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 		 506 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  26.07 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3264  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  29 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  26.09 
 
 		 438 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 434 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  26.67 
 
 		 427 aa  64.3  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  23.87 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  25.65 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  25.28 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.58 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  28.21 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  27.57 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2072  carboxyl-terminal protease  24.83 
 
 		 453 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.323536 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  27.67 
 
 		 482 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0362  carboxyl- protease  25.82 
 
 		 475 aa  62.8  0.00000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.151811  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0047  carboxyl-terminal protease, putative  26.55 
 
 		 402 aa  62.4  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  25.17 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  26.75 
 
 		 440 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  27.6 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  23.63 
 
 		 560 aa  62  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  27.91 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  23 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  26.21 
 
 		 440 aa  61.6  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 469 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  27.24 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4394  carboxyl-terminal protease  26.82 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  26.6 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  26.86 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.86 
 
 		 429 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  25 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1049  carboxyl-terminal protease  26.64 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000950158  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 		 428 aa  60.1  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  25.94 
 
 		 468 aa  60.1  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  26.58 
 
 		 505 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  25.61 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0041  C-terminal processing peptidase-3  25.54 
 
 		 401 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.660161  hitchhiker  0.00325128 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4739  carboxyl-terminal protease  28.71 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 		 383 aa  58.9  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  25.26 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  26.43 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  24.48 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  23.26 
 
 		 710 aa  58.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  23.59 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  25.5 
 
 		 557 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0045  carboxyl-terminal protease  27.14 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000144504 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  26.92 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  23.86 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>